gnd allele sequence: id-404

Contig position

sequence bin id
90
contig length
234877
start
186145
end
186624
length
480
orientation
forward
complete
yes
Options

Sequence

GGCCGTGTTC GCCCGCGCGC TGTCCGGCTC GAAGCCGCAA CGCGCCGCTT CCGTCGGCTT CGCCTCAGGC CAGCTCGGCG AAAAGCCAAG CGATGCAAAG CAGTTCGTTG AAGACGTGCG CCAAGCGCTG TACGCCTCCA AGATCGTGGC CTACGCCCAG GGATTCAACC AGATCGCGGC GGGCAGCGCC GAGTACGGCT GGAACGTCAA CCCTGGCGAT CTGGCCACCA TTTGGCGTGG CGGCTGCATC ATCCGCGCGC AGTTCCTCAA TCGGGTCAAA GAAGCATTCG CCGATCGGCC GGACCTGGCC ACGCTGATCG CGGCGCCGTA CTTCCGCGAC GCCGTCGAGA AGGGCATCGA CAGCTGGCGG CGCGTGGTGG TCACCGCCAC CCAGCTGGGT ATTCCGGTAC CGGGCTTCGC CTCGTCACTG TCCTACTACG ACGGTCTGCG TACCGATCGC CTGCCCGCCG CACTGACCCA GGCGCAACGA GACTTCTTCG GTGCCCACAC CTATGAGCGC ATCGACGCCC CGGGCAAGTT CCACACGCTC TGGAGCGGCG ACCGCAACGA AGTTGAGGCG TAACGGCCAG AAGAGTAGGG CTCACATATG AAGTTCCTGG ACGGGCAGCG GCCGCCGTAC GACCTCACGT ATGACGACGT CTTCGTGGTG CCCAACCACT

Translation


          G  R  V  R  P  R  A  V  R  L  E  A  A  T  R  R  F  R  R  L  R  L  R  P  A  R  R  K  A  K  R  C  K  A   F1
           A  V  F  A  R  A  L  S  G  S  K  P  Q  R  A  A  S  V  G  F  A  S  G  Q  L  G  E  K  P  S  D  A  K     F2
            P  C  S  P  A  R  C  P  A  R  S  R  N  A  P  L  P  S  A  S  P  Q  A  S  S  A  K  S  Q  A  M  Q  S    F3
        1 GGCCGTGTTCGCCCGCGCGCTGTCCGGCTCGAAGCCGCAACGCGCCGCTTCCGTCGGCTTCGCCTCAGGCCAGCTCGGCGAAAAGCCAAGCGATGCAAAG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            V  R  *  R  R  A  P  S  A  V  R  L  Q  D  R  G  L  R  P  G  I  Q  P  D  R  G  G  Q  R  R  V  R  L    F1
          Q  F  V  E  D  V  R  Q  A  L  Y  A  S  K  I  V  A  Y  A  Q  G  F  N  Q  I  A  A  G  S  A  E  Y  G  W   F2
           S  S  L  K  T  C  A  K  R  C  T  P  P  R  S  W  P  T  P  R  D  S  T  R  S  R  R  A  A  P  S  T  A     F3
      101 CAGTTCGTTGAAGACGTGCGCCAAGCGCTGTACGCCTCCAAGATCGTGGCCTACGCCCAGGGATTCAACCAGATCGCGGCGGGCAGCGCCGAGTACGGCT 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           E  R  Q  P  W  R  S  G  H  H  L  A  W  R  L  H  H  P  R  A  V  P  Q  S  G  Q  R  S  I  R  R  S  A     F1
            N  V  N  P  G  D  L  A  T  I  W  R  G  G  C  I  I  R  A  Q  F  L  N  R  V  K  E  A  F  A  D  R  P    F2
          G  T  S  T  L  A  I  W  P  P  F  G  V  A  A  A  S  S  A  R  S  S  S  I  G  S  K  K  H  S  P  I  G  R   F3
      201 GGAACGTCAACCCTGGCGATCTGGCCACCATTTGGCGTGGCGGCTGCATCATCCGCGCGCAGTTCCTCAATCGGGTCAAAGAAGCATTCGCCGATCGGCC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          G  P  G  H  A  D  R  G  A  V  L  P  R  R  R  R  E  G  H  R  Q  L  A  A  R  G  G  H  R  H  P  A  G  Y   F1
           D  L  A  T  L  I  A  A  P  Y  F  R  D  A  V  E  K  G  I  D  S  W  R  R  V  V  V  T  A  T  Q  L  G     F2
            T  W  P  R  *  S  R  R  R  T  S  A  T  P  S  R  R  A  S  T  A  G  G  A  W  W  S  P  P  P  S  W  V    F3
      301 GGACCTGGCCACGCTGATCGCGGCGCCGTACTTCCGCGACGCCGTCGAGAAGGGCATCGACAGCTGGCGGCGCGTGGTGGTCACCGCCACCCAGCTGGGT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            S  G  T  G  L  R  L  V  T  V  L  L  R  R  S  A  Y  R  S  P  A  R  R  T  D  P  G  A  T  R  L  L  R    F1
          I  P  V  P  G  F  A  S  S  L  S  Y  Y  D  G  L  R  T  D  R  L  P  A  A  L  T  Q  A  Q  R  D  F  F  G   F2
           F  R  Y  R  A  S  P  R  H  C  P  T  T  T  V  C  V  P  I  A  C  P  P  H  *  P  R  R  N  E  T  S  S     F3
      401 ATTCCGGTACCGGGCTTCGCCTCGTCACTGTCCTACTACGACGGTCTGCGTACCGATCGCCTGCCCGCCGCACTGACCCAGGCGCAACGAGACTTCTTCG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           C  P  H  L  *  A  H  R  R  P  G  Q  V  P  H  A  L  E  R  R  P  Q  R  S  *  G  V  T  A  R  R  V  G     F1
            A  H  T  Y  E  R  I  D  A  P  G  K  F  H  T  L  W  S  G  D  R  N  E  V  E  A  *  R  P  E  E  *  G    F2
          V  P  T  P  M  S  A  S  T  P  R  A  S  S  T  R  S  G  A  A  T  A  T  K  L  R  R  N  G  Q  K  S  R  A   F3
      501 GTGCCCACACCTATGAGCGCATCGACGCCCCGGGCAAGTTCCACACGCTCTGGAGCGGCGACCGCAACGAAGTTGAGGCGTAACGGCCAGAAGAGTAGGG 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          L  T  Y  E  V  P  G  R  A  A  A  A  V  R  P  H  V  *  R  R  L  R  G  A  Q  P  L                        F1
           S  H  M  K  F  L  D  G  Q  R  P  P  Y  D  L  T  Y  D  D  V  F  V  V  P  N  H  X                       F2
            H  I  *  S  S  W  T  G  S  G  R  R  T  T  S  R  M  T  T  S  S  W  C  P  T  T                         F3
      601 CTCACATATGAAGTTCCTGGACGGGCAGCGGCCGCCGTACGACCTCACGTATGACGACGTCTTCGTGGTGCCCAACCACT 680
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