pta allele sequence: id-431

Contig position

sequence bin id
949
contig length
355345
start
68348
end
68833
length
486
orientation
forward
complete
yes
Options

Sequence

CCGCGAGGCC ACCAGCTTCA TGGTCGCGGG CATGACAGCA GAACATTGCC TGGAGCGGCT CAAGGAGGGC CAGGCCGTCA TCTTCCCCGC GGACCGCTCG GACGTACTAC TGGCCGTGGC AAGTGCGCAT GTGGCAGAAG GCTTTCCGTC GCTATCGGCC ATCATCTTGA ATGGTGGGCT CAAGCTGCAC CCGCGCATCG CAGATCTGGT GGACGGTATC GGGCTGCGGT TGCCGATCAT CGAGACGGAC TCCGGCACCT TCGAGACCGC GAGCGCGGCC GCGCATGCGC GTGGCCGGGT GACGGTGGCT TCTGCGCGCA AGATCGATAC CGCGCTCGCG CTGATGGACA GGTACGTGGA TGGCGCGGAT CTCGTTGCGC AGCTCGCTAT CCCGATACCG TCGGTTACCA CGCCGCAGAT GTTCGAGTAC CAGCTGCTGG ACCGGGCACG CGACAACCGC AAGCGCATCG TGTTGCCCGA GGGCGACGAC GACAGGATTC TCAAGGCCGC CGGCCGGCTA TTGCAGCGTC AGGTCGCCGA CCTGACGATC CTGGGCGAAG AGGCCGAAAT CCGCTCCCGT GCCGCCGAGC TCGGTGTCGA CATCTCGAAC GCGCTCGTTG TCAGTCCCAA GACCAGCGAT CTGGCCGAGA AGTTCGCGGA CCAGTACTTC GAGCTGCGTA AGCACA

Translation


          P  R  G  H  Q  L  H  G  R  G  H  D  S  R  T  L  P  G  A  A  Q  G  G  P  G  R  H  L  P  R  G  P  L  G   F1
           R  E  A  T  S  F  M  V  A  G  M  T  A  E  H  C  L  E  R  L  K  E  G  Q  A  V  I  F  P  A  D  R  S     F2
            A  R  P  P  A  S  W  S  R  A  *  Q  Q  N  I  A  W  S  G  S  R  R  A  R  P  S  S  S  P  R  T  A  R    F3
        1 CCGCGAGGCCACCAGCTTCATGGTCGCGGGCATGACAGCAGAACATTGCCTGGAGCGGCTCAAGGAGGGCCAGGCCGTCATCTTCCCCGCGGACCGCTCG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  T  T  G  R  G  K  C  A  C  G  R  R  L  S  V  A  I  G  H  H  L  E  W  W  A  Q  A  A  P  A  H  R    F1
          D  V  L  L  A  V  A  S  A  H  V  A  E  G  F  P  S  L  S  A  I  I  L  N  G  G  L  K  L  H  P  R  I  A   F2
           T  Y  Y  W  P  W  Q  V  R  M  W  Q  K  A  F  R  R  Y  R  P  S  S  *  M  V  G  S  S  C  T  R  A  S     F3
      101 GACGTACTACTGGCCGTGGCAAGTGCGCATGTGGCAGAAGGCTTTCCGTCGCTATCGGCCATCATCTTGAATGGTGGGCTCAAGCTGCACCCGCGCATCG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  S  G  G  R  Y  R  A  A  V  A  D  H  R  D  G  L  R  H  L  R  D  R  E  R  G  R  A  C  A  W  P  G     F1
            D  L  V  D  G  I  G  L  R  L  P  I  I  E  T  D  S  G  T  F  E  T  A  S  A  A  A  H  A  R  G  R  V    F2
          Q  I  W  W  T  V  S  G  C  G  C  R  S  S  R  R  T  P  A  P  S  R  P  R  A  R  P  R  M  R  V  A  G  *   F3
      201 CAGATCTGGTGGACGGTATCGGGCTGCGGTTGCCGATCATCGAGACGGACTCCGGCACCTTCGAGACCGCGAGCGCGGCCGCGCATGCGCGTGGCCGGGT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          D  G  G  F  C  A  Q  D  R  Y  R  A  R  A  D  G  Q  V  R  G  W  R  G  S  R  C  A  A  R  Y  P  D  T  V   F1
           T  V  A  S  A  R  K  I  D  T  A  L  A  L  M  D  R  Y  V  D  G  A  D  L  V  A  Q  L  A  I  P  I  P     F2
            R  W  L  L  R  A  R  S  I  P  R  S  R  *  W  T  G  T  W  M  A  R  I  S  L  R  S  S  L  S  R  Y  R    F3
      301 GACGGTGGCTTCTGCGCGCAAGATCGATACCGCGCTCGCGCTGATGGACAGGTACGTGGATGGCGCGGATCTCGTTGCGCAGCTCGCTATCCCGATACCG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  Y  H  A  A  D  V  R  V  P  A  A  G  P  G  T  R  Q  P  Q  A  H  R  V  A  R  G  R  R  R  Q  D  S    F1
          S  V  T  T  P  Q  M  F  E  Y  Q  L  L  D  R  A  R  D  N  R  K  R  I  V  L  P  E  G  D  D  D  R  I  L   F2
           R  L  P  R  R  R  C  S  S  T  S  C  W  T  G  H  A  T  T  A  S  A  S  C  C  P  R  A  T  T  T  G  F     F3
      401 TCGGTTACCACGCCGCAGATGTTCGAGTACCAGCTGCTGGACCGGGCACGCGACAACCGCAAGCGCATCGTGTTGCCCGAGGGCGACGACGACAGGATTC 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           Q  G  R  R  P  A  I  A  A  S  G  R  R  P  D  D  P  G  R  R  G  R  N  P  L  P  C  R  R  A  R  C  R     F1
            K  A  A  G  R  L  L  Q  R  Q  V  A  D  L  T  I  L  G  E  E  A  E  I  R  S  R  A  A  E  L  G  V  D    F2
          S  R  P  P  A  G  Y  C  S  V  R  S  P  T  *  R  S  W  A  K  R  P  K  S  A  P  V  P  P  S  S  V  S  T   F3
      501 TCAAGGCCGCCGGCCGGCTATTGCAGCGTCAGGTCGCCGACCTGACGATCCTGGGCGAAGAGGCCGAAATCCGCTCCCGTGCCGCCGAGCTCGGTGTCGA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          H  L  E  R  A  R  C  Q  S  Q  D  Q  R  S  G  R  E  V  R  G  P  V  L  R  A  A  *  A  X                  F1
           I  S  N  A  L  V  V  S  P  K  T  S  D  L  A  E  K  F  A  D  Q  Y  F  E  L  R  K  H  X                 F2
            S  R  T  R  S  L  S  V  P  R  P  A  I  W  P  R  S  S  R  T  S  T  S  S  C  V  S  T                   F3
      601 CATCTCGAACGCGCTCGTTGTCAGTCCCAAGACCAGCGATCTGGCCGAGAAGTTCGCGGACCAGTACTTCGAGCTGCGTAAGCACA 686
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