cya allele sequence: id-546
Contig position
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- yes
Sequence
GTTCGGCCGC TACGTCGGCG AGGACGTGGC GCGCCGGGCG CTCGAATACG GCACCGAACT GGGAGGCCAG GAGCGCAGCG TCGCGGTGCT CTTCGTCGAC CTGGTGGGGT CCACCCAGTT GGCGTCCACT CGGGGGCCTG CGGTGGTCGT ACGGGTGCTC AACGAGTTCT TCCGGGTCAT CGTCGACACC GTCAACAAGC ACGGCGGCTT CGTGAACAAG TTCCAGGGTG ACGCGGCGCT GGCGATTTTT GGTGCCCCGA TCGACCACCC GGACGGCGCC GCAGCGGCAC TTGCGGCCGC TCGTGAGCTG TCGGGCGAGC TGACCAATGT GTTGGGCTCC AATGACTTCG GCATAGGAGT CTCCGCCGGA CGGGCGATCG CCGGGCATAT CGGCGCACAG GCCCGATTCG AGTACACCGT GATCGGCGAC CCGGTGAACG AAGCGGCCCG ACTCACCGAG CTGGCTAAGA ACGAGCCGGG CAACGTGCTC GCGTCGGCCT CCGCAGTCAT GGAGGCGCGC GACGAGGAGG CACTGCGCTG GGATGTCGGC GAGACCGTCG AGCTGCGCGG CCGCACGGTC TCAACGCAGG TGGCGCGCCC GCGTCACGGC TAAGTCGCCT TCTTCGCGGC CTTTTTCGGG GTCGCCTTTT TGGCCGGGGC CTTCTTGGCA GCCTTCGCCG GTGCCTTCTT GGCCCGCTTC ACCGGCCCGC
Translation
V R P L R R R G R G A P G A R I R H R T G R P G A Q R R G A L R R P F1
F G R Y V G E D V A R R A L E Y G T E L G G Q E R S V A V L F V D F2
S A A T S A R T W R A G R S N T A P N W E A R S A A S R C S S S T F3
1 GTTCGGCCGCTACGTCGGCGAGGACGTGGCGCGCCGGGCGCTCGAATACGGCACCGAACTGGGAGGCCAGGAGCGCAGCGTCGCGGTGCTCTTCGTCGAC 100
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G G V H P V G V H S G A C G G R T G A Q R V L P G H R R H R Q Q A F1
L V G S T Q L A S T R G P A V V V R V L N E F F R V I V D T V N K H F2
W W G P P S W R P L G G L R W S Y G C S T S S S G S S S T P S T S F3
101 CTGGTGGGGTCCACCCAGTTGGCGTCCACTCGGGGGCCTGCGGTGGTCGTACGGGTGCTCAACGAGTTCTTCCGGGTCATCGTCGACACCGTCAACAAGC 200
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R R L R E Q V P G * R G A G D F W C P D R P P G R R R S G T C G R F1
G G F V N K F Q G D A A L A I F G A P I D H P D G A A A A L A A A F2
T A A S * T S S R V T R R W R F L V P R S T T R T A P Q R H L R P L F3
201 ACGGCGGCTTCGTGAACAAGTTCCAGGGTGACGCGGCGCTGGCGATTTTTGGTGCCCCGATCGACCACCCGGACGGCGCCGCAGCGGCACTTGCGGCCGC 300
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S * A V G R A D Q C V G L Q * L R H R S L R R T G D R R A Y R R T G F1
R E L S G E L T N V L G S N D F G I G V S A G R A I A G H I G A Q F2
V S C R A S * P M C W A P M T S A * E S P P D G R S P G I S A H R F3
301 TCGTGAGCTGTCGGGCGAGCTGACCAATGTGTTGGGCTCCAATGACTTCGGCATAGGAGTCTCCGCCGGACGGGCGATCGCCGGGCATATCGGCGCACAG 400
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P I R V H R D R R P G E R S G P T H R A G * E R A G Q R A R V G L F1
A R F E Y T V I G D P V N E A A R L T E L A K N E P G N V L A S A S F2
P D S S T P * S A T R * T K R P D S P S W L R T S R A T C S R R P F3
401 GCCCGATTCGAGTACACCGTGATCGGCGACCCGGTGAACGAAGCGGCCCGACTCACCGAGCTGGCTAAGAACGAGCCGGGCAACGTGCTCGCGTCGGCCT 500
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R S H G G A R R G G T A L G C R R D R R A A R P H G L N A G G A P F1
A V M E A R D E E A L R W D V G E T V E L R G R T V S T Q V A R P F2
P Q S W R R A T R R H C A G M S A R P S S C A A A R S Q R R W R A R F3
501 CCGCAGTCATGGAGGCGCGCGACGAGGAGGCACTGCGCTGGGATGTCGGCGAGACCGTCGAGCTGCGCGGCCGCACGGTCTCAACGCAGGTGGCGCGCCC 600
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A S R L S R L L R G L F R G R L F G R G L L G S L R R C L L G P L H F1
R H G * V A F F A A F F G V A F L A G A F L A A F A G A F L A R F F2
V T A K S P S S R P F S G S P F W P G P S W Q P S P V P S W P A S F3
601 GCGTCACGGCTAAGTCGCCTTCTTCGCGGCCTTTTTCGGGGTCGCCTTTTTGGCCGGGGCCTTCTTGGCAGCCTTCGCCGGTGCCTTCTTGGCCCGCTTC 700
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R P A F1
T G P X F2
P A R F3
701 ACCGGCCCGC 710
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