Profile information for cgST-23 (cgMLST)

cgST
23
SE2419 (rpmH)
1
SE0002 (SE0002)
8
x_1
3
SE0003 (recF)
9
SE0004 (SE0004)
37
SE0007 (SE0007)
11
SE0010 (SE0010)
23
SE0014 (rplI)
29
SE0022 (SE0022)
42
SE0156 (SE0156)
23
SE0183 (SE0183)
2
SE0197 (SE0197)
25
SE0210 (SE0210)
33
SE0216 (SE0216)
25
SE0219 (SE0219)
27
SE0224 (SE0224)
34
SE0230 (SE0230)
4
SE0234 (SE0234)
32
SE0237 (SE0237)
4
SE0238 (SE0238)
5
SE0244 (SE0244)
5
SE0247 (SE0247)
26
SE0249 (SE0249)
4
SE0254 (SE0254)
8
SE0259 (SE0259)
10
SE0262 (SE0262)
31
SE0271 (hisG)
2
SE0284 (SE0284)
4
SE0285 (SE0285)
3
SE0286 (SE0286)
14
x_2
3
SE0290 (gltX)
27
SE0291 (SE0291)
16
SE0292 (cysS)
33
SE0293 (SE0293)
6
SE0294 (SE0294)
8
SE0295 (SE0295)
7
SE0298 (secE)
2
SE0299 (SE0299)
3
SE0301 (rplA)
8
SE0303 (rplJ)
2
SE0304 (rplL)
3
SE0307 (SE0307)
41
SE0308 (SE0308)
3
SE0310 (SE0310)
4
fusA (fusA)
30
SE0312 (tuf)
1
SE0318 (SE0318)
3
SE0325 (SE0325)
3
SE0326 (SE0326)
3
SE0337 (SE0337)
16
SE0338 (SE0338)
20
SE0342 (SE0342)
27
SE0347 (SE0347)
5
SE0348 (SE0348)
17
SE0359 (eutD)
7
SE0361 (SE0361)
23
SE0362 (SE0362)
8
SE0363 (SE0363)
25
SE0369 (SE0369)
8
SE0370 (SE0370)
8
SE0373 (SE0373)
22
SE0374 (SE0374)
10
SE0384 (SE0384)
8
SE0386 (SE0386)
5
SE0388 (SE0388)
22
SE0395 (SE0395)
3
SE0396 (SE0396)
5
SE0401 (SE0401)
3
SE0405 (SE0405)
10
SE0406 (SE0406)
20
SE0410 (SE0410)
26
SE0418 (SE0418)
35
SE0424 (SE0424)
33
SE0425 (SE0425)
26
SE0426 (SE0426)
9
SE0427 (SE0427)
12
SE0429 (SE0429)
29
SE0433 (SE0433)
20
SE0437 (SE0437)
13
SE0438 (SE0438)
12
SE0439 (SE0439)
25
SE0441 (SE0441)
2
SE0442 (SE0442)
4
SE0448 (SE0448)
6
SE0450 (SE0450)
8
SE0454 (uppP)
23
SE0459 (SE0459)
14
SE0471 (SE0471)
N
SE0473 (SE0473)
31
SE0477 (SE0477)
24
SE0480 (SE0480)
8
SE0485 (SE0485)
20
SE0487 (SE0487)
4
SE0488 (SE0488)
23
SE0490 (SE0490)
18
SE0491 (SE0491)
3
SE0492 (SE0492)
6
SE0493 (SE0493)
26
SE0501 (SE0501)
22
SE0503 (SE0503)
39
SE0505 (SE0505)
5
SE0511 (SE0511)
22
SE0512 (nrdI)
3
SE0517 (SE0517)
6
SE0519 (SE0519)
3
SE0524 (SE0524)
7
SE0526 (SE0526)
7
SE0528 (SE0528)
6
SE0530 (SE0530)
7
SE0531 (SE0531)
6
SE0535 (secA)
16
SE0538 (SE0538)
6
SE0543 (SE0543)
5
SE0544 (SE0544)
13
SE0545 (SE0545)
7
SE0547 (SE0547)
3
SE0548 (SE0548)
26
SE0550 (SE0550)
4
SE0551 (clpP)
4
SE0553 (SE0553)
4
SE0555 (SE0555)
6
SE0556 (SE0556)
7
SE0557 (SE0557)
6
SE0558 (pgk)
16
SE0559 (tpiA)
7
SE0561 (eno)
18
SE0562 (SE0562)
13
SE0563 (secG)
1
SE0575 (SE0575)
5
SE0584 (SE0584)
3
x_3
3
SE0593 (SE0593)
11
SE0596 (SE0596)
4
SE0599 (SE0599)
5
SE0601 (SE0601)
8
SE0602 (SE0602)
8
SE0604 (SE0604)
3
SE0607 (SE0607)
5
SE0608 (SE0608)
8
SE0609 (SE0609)
3
SE0613 (SE0613)
28
SE0615 (SE0615)
25
SE0617 (SE0617)
3
SE0619 (SE0619)
15
SE0620 (SE0620)
3
SE0623 (SE0623)
2
SE0624 (SE0624)
34
SE0626 (SE0626)
7
SE0631 (SE0631)
4
SE0634 (SE0634)
4
SE0638 (SE0638)
6
SE0640 (SE0640)
6
SE0641 (SE0641)
2
SE0642 (SE0642)
4
SE0644 (SE0644)
3
SE0645 (SE0645)
3
SE0647 (SE0647)
21
SE0648 (SE0648)
16
SE0649 (SE0649)
2
SE0654 (SE0654)
4
SE0660 (SE0660)
20
SE0662 (SE0662)
7
SE0677 (SE0677)
4
SE0685 (SE0685)
28
SE0690 (SE0690)
13
SE0692 (SE0692)
7
SE0694 (SE0694)
4
SE0695 (SE0695)
4
SE0697 (SE0697)
10
SE0713 (SE0713)
28
x_4
10
SE0716 (SE0716)
27
SE0717 (SE0717)
34
SE0718 (SE0718)
38
SE0719 (SE0719)
5
SE0726 (SE0726)
14
SE0727 (SE0727)
1
SE0729 (SE0729)
5
SE0744 (SE0744)
27
SE0756 (SE0756)
4
SE0757 (SE0757)
4
SE0758 (SE0758)
4
SE0759 (SE0759)
4
SE0760 (SE0760)
4
SE0761 (SE0761)
5
SE0762 (SE0762)
5
SE0763 (SE0763)
22
SE0764 (SE0764)
19
SE0765 (SE0765)
12
SE0766 (SE0766)
18
SE0767 (SE0767)
41
SE0769 (SE0769)
N
SE0770 (SE0770)
16
SE0771 (purH)
31
SE0774 (SE0774)
37
SE0777 (SE0777)
4
SE0778 (SE0778)
30
SE0779 (SE0779)
5
SE0780 (SE0780)
19
SE0781 (SE0781)
1
SE0788 (SE0788)
3
x_5
4
SE0793 (SE0793)
18
SE0794 (SE0794)
29
SE0796 (SE0796)
16
SE0797 (SE0797)
27
SE0800 (SE0800)
29
SE0804 (SE0804)
6
SE0806 (SE0806)
6
SE0810 (SE0810)
4
SE0811 (SE0811)
9
SE0816 (SE0816)
7
SE0817 (SE0817)
33
SE0818 (SE0818)
16
SE0822 (SE0822)
5
SE0823 (SE0823)
3
SE0826 (SE0826)
4
SE0831 (pheS)
6
SE0832 (pheT)
41
SE0834 (SE0834)
5
SE0835 (SE0835)
25
SE0838 (SE0838)
7
SE0840 (SE0840)
12
SE0843 (SE0843)
3
SE0845 (SE0845)
6
SE0853 (SE0853)
6
SE0854 (mraW)
28
SE0857 (mraY)
20
SE0858 (murD)
28
SE0862 (SE0862)
17
SE0865 (SE0865)
1
SE0873 (SE0873)
8
SE0875 (SE0875)
4
SE0877 (pyrC)
4
SE0878 (SE0878)
25
SE0879 (carB)
11
SE0882 (SE0882)
3
SE0883 (SE0883)
5
SE0885 (gmk)
4
SE0889 (SE0889)
3
SE0890 (SE0890)
4
SE0893 (SE0893)
24
SE0894 (SE0894)
4
SE0896 (SE0896)
28
SE0898 (SE0898)
7
SE0899 (rpmB)
3
SE0900 (SE0900)
5
SE0901 (SE0901)
34
SE0911 (SE0911)
6
SE0914 (rimM)
10
SE0915 (trmD)
25
SE0916 (rplS)
2
SE0921 (rbgA)
5
SE0922 (rnhB)
10
SE0924 (SE0924)
6
SE0928 (SE0928)
21
SE0929 (SE0929)
5
SE0932 (rpsB)
15
SE0934 (pyrH)
6
SE0937 (SE0937)
5
SE0939 (SE0939)
30
SE0941 (SE0941)
16
SE0943 (SE0943)
9
SE0944 (SE0944)
15
SE0947 (rbfA)
3
SE0949 (SE0949)
24
SE0950 (rpsO)
2
SE0954 (SE0954)
5
SE0955 (SE0955)
17
SE0956 (SE0956)
28
SE0957 (SE0957)
25
SE0959 (SE0959)
15
SE0960 (SE0960)
18
SE0964 (SE0964)
23
SE0965 (SE0965)
5
SE0967 (SE0967)
30
SE0968 (SE0968)
5
SE0969 (SE0969)
7
SE0970 (SE0970)
5
SE0972 (SE0972)
11
SE0973 (SE0973)
24
SE0975 (mutL)
39
SE0978 (glpK)
30
SE0979 (SE0979)
33
SE0981 (miaA)
29
SE0982 (SE0982)
5
SE0996 (SE0996)
3
SE1009 (SE1009)
36
SE1010 (SE1010)
25
SE1023 (SE1023)
19
SE1026 (SE1026)
3
SE1033 (SE1033)
4
SE1035 (SE1035)
4
SE1037 (SE1037)
49
SE1047 (SE1047)
7
SE1049 (SE1049)
28
SE1057 (SE1057)
28
SE1058 (SE1058)
19
SE1061 (SE1061)
16
SE1066 (SE1066)
15
SE1067 (SE1067)
19
SE1076 (SE1076)
4
x_6
5
SE1092 (SE1092)
22
SE1094 (SE1094)
36
SE1095 (SE1095)
3
SE1110 (murG)
6
SE1111 (SE1111)
6
SE1114 (SE1114)
5
SE1115 (SE1115)
4
SE1124 (SE1124)
3
SE1125 (SE1125)
4
SE1133 (SE1133)
36
SE1134 (SE1134)
4
SE1135 (SE1135)
5
SE1137 (recU)
8
SE1141 (SE1141)
11
SE1142 (asnC)
23
SE1147 (SE1147)
2
SE1156 (ndk)
4
SE1158 (ubiE)
3
SE1160 (SE1160)
3
SE1163 (engA)
32
SE1171 (SE1171)
8
SE1172 (SE1172)
9
SE1179 (SE1179)
7
SE1181 (SE1181)
5
SE1182 (SE1182)
5
SE1183 (SE1183)
5
SE1187 (SE1187)
24
SE1190 (SE1190)
15
SE1192 (SE1192)
31
SE1194 (SE1194)
5
SE1197 (SE1197)
11
SE1198 (SE1198)
25
SE1203 (SE1203)
4
SE1204 (xseA)
34
SE1206 (SE1206)
15
SE1207 (SE1207)
32
SE1213 (SE1213)
15
SE1214 (SE1214)
24
SE1217 (SE1217)
6
SE1224 (SE1224)
3
SE1227 (SE1227)
5
SE1228 (SE1228)
3
SE1234 (SE1234)
3
SE1240 (SE1240)
5
SE1241 (SE1241)
13
SE1246 (SE1246)
9
SE1247 (SE1247)
21
SE1254 (era)
15
SE1257 (SE1257)
12
SE1261 (SE1261)
7
SE1262 (rpsU)
3
SE1263 (SE1263)
8
SE1264 (SE1264)
8
SE1268 (SE1268)
8
SE1269 (SE1269)
27
SE1270 (SE1270)
28
SE1278 (SE1278)
7
SE1279 (SE1279)
3
SE1284 (SE1284)
2
SE1285 (SE1285)
2
SE1295 (SE1295)
22
SE1296 (SE1296)
29
SE1298 (SE1298)
6
SE1300 (SE1300)
10
SE1305 (SE1305)
33
SE1306 (SE1306)
34
SE1308 (SE1308)
4
SE1313 (SE1313)
31
SE1314 (SE1314)
2
SE1317 (SE1317)
4
SE1321 (SE1321)
10
SE1322 (tgt)
25
SE1325 (ruvA)
22
SE1326 (SE1326)
3
SE1328 (rpmA)
3
SE1329 (SE1329)
9
SE1335 (SE1335)
4
SE1338 (SE1338)
31
SE1340 (SE1340)
24
SE1344 (SE1344)
27
SE1346 (SE1346)
21
SE1351 (SE1351)
4
SE1353 (rplT)
3
SE1354 (rpmI)
1
SE1356 (SE1356)
9
SE1358 (SE1358)
25
SE1361 (SE1361)
30
SE1366 (SE1366)
29
SE1369 (SE1369)
3
SE1373 (SE1373)
24
SE1379 (SE1379)
9
SE1380 (SE1380)
31
SE1381 (SE1381)
5
SE1384 (SE1384)
8
SE1388 (SE1388)
4
SE1389 (tpx)
15
SE1391 (SE1391)
33
x_7
23
SE1392 (SE1392)
29
SE1395 (SE1395)
1
SE1396 (rpsD)
15
SE1402 (SE1402)
32
SE1404 (SE1404)
20
SE1406 (SE1406)
28
SE1409 (SE1409)
21
SE1410 (SE1410)
22
SE1412 (SE1412)
8
SE1413 (murC)
32
SE1422 (SE1422)
7
SE1424 (SE1424)
27
SE1430 (SE1430)
5
SE1432 (SE1432)
5
SE1433 (SE1433)
28
SE1440 (SE1440)
19
SE1441 (SE1441)
4
SE1442 (SE1442)
31
SE1443 (SE1443)
6
SE1451 (SE1451)
4
SE1457 (SE1457)
13
SE1461 (SE1461)
24
SE1514 (SE1514)
5
SE1516 (SE1516)
17
SE1519 (SE1519)
21
SE1520 (SE1520)
3
SE1522 (SE1522)
1
SE1548 (SE1548)
33
SE1549 (SE1549)
8
SE1550 (SE1550)
19
SE1551 (SE1551)
6
SE1552 (SE1552)
14
SE1553 (SE1553)
19
SE1561 (SE1561)
3
SE1562 (SE1562)
5
SE1565 (SE1565)
3
SE1566 (SE1566)
4
SE1567 (SE1567)
4
SE1569 (SE1569)
21
SE1570 (SE1570)
25
SE1571 (SE1571)
5
SE1575 (SE1575)
7
SE1576 (SE1576)
5
SE1579 (SE1579)
21
SE1585 (gatA)
33
SE1586 (gatC)
4
SE1589 (SE1589)
34
SE1591 (SE1591)
4
SE1592 (SE1592)
3
SE1593 (SE1593)
8
SE1594 (SE1594)
4
SE1595 (SE1595)
4
SE1596 (nadE)
24
SE1624 (SE1624)
4
SE1625 (SE1625)
7
SE1640 (SE1640)
36
SE1645 (SE1645)
5
SE1647 (SE1647)
14
SE1648 (SE1648)
43
SE1649 (SE1649)
5
SE1651 (SE1651)
3
SE1652 (SE1652)
22
SE1653 (SE1653)
17
x_8
11
x_9
4
SE1656 (SE1656)
3
SE1661 (leuD)
25
SE1670 (SE1670)
3
SE1671 (SE1671)
4
SE1673 (SE1673)
2
SE1679 (SE1679)
28
SE1682 (SE1682)
4
SE1686 (SE1686)
3
SE1688 (SE1688)
8
SE1692 (SE1692)
4
SE1694 (SE1694)
17
SE1696 (SE1696)
5
SE1697 (fabZ)
4
x_10
4
SE1699 (atpC)
3
SE1700 (SE1700)
8
SE1701 (SE1701)
5
SE1702 (SE1702)
6
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4
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4
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2
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5
SE1707 (SE1707)
3
SE1710 (glyA)
9
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2
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9
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SE1728 (SE1728)
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28
SE1738 (SE1738)
18
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6
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6
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8
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8
SE1763 (SE1763)
3
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12
x_11
2
SE1771 (SE1771)
33
SE1772 (SE1772)
36
SE1774 (SE1774)
6
SE1775 (SE1775)
3
SE1778 (SE1778)
32
SE1784 (SE1784)
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SE1785 (SE1785)
17
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7
SE1790 (rpsI)
7
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4
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7
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3
SE1800 (rpmJ)
1
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1
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5
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11
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2
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2
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3
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4
SE1825 (rpsJ)
3
SE1827 (SE1827)
34
SE1831 (SE1831)
25
SE1835 (SE1835)
7
SE1843 (SE1843)
5
SE1845 (SE1845)
6
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7
SE1851 (SE1851)
5
SE1856 (SE1856)
3
SE1861 (ureA)
8
SE1863 (ureC)
35
SE1865 (SE1865)
25
SE1866 (SE1866)
4
SE1867 (SE1867)
18
SE1869 (SE1869)
3
SE1874 (SE1874)
24
SE1878 (SE1878)
11
SE1885 (SE1885)
4
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4
SE1889 (murQ)
24
SE1902 (SE1902)
31
SE1907 (SE1907)
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SE1908 (SE1908)
30
x_12
19
SE1911 (SE1911)
29
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5
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16
SE1930 (SE1930)
4
x_13
6
SE1941 (SE1941)
26
SE1948 (SE1948)
35
SE1950 (SE1950)
9
SE1951 (SE1951)
7
SE1952 (SE1952)
4
x_14
13
SE1971 (SE1971)
7
SE1973 (SE1973)
29
SE1976 (SE1976)
31
SE1977 (SE1977)
8
SE1993 (SE1993)
8
SE1995 (gpmA)
5
SE1996 (SE1996)
7
SE2010 (SE2010)
20
SE2013 (SE2013)
5
SE2014 (SE2014)
10
SE2024 (SE2024)
30
SE2030 (SE2030)
44
SE2031 (SE2031)
19
SE2032 (SE2032)
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SE2038 (SE2038)
3
SE2045 (SE2045)
39
SE2046 (SE2046)
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SE2053 (SE2053)
24
SE2055 (SE2055)
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SE2059 (SE2059)
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SE2060 (thiG)
18
SE2061 (SE2061)
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SE2062 (SE2062)
4
SE2063 (SE2063)
24
SE2066 (SE2066)
36
SE2076 (SE2076)
6
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11
SE2090 (SE2090)
5
SE2092 (SE2092)
11
SE2093 (SE2093)
11
SE2096 (SE2096)
10
SE2098 (SE2098)
13
SE2103 (SE2103)
30
SE2104 (SE2104)
24
SE2105 (SE2105)
4
SE2107 (SE2107)
5
SE2110 (SE2110)
31
SE2116 (SE2116)
32
SE2117 (SE2117)
11
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SE2130 (SE2130)
31
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SE2140 (panC)
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SE2143 (SE2143)
6
SE2144 (SE2144)
8
SE2156 (SE2156)
12
SE2160 (SE2160)
41
SE2162 (SE2162)
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SE2165 (SE2165)
31
SE2168 (SE2168)
15
SE2170 (SE2170)
33
SE2171 (SE2171)
23
SE2173 (SE2173)
8
SE2174 (SE2174)
23
SE2210 (SE2210)
39
SE2225 (SE2225)
N
x_15
4
SE2229 (SE2229)
25
SE2233 (SE2233)
21
SE2243 (SE2243)
35
SE2253 (SE2253)
35
SE2254 (SE2254)
16
SE2255 (SE2255)
15
SE2258 (SE2258)
22
SE2267 (SE2267)
4
SE2268 (SE2268)
3
SE2271 (hslO)
12
SE2273 (SE2273)
7
SE2275 (SE2275)
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SE2276 (SE2276)
3
SE2277 (SE2277)
3
SE2278 (SE2278)
26
SE2279 (SE2279)
27
SE2280 (SE2280)
49
SE2281 (SE2281)
4
SE2282 (SE2282)
7
SE2283 (SE2283)
4
SE2284 (glmU)
27
SE2285 (SE2285)
3
SE2286 (SE2286)
3
SE2288 (ipk)
3
SE2289 (SE2289)
1
SE2290 (ksgA)
3
SE2291 (SE2291)
4
SE2292 (SE2292)
18
SE2295 (SE2295)
2
SE2297 (SE2297)
3
SE2298 (SE2298)
5
SE2299 (SE2299)
21
SE2315 (SE2315)
3
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SE2321 (SE2321)
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27
x_16
3
SE2330 (SE2330)
13
SE2334 (SE2334)
2
SE2348 (SE2348)
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SE2349 (SE2349)
25
SE2350 (SE2350)
6
SE2351 (SE2351)
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N
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8
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curator
Auto Definer
date entered
2017-03-01
datestamp
2017-03-01

Similar profiles (determined by classification schemes)

Experimental schemes are subject to change and are not a stable part of the nomenclature.

Classification schemeClustering methodMismatch thresholdStatusGroup Profiles
Clustering-134Single-linkage134experimental178
Clustering-468Single-linkage468experimental718
test-105Single-linkage105experimental178

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