gnd allele sequence: id-431

Contig position

sequence bin id
932
contig length
240013
start
19908
end
20387
length
480
orientation
forward
complete
yes
Options

Sequence

GGCCGTGTTC GCCCGTGCGC TGTCCGGCTC GAAGCCGCAA CGCGCCGCTT CCGTCGGCTT CGCCTCAGGT CAGCTCGGCG AAAAGCCAAG CGATGCAAAA CAGTTCGTTG AAGATGTGCG CCAAGCGCTG TACGCCTCCA AGATCGTGGC CTACGCCCAG GGGTTCAACC AGATCGCGGC GGGCAGCGCC GAGTACGGCT GGAACGTCAA CCCTGGCGAT CTGGCCACCA TTTGGCGTGG CGGCTGCATC ATCCGCGCGC AGTTCCTCAA TCGGGTCAAA GAAGCATTCG CCGATCGGCC GGACCTGGCC ACGCTGATCG CGGCACCGTA CTTCCGCGAC GCCGTCGAGA AGGGCATCGA CAGCTGGCGG CGCGTGGTGG TCACCGCCAC CCAGCTGGGT ATTCCGGTAC CAGGCTTCGC CTCGTCGCTG TCCTACTACG ACGGTCTGCG TACCGATCGC CTGCCCGCCG CACTGACCCA GGCGCAACGC GACTTCTTCG GTGCGCACAC CTATGAGCGC ATCGACGCCC CCGGCAAGTT CCACACGCTC TGGAGCGGCG ACCGCAACGA AGTAGAGGCG TAACGGCCAG AAGAGTAGGG CGTCACATAT GAAGTTCCTG GACGGGCAGC GGCCGCCGTA CGATCTCACG TATGACGACG TCTTCGTGGT GCCCAACCAC

Translation


          G  R  V  R  P  C  A  V  R  L  E  A  A  T  R  R  F  R  R  L  R  L  R  S  A  R  R  K  A  K  R  C  K  T   F1
           A  V  F  A  R  A  L  S  G  S  K  P  Q  R  A  A  S  V  G  F  A  S  G  Q  L  G  E  K  P  S  D  A  K     F2
            P  C  S  P  V  R  C  P  A  R  S  R  N  A  P  L  P  S  A  S  P  Q  V  S  S  A  K  S  Q  A  M  Q  N    F3
        1 GGCCGTGTTCGCCCGTGCGCTGTCCGGCTCGAAGCCGCAACGCGCCGCTTCCGTCGGCTTCGCCTCAGGTCAGCTCGGCGAAAAGCCAAGCGATGCAAAA 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            V  R  *  R  C  A  P  S  A  V  R  L  Q  D  R  G  L  R  P  G  V  Q  P  D  R  G  G  Q  R  R  V  R  L    F1
          Q  F  V  E  D  V  R  Q  A  L  Y  A  S  K  I  V  A  Y  A  Q  G  F  N  Q  I  A  A  G  S  A  E  Y  G  W   F2
           S  S  L  K  M  C  A  K  R  C  T  P  P  R  S  W  P  T  P  R  G  S  T  R  S  R  R  A  A  P  S  T  A     F3
      101 CAGTTCGTTGAAGATGTGCGCCAAGCGCTGTACGCCTCCAAGATCGTGGCCTACGCCCAGGGGTTCAACCAGATCGCGGCGGGCAGCGCCGAGTACGGCT 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           E  R  Q  P  W  R  S  G  H  H  L  A  W  R  L  H  H  P  R  A  V  P  Q  S  G  Q  R  S  I  R  R  S  A     F1
            N  V  N  P  G  D  L  A  T  I  W  R  G  G  C  I  I  R  A  Q  F  L  N  R  V  K  E  A  F  A  D  R  P    F2
          G  T  S  T  L  A  I  W  P  P  F  G  V  A  A  A  S  S  A  R  S  S  S  I  G  S  K  K  H  S  P  I  G  R   F3
      201 GGAACGTCAACCCTGGCGATCTGGCCACCATTTGGCGTGGCGGCTGCATCATCCGCGCGCAGTTCCTCAATCGGGTCAAAGAAGCATTCGCCGATCGGCC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          G  P  G  H  A  D  R  G  T  V  L  P  R  R  R  R  E  G  H  R  Q  L  A  A  R  G  G  H  R  H  P  A  G  Y   F1
           D  L  A  T  L  I  A  A  P  Y  F  R  D  A  V  E  K  G  I  D  S  W  R  R  V  V  V  T  A  T  Q  L  G     F2
            T  W  P  R  *  S  R  H  R  T  S  A  T  P  S  R  R  A  S  T  A  G  G  A  W  W  S  P  P  P  S  W  V    F3
      301 GGACCTGGCCACGCTGATCGCGGCACCGTACTTCCGCGACGCCGTCGAGAAGGGCATCGACAGCTGGCGGCGCGTGGTGGTCACCGCCACCCAGCTGGGT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            S  G  T  R  L  R  L  V  A  V  L  L  R  R  S  A  Y  R  S  P  A  R  R  T  D  P  G  A  T  R  L  L  R    F1
          I  P  V  P  G  F  A  S  S  L  S  Y  Y  D  G  L  R  T  D  R  L  P  A  A  L  T  Q  A  Q  R  D  F  F  G   F2
           F  R  Y  Q  A  S  P  R  R  C  P  T  T  T  V  C  V  P  I  A  C  P  P  H  *  P  R  R  N  A  T  S  S     F3
      401 ATTCCGGTACCAGGCTTCGCCTCGTCGCTGTCCTACTACGACGGTCTGCGTACCGATCGCCTGCCCGCCGCACTGACCCAGGCGCAACGCGACTTCTTCG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           C  A  H  L  *  A  H  R  R  P  R  Q  V  P  H  A  L  E  R  R  P  Q  R  S  R  G  V  T  A  R  R  V  G     F1
            A  H  T  Y  E  R  I  D  A  P  G  K  F  H  T  L  W  S  G  D  R  N  E  V  E  A  *  R  P  E  E  *  G    F2
          V  R  T  P  M  S  A  S  T  P  P  A  S  S  T  R  S  G  A  A  T  A  T  K  *  R  R  N  G  Q  K  S  R  A   F3
      501 GTGCGCACACCTATGAGCGCATCGACGCCCCCGGCAAGTTCCACACGCTCTGGAGCGGCGACCGCAACGAAGTAGAGGCGTAACGGCCAGAAGAGTAGGG 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          R  H  I  *  S  S  W  T  G  S  G  R  R  T  I  S  R  M  T  T  S  S  W  C  P  T  T                        F1
           V  T  Y  E  V  P  G  R  A  A  A  A  V  R  S  H  V  *  R  R  L  R  G  A  Q  P  X                       F2
            S  H  M  K  F  L  D  G  Q  R  P  P  Y  D  L  T  Y  D  D  V  F  V  V  P  N  H                         F3
      601 CGTCACATATGAAGTTCCTGGACGGGCAGCGGCCGCCGTACGATCTCACGTATGACGACGTCTTCGTGGTGCCCAACCAC 680
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