Profile information for cgST-3 (cgMLST)

cgST
3
SE2419 (rpmH)
1
SE0002 (SE0002)
1
x_1
2
SE0003 (recF)
1
SE0004 (SE0004)
2
SE0007 (SE0007)
10
SE0010 (SE0010)
9
SE0014 (rplI)
2
SE0022 (SE0022)
11
SE0156 (SE0156)
10
SE0183 (SE0183)
9
SE0197 (SE0197)
8
SE0210 (SE0210)
8
SE0216 (SE0216)
13
SE0219 (SE0219)
10
SE0224 (SE0224)
1
SE0230 (SE0230)
1
SE0234 (SE0234)
1
SE0237 (SE0237)
1
SE0238 (SE0238)
1
SE0244 (SE0244)
1
SE0247 (SE0247)
1
SE0249 (SE0249)
1
SE0254 (SE0254)
1
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11
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10
SE0271 (hisG)
10
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1
SE0285 (SE0285)
1
SE0286 (SE0286)
1
x_2
1
SE0290 (gltX)
1
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1
SE0292 (cysS)
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SE0293 (SE0293)
1
SE0294 (SE0294)
1
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1
SE0298 (secE)
1
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1
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1
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1
SE0307 (SE0307)
11
SE0308 (SE0308)
1
SE0310 (SE0310)
1
fusA (fusA)
1
SE0312 (tuf)
1
SE0318 (SE0318)
1
SE0325 (SE0325)
1
SE0326 (SE0326)
4
SE0337 (SE0337)
1
SE0338 (SE0338)
1
SE0342 (SE0342)
6
SE0347 (SE0347)
1
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1
SE0359 (eutD)
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SE0361 (SE0361)
5
SE0362 (SE0362)
28
SE0363 (SE0363)
6
SE0369 (SE0369)
1
SE0370 (SE0370)
1
SE0373 (SE0373)
1
SE0374 (SE0374)
11
SE0384 (SE0384)
6
SE0386 (SE0386)
2
SE0388 (SE0388)
1
SE0395 (SE0395)
1
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1
SE0401 (SE0401)
13
SE0405 (SE0405)
3
SE0406 (SE0406)
3
SE0410 (SE0410)
1
SE0418 (SE0418)
2
SE0424 (SE0424)
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SE0425 (SE0425)
1
SE0426 (SE0426)
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SE0427 (SE0427)
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SE0429 (SE0429)
1
SE0433 (SE0433)
1
SE0437 (SE0437)
1
SE0438 (SE0438)
1
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1
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1
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1
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1
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1
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1
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31
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9
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1
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1
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46
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1
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1
x_3
1
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24
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2
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1
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2
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11
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1
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11
x_4
2
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24
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1
SE0766 (SE0766)
1
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14
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9
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1
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9
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1
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1
x_5
2
SE0793 (SE0793)
2
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1
SE0796 (SE0796)
1
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2
SE0800 (SE0800)
2
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2
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2
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1
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2
SE0818 (SE0818)
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1
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1
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2
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32
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2
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SE0857 (mraY)
3
SE0858 (murD)
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9
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1
SE0873 (SE0873)
3
SE0875 (SE0875)
2
SE0877 (pyrC)
2
SE0878 (SE0878)
1
SE0879 (carB)
3
SE0882 (SE0882)
1
SE0883 (SE0883)
1
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1
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1
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7
SE0893 (SE0893)
25
SE0894 (SE0894)
2
SE0896 (SE0896)
29
SE0898 (SE0898)
2
SE0899 (rpmB)
2
SE0900 (SE0900)
1
SE0901 (SE0901)
35
SE0911 (SE0911)
2
SE0914 (rimM)
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1
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SE0932 (rpsB)
1
SE0934 (pyrH)
1
SE0937 (SE0937)
1
SE0939 (SE0939)
1
SE0941 (SE0941)
1
SE0943 (SE0943)
1
SE0944 (SE0944)
1
SE0947 (rbfA)
1
SE0949 (SE0949)
8
SE0950 (rpsO)
2
SE0954 (SE0954)
1
SE0955 (SE0955)
1
SE0956 (SE0956)
1
SE0957 (SE0957)
1
SE0959 (SE0959)
1
SE0960 (SE0960)
1
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1
SE0965 (SE0965)
1
SE0967 (SE0967)
10
SE0968 (SE0968)
1
SE0969 (SE0969)
1
SE0970 (SE0970)
1
SE0972 (SE0972)
1
SE0973 (SE0973)
1
SE0975 (mutL)
1
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31
SE0979 (SE0979)
1
SE0981 (miaA)
8
SE0982 (SE0982)
1
SE0996 (SE0996)
1
SE1009 (SE1009)
12
SE1010 (SE1010)
2
SE1023 (SE1023)
1
SE1026 (SE1026)
6
SE1033 (SE1033)
7
SE1035 (SE1035)
2
SE1037 (SE1037)
12
SE1047 (SE1047)
28
SE1049 (SE1049)
5
SE1057 (SE1057)
1
SE1058 (SE1058)
9
SE1061 (SE1061)
1
SE1066 (SE1066)
1
SE1067 (SE1067)
5
SE1076 (SE1076)
12
x_6
1
SE1092 (SE1092)
8
SE1094 (SE1094)
3
SE1095 (SE1095)
1
SE1110 (murG)
1
SE1111 (SE1111)
1
SE1114 (SE1114)
1
SE1115 (SE1115)
1
SE1124 (SE1124)
1
SE1125 (SE1125)
1
SE1133 (SE1133)
10
SE1134 (SE1134)
2
SE1135 (SE1135)
3
SE1137 (recU)
3
SE1141 (SE1141)
1
SE1142 (asnC)
1
SE1147 (SE1147)
1
SE1156 (ndk)
1
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1
SE1160 (SE1160)
1
SE1163 (engA)
1
SE1171 (SE1171)
10
SE1172 (SE1172)
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SE1179 (SE1179)
6
SE1181 (SE1181)
3
SE1182 (SE1182)
2
SE1183 (SE1183)
1
SE1187 (SE1187)
8
SE1190 (SE1190)
1
SE1192 (SE1192)
9
SE1194 (SE1194)
10
SE1197 (SE1197)
33
SE1198 (SE1198)
5
SE1203 (SE1203)
1
SE1204 (xseA)
12
SE1206 (SE1206)
8
SE1207 (SE1207)
10
SE1213 (SE1213)
2
SE1214 (SE1214)
1
SE1217 (SE1217)
1
SE1224 (SE1224)
1
SE1227 (SE1227)
1
SE1228 (SE1228)
1
SE1234 (SE1234)
1
SE1240 (SE1240)
1
SE1241 (SE1241)
1
SE1246 (SE1246)
10
SE1247 (SE1247)
12
SE1254 (era)
8
SE1257 (SE1257)
14
SE1261 (SE1261)
1
SE1262 (rpsU)
1
SE1263 (SE1263)
1
SE1264 (SE1264)
1
SE1268 (SE1268)
1
SE1269 (SE1269)
2
SE1270 (SE1270)
2
SE1278 (SE1278)
1
SE1279 (SE1279)
1
SE1284 (SE1284)
1
SE1285 (SE1285)
1
SE1295 (SE1295)
1
SE1296 (SE1296)
1
SE1298 (SE1298)
1
SE1300 (SE1300)
1
SE1305 (SE1305)
9
SE1306 (SE1306)
11
SE1308 (SE1308)
1
SE1313 (SE1313)
2
SE1314 (SE1314)
1
SE1317 (SE1317)
2
SE1321 (SE1321)
1
SE1322 (tgt)
1
SE1325 (ruvA)
1
SE1326 (SE1326)
6
SE1328 (rpmA)
1
SE1329 (SE1329)
1
SE1335 (SE1335)
1
SE1338 (SE1338)
32
SE1340 (SE1340)
1
SE1344 (SE1344)
1
SE1346 (SE1346)
1
SE1351 (SE1351)
1
SE1353 (rplT)
1
SE1354 (rpmI)
1
SE1356 (SE1356)
1
SE1358 (SE1358)
1
SE1361 (SE1361)
1
SE1366 (SE1366)
1
SE1369 (SE1369)
1
SE1373 (SE1373)
15
SE1379 (SE1379)
28
SE1380 (SE1380)
1
SE1381 (SE1381)
2
SE1384 (SE1384)
1
SE1388 (SE1388)
2
SE1389 (tpx)
1
SE1391 (SE1391)
3
x_7
1
SE1392 (SE1392)
1
SE1395 (SE1395)
1
SE1396 (rpsD)
1
SE1402 (SE1402)
1
SE1404 (SE1404)
2
SE1406 (SE1406)
1
SE1409 (SE1409)
1
SE1410 (SE1410)
1
SE1412 (SE1412)
1
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1
SE1422 (SE1422)
1
SE1424 (SE1424)
1
SE1430 (SE1430)
1
SE1432 (SE1432)
11
SE1433 (SE1433)
7
SE1440 (SE1440)
8
SE1441 (SE1441)
5
SE1442 (SE1442)
6
SE1443 (SE1443)
2
SE1451 (SE1451)
1
SE1457 (SE1457)
5
SE1461 (SE1461)
8
SE1514 (SE1514)
7
SE1516 (SE1516)
11
SE1519 (SE1519)
2
SE1520 (SE1520)
1
SE1522 (SE1522)
1
SE1548 (SE1548)
2
SE1549 (SE1549)
2
SE1550 (SE1550)
2
SE1551 (SE1551)
1
SE1552 (SE1552)
2
SE1553 (SE1553)
2
SE1561 (SE1561)
1
SE1562 (SE1562)
1
SE1565 (SE1565)
1
SE1566 (SE1566)
2
SE1567 (SE1567)
1
SE1569 (SE1569)
8
SE1570 (SE1570)
1
SE1571 (SE1571)
1
SE1575 (SE1575)
1
SE1576 (SE1576)
1
SE1579 (SE1579)
1
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2
SE1586 (gatC)
2
SE1589 (SE1589)
2
SE1591 (SE1591)
1
SE1592 (SE1592)
1
SE1593 (SE1593)
2
SE1594 (SE1594)
2
SE1595 (SE1595)
2
SE1596 (nadE)
2
SE1624 (SE1624)
1
SE1625 (SE1625)
1
SE1640 (SE1640)
11
SE1645 (SE1645)
9
SE1647 (SE1647)
11
SE1648 (SE1648)
12
SE1649 (SE1649)
12
SE1651 (SE1651)
6
SE1652 (SE1652)
1
SE1653 (SE1653)
1
x_8
1
x_9
1
SE1656 (SE1656)
1
SE1661 (leuD)
2
SE1670 (SE1670)
1
SE1671 (SE1671)
27
SE1673 (SE1673)
1
SE1679 (SE1679)
2
SE1682 (SE1682)
1
SE1686 (SE1686)
1
SE1688 (SE1688)
1
SE1692 (SE1692)
1
SE1694 (SE1694)
1
SE1696 (SE1696)
1
SE1697 (fabZ)
1
x_10
N
SE1699 (atpC)
6
SE1700 (SE1700)
9
SE1701 (SE1701)
18
SE1702 (SE1702)
1
SE1703 (SE1703)
1
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1
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1
SE1706 (SE1706)
1
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1
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1
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1
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1
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9
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1
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30
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1
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1
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1
SE1759 (SE1759)
1
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1
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1
x_11
1
SE1771 (SE1771)
9
SE1772 (SE1772)
2
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1
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1
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9
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1
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1
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27
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1
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1
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1
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1
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1
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1
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1
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2
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35
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1
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9
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1
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9
SE1846 (SE1846)
1
SE1851 (SE1851)
18
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1
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1
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12
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10
SE1866 (SE1866)
2
SE1867 (SE1867)
9
SE1869 (SE1869)
1
SE1874 (SE1874)
2
SE1878 (SE1878)
2
SE1885 (SE1885)
7
SE1888 (SE1888)
1
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25
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1
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1
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1
x_12
1
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1
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1
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1
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1
x_13
1
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2
SE1948 (SE1948)
12
SE1950 (SE1950)
11
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10
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2
x_14
1
SE1971 (SE1971)
1
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1
SE1976 (SE1976)
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2
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5
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7
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10
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11
SE2024 (SE2024)
8
SE2030 (SE2030)
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13
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SE2060 (thiG)
1
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1
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11
SE2066 (SE2066)
2
SE2076 (SE2076)
16
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1
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1
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1
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1
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1
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1
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25
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1
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1
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1
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2
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1
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1
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1
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1
x_15
1
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2
SE2243 (SE2243)
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11
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SE2258 (SE2258)
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x_16
1
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Auto Definer
curator
Auto Definer
date entered
2017-03-01
datestamp
2017-03-01

Similar profiles (determined by classification schemes)

Experimental schemes are subject to change and are not a stable part of the nomenclature.

Classification schemeClustering methodMismatch thresholdStatusGroup Profiles
Clustering-134Single-linkage134experimental39
Clustering-468Single-linkage468experimental1380
test-105Single-linkage105experimental34

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