pta allele sequence: id-404

Contig position

sequence bin id
94
contig length
843020
start
240464
end
240949
length
486
orientation
forward
complete
yes
Options

Sequence

CCGTGAGGCC ACCAGCTTCA TGGTCGCGGG CATGACAGCC GAACATTGCC TGGAGCGGCT CAAGGAGGGG CAGGCCGTCA TCTTCCCCGC GGACCGCTCG GACGTACTAC TCGCCGTGGC AAGCGCGCAT GTGGCAGAAG GCTTTCCGTC GCTTTCGGCC ATCATCTTGA ACGGTGGGCT CAAGCTGCAC CCGCGCATCG CCGATCTGGT GGACGGTATC GGGCTGCGGT TGCCGATCAT CGAGACGGAC TCCGGCACCT TCGAGACCGC GAGCGCGGCC GCGCATGCGC GTGGCCGGGT GACGGTGGCT TCTGCGCGCA AGATCGATAC CGCGCTCGCG CTGATGGACA GGTACGTGGA TGGCGCGGAT CTCGTTGCGC AGCTCGCTAT CCCGATACCG TCGGTCACCA CGCCGCAGAT GTTCGAGTAC CAGCTGTTGG ACCGGGCACG CGACAACCGC AAGCGCATCG TGTTGCCCGA GGGCGACGAC GACAGGATTC TCAAGGCCGC CGGCCGGCTG TTGCAGCGCC AGGTCGCCGA CCTGACGATC CTGGGCGAAG AGGCCGAAAT CCGCTCCCGT GCTGCCGAGC TCGGTGTCGA CATCTCGAAC GCACTCGTTG TCAGTCCCAA GACCAGCGAT CTGGCCGAGA AGTTCGCGGA CCAATACTTC GAGCTGCGTA AGCACA

Translation


          P  *  G  H  Q  L  H  G  R  G  H  D  S  R  T  L  P  G  A  A  Q  G  G  A  G  R  H  L  P  R  G  P  L  G   F1
           R  E  A  T  S  F  M  V  A  G  M  T  A  E  H  C  L  E  R  L  K  E  G  Q  A  V  I  F  P  A  D  R  S     F2
            V  R  P  P  A  S  W  S  R  A  *  Q  P  N  I  A  W  S  G  S  R  R  G  R  P  S  S  S  P  R  T  A  R    F3
        1 CCGTGAGGCCACCAGCTTCATGGTCGCGGGCATGACAGCCGAACATTGCCTGGAGCGGCTCAAGGAGGGGCAGGCCGTCATCTTCCCCGCGGACCGCTCG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  T  T  R  R  G  K  R  A  C  G  R  R  L  S  V  A  F  G  H  H  L  E  R  W  A  Q  A  A  P  A  H  R    F1
          D  V  L  L  A  V  A  S  A  H  V  A  E  G  F  P  S  L  S  A  I  I  L  N  G  G  L  K  L  H  P  R  I  A   F2
           T  Y  Y  S  P  W  Q  A  R  M  W  Q  K  A  F  R  R  F  R  P  S  S  *  T  V  G  S  S  C  T  R  A  S     F3
      101 GACGTACTACTCGCCGTGGCAAGCGCGCATGTGGCAGAAGGCTTTCCGTCGCTTTCGGCCATCATCTTGAACGGTGGGCTCAAGCTGCACCCGCGCATCG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  S  G  G  R  Y  R  A  A  V  A  D  H  R  D  G  L  R  H  L  R  D  R  E  R  G  R  A  C  A  W  P  G     F1
            D  L  V  D  G  I  G  L  R  L  P  I  I  E  T  D  S  G  T  F  E  T  A  S  A  A  A  H  A  R  G  R  V    F2
          P  I  W  W  T  V  S  G  C  G  C  R  S  S  R  R  T  P  A  P  S  R  P  R  A  R  P  R  M  R  V  A  G  *   F3
      201 CCGATCTGGTGGACGGTATCGGGCTGCGGTTGCCGATCATCGAGACGGACTCCGGCACCTTCGAGACCGCGAGCGCGGCCGCGCATGCGCGTGGCCGGGT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          D  G  G  F  C  A  Q  D  R  Y  R  A  R  A  D  G  Q  V  R  G  W  R  G  S  R  C  A  A  R  Y  P  D  T  V   F1
           T  V  A  S  A  R  K  I  D  T  A  L  A  L  M  D  R  Y  V  D  G  A  D  L  V  A  Q  L  A  I  P  I  P     F2
            R  W  L  L  R  A  R  S  I  P  R  S  R  *  W  T  G  T  W  M  A  R  I  S  L  R  S  S  L  S  R  Y  R    F3
      301 GACGGTGGCTTCTGCGCGCAAGATCGATACCGCGCTCGCGCTGATGGACAGGTACGTGGATGGCGCGGATCTCGTTGCGCAGCTCGCTATCCCGATACCG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  H  H  A  A  D  V  R  V  P  A  V  G  P  G  T  R  Q  P  Q  A  H  R  V  A  R  G  R  R  R  Q  D  S    F1
          S  V  T  T  P  Q  M  F  E  Y  Q  L  L  D  R  A  R  D  N  R  K  R  I  V  L  P  E  G  D  D  D  R  I  L   F2
           R  S  P  R  R  R  C  S  S  T  S  C  W  T  G  H  A  T  T  A  S  A  S  C  C  P  R  A  T  T  T  G  F     F3
      401 TCGGTCACCACGCCGCAGATGTTCGAGTACCAGCTGTTGGACCGGGCACGCGACAACCGCAAGCGCATCGTGTTGCCCGAGGGCGACGACGACAGGATTC 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           Q  G  R  R  P  A  V  A  A  P  G  R  R  P  D  D  P  G  R  R  G  R  N  P  L  P  C  C  R  A  R  C  R     F1
            K  A  A  G  R  L  L  Q  R  Q  V  A  D  L  T  I  L  G  E  E  A  E  I  R  S  R  A  A  E  L  G  V  D    F2
          S  R  P  P  A  G  C  C  S  A  R  S  P  T  *  R  S  W  A  K  R  P  K  S  A  P  V  L  P  S  S  V  S  T   F3
      501 TCAAGGCCGCCGGCCGGCTGTTGCAGCGCCAGGTCGCCGACCTGACGATCCTGGGCGAAGAGGCCGAAATCCGCTCCCGTGCTGCCGAGCTCGGTGTCGA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          H  L  E  R  T  R  C  Q  S  Q  D  Q  R  S  G  R  E  V  R  G  P  I  L  R  A  A  *  A  X                  F1
           I  S  N  A  L  V  V  S  P  K  T  S  D  L  A  E  K  F  A  D  Q  Y  F  E  L  R  K  H  X                 F2
            S  R  T  H  S  L  S  V  P  R  P  A  I  W  P  R  S  S  R  T  N  T  S  S  C  V  S  T                   F3
      601 CATCTCGAACGCACTCGTTGTCAGTCCCAAGACCAGCGATCTGGCCGAGAAGTTCGCGGACCAATACTTCGAGCTGCGTAAGCACA 686
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