Allele information - yeps_YPTB2644 (ccmF): 29

Provenance/meta data

locus
yeps_YPTB2644 (ccmF)
allele
29
sequence
ATGATGCCCG AAATTGGCAG TTTTTTATTA TGTTTGGCGT TGGCGATTTC ATTGCTGCTG AGTCTGTATC CGCAATGGGG GGCCGCTCGT CAGGATGCCC GTATGATGGC GGTTGGCAGG CCACTGACTT ATGGTATGTT TGCCGCGATC ACGTTGTCAT TTATCTGTCT GATATATGCA TTTGTGGTAA ATGATTTTAC CGTCTCCTCT GTTGCGGCGA ATTCCAACTC ATATTTGCCG ATTTATTACC GTATTGCCGC GAGTTGGGGA GCGCACGAAG GCTCCTTATT ATTATGGGTA TTGCTGCTCA GTTGTTGGTC ATTGGCGGTG GCGCTGTTTA GCCGTTCGAT GCCGGAGGAT GCGGTGGCGC GGGTGCTATC CGTGCTGGGA ATGATTACCG GCGGTTTTCT GCTATTTATT ATTCTGACGT CTAACCCGTT CTCTCGCACA TTACCTGATT TTCCTATTGA TGGCCGCGAT CTGAACCCGC TACTACAAGA TGTTGGGTTG ATTTTCCATC CCCCGCTGCT CTACATGGGG TATGTCGGTT TCTCCGTCGC GTTTGCTTTT GCAATTGCAT CATTAATGGC CGGTAGGCTC GACAGTGCCT GGGCGCGTTG GTCACGTCCA TGGACTCAGG CCGCATGGGT TTTCCTAACG CTTGGCATCG TACTTGGCTC AGCGTGGGCT TATTATGAAT TGGGGTGGGG CGGCTGGTGG TTCTGGGACC CGGTCGAAAA TGCCTCCTTT ATGCCGTGGC TGGCCGGTAC CGCACTGATT CACTCACTGG CTGTCACGGA GAAGCGCGGT ACTTTCAAAG CGTGGACGGT ATTGTTGGCG ATCACCGCTT TCTCCTTGTG TTTGATGGGG ACATTCTTAG TCCGCTCAGG CGTGCTGGTT TCGGTGCACT CCTTTGCCTC TGATCCGGCC CGTGGCATGT TTATTCTTGC CTATCTGGTG ATTGTGATTG GCGGTTCCCT GCTGTTGTAT GCGGTAAAAG GTGCGCAGGT GCGCGGCCAG ACTCAGCATG AAGTATTTTC CCGCGAGACC TTCCTGCTCG GCAACAATGT GTTGCTTATT GCCGCAATGC TAGTGGTACT ACTGGGAACA TTACTGCCGT TGGTTCACAA ACAGTTAGGG CTGGGCAGTA TCTCCATTGG CGAACCGTTC TTTAATACGA TGTTCACCTG GCTAATGGCC CCGATGGCAT TACTTATGGG AATAGGGCCG CTTGTGCGTT GGCGCCGTGA TGAAGCGAGC AAACTGTGGA AGCGGTTGAG TGTGGCTCTG GTGGTCACTC TGCTGTTATC GATATCCGTA CCGTGGCTGC TGCAAGATAG TGTTGCCGGT ATGACGGTCG TCGGGTTGAT GATGGCCATT TGGGTGATCA TCCTGACATT AATGGAATTG CACGAACGGG CCACCCATCG TTATGGCTTC TGGCGTGGGT TGACTCACCT TTCCCGTAGC CACTGGGGCA TGGTGTTGGG GCATCTCGGG GTGGCGGTTA CGGTAATTGG GATTGCGTTT AGCCAGAATT ACAGTGTCGA ACGCGATGTG CGCATGAAGG CTGGTGATAG TATCAATATC CATGATTATC ACTTCACTTT TCGCGATGTC CACGATATCA AAGGGCCTAA CTATACCGGC GGCGTTGGCA TTATTGATGT CACCCGTAAT GGTAAATTGG AGGCCACACT ACATGCAGAA AAACGCTATT ACAGTGTCGC CCGCTCAATG ATGACTGAAG CGGCCATTGA TGGGGGGCTG ACCCGCGATC TTTATGCCGC CTTGGGTGAA GAGTTGGGTG ATGGTTCGTG GGCGGTCCGC TTGTATTACA AACCTTTTGT GCGTTGGATA TGGTTTGGCG GGGTCTTTAT GGCCGTTGGT GGCATCTTCT GTATGCTCGA TCCGCGCTAT CGGATGAGTA AAAAGCTAAA ACGCAGTGCG ATACCGGAGG CAGAGTCATG A
length
1971
status
WGS: automated extract (BIGSdb)
date entered
2016-07-15
datestamp
2016-07-15
sender
Cyril Savin
curator
Cyril Savin, Institut Pasteur, Paris

Profiles containing this allele

Y.pseudotuberculosis cgMLST

Isolate databases

Yersinia isolates
pubmlst_yersinia_isolates