cya allele sequence: id-404

Contig position

sequence bin id
96
contig length
263577
start
147337
end
147846
length
510
orientation
reverse
complete
yes
Options

Sequence

GTTCGGCCGT TACGTCGGCG AAGACGTGGC GCGCCGGGCG CTCGAATACG GCACCGAACT GGGAGGCCAG GAGCGCAGCG TCGCGGTGCT CTTCGTCGAC CTGGTGGGGT CCACCCAGTT GGCGTCCACT CGGGGACCCG CGGTGGTCGT ACGGGTGCTC AACGAGTTCT TCCGGGTCAT CGTCGACACT GTCAACAAGC ACGGCGGCTT CGTGAACAAG TTCCAGGGTG ACGCGGCGCT GGCGATTTTT GGTGCCCCGA TCGACCACCC GGACGGTGCC GCAGCGGCAC TCGCGGCCGC TCGTGAGCTG TCGGGCGAGC TGACCAATGT GTTGGGCTCC AATGACTTCG GCATCGGAGT CTCCGCCGGA CGGGCGATCG CCGGGCATAT CGGCGCACAG GCTCGATTCG AGTACACCGT GATCGGCGAC CCGGTGAACG AAGCGGCCCG ACTCACCGAG CTGGCCAAGA ACGAGCCGGG CAACGTGCTC GCGTCGGCCT CCGCAGTCAT GGAGGCGCGC GACGAGGAGG CGCTGCGCTG GGATGTCGGC GAGACGGTCG AGCTGCGCGG CCGCACGGTC TCAACGCAGG TTGCGCGCCC GCGTCACGGC TAAGTCGCCT TCTTCGCAGC CTTTTTCGCG GGCGCCTTTT TAGCCGGAGC CTTCTTGGCA GCCTTCGCGG GTGCCTTTTT AGCCCGCTTC ACCGGCCCAC

Translation


          V  R  P  L  R  R  R  R  R  G  A  P  G  A  R  I  R  H  R  T  G  R  P  G  A  Q  R  R  G  A  L  R  R  P   F1
           F  G  R  Y  V  G  E  D  V  A  R  R  A  L  E  Y  G  T  E  L  G  G  Q  E  R  S  V  A  V  L  F  V  D     F2
            S  A  V  T  S  A  K  T  W  R  A  G  R  S  N  T  A  P  N  W  E  A  R  S  A  A  S  R  C  S  S  S  T    F3
        1 GTTCGGCCGTTACGTCGGCGAAGACGTGGCGCGCCGGGCGCTCGAATACGGCACCGAACTGGGAGGCCAGGAGCGCAGCGTCGCGGTGCTCTTCGTCGAC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  G  V  H  P  V  G  V  H  S  G  T  R  G  G  R  T  G  A  Q  R  V  L  P  G  H  R  R  H  C  Q  Q  A    F1
          L  V  G  S  T  Q  L  A  S  T  R  G  P  A  V  V  V  R  V  L  N  E  F  F  R  V  I  V  D  T  V  N  K  H   F2
           W  W  G  P  P  S  W  R  P  L  G  D  P  R  W  S  Y  G  C  S  T  S  S  S  G  S  S  S  T  L  S  T  S     F3
      101 CTGGTGGGGTCCACCCAGTTGGCGTCCACTCGGGGACCCGCGGTGGTCGTACGGGTGCTCAACGAGTTCTTCCGGGTCATCGTCGACACTGTCAACAAGC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  R  L  R  E  Q  V  P  G  *  R  G  A  G  D  F  W  C  P  D  R  P  P  G  R  C  R  S  G  T  R  G  R     F1
            G  G  F  V  N  K  F  Q  G  D  A  A  L  A  I  F  G  A  P  I  D  H  P  D  G  A  A  A  A  L  A  A  A    F2
          T  A  A  S  *  T  S  S  R  V  T  R  R  W  R  F  L  V  P  R  S  T  T  R  T  V  P  Q  R  H  S  R  P  L   F3
      201 ACGGCGGCTTCGTGAACAAGTTCCAGGGTGACGCGGCGCTGGCGATTTTTGGTGCCCCGATCGACCACCCGGACGGTGCCGCAGCGGCACTCGCGGCCGC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          S  *  A  V  G  R  A  D  Q  C  V  G  L  Q  *  L  R  H  R  S  L  R  R  T  G  D  R  R  A  Y  R  R  T  G   F1
           R  E  L  S  G  E  L  T  N  V  L  G  S  N  D  F  G  I  G  V  S  A  G  R  A  I  A  G  H  I  G  A  Q     F2
            V  S  C  R  A  S  *  P  M  C  W  A  P  M  T  S  A  S  E  S  P  P  D  G  R  S  P  G  I  S  A  H  R    F3
      301 TCGTGAGCTGTCGGGCGAGCTGACCAATGTGTTGGGCTCCAATGACTTCGGCATCGGAGTCTCCGCCGGACGGGCGATCGCCGGGCATATCGGCGCACAG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            S  I  R  V  H  R  D  R  R  P  G  E  R  S  G  P  T  H  R  A  G  Q  E  R  A  G  Q  R  A  R  V  G  L    F1
          A  R  F  E  Y  T  V  I  G  D  P  V  N  E  A  A  R  L  T  E  L  A  K  N  E  P  G  N  V  L  A  S  A  S   F2
           L  D  S  S  T  P  *  S  A  T  R  *  T  K  R  P  D  S  P  S  W  P  R  T  S  R  A  T  C  S  R  R  P     F3
      401 GCTCGATTCGAGTACACCGTGATCGGCGACCCGGTGAACGAAGCGGCCCGACTCACCGAGCTGGCCAAGAACGAGCCGGGCAACGTGCTCGCGTCGGCCT 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  S  H  G  G  A  R  R  G  G  A  A  L  G  C  R  R  D  G  R  A  A  R  P  H  G  L  N  A  G  C  A  P     F1
            A  V  M  E  A  R  D  E  E  A  L  R  W  D  V  G  E  T  V  E  L  R  G  R  T  V  S  T  Q  V  A  R  P    F2
          P  Q  S  W  R  R  A  T  R  R  R  C  A  G  M  S  A  R  R  S  S  C  A  A  A  R  S  Q  R  R  L  R  A  R   F3
      501 CCGCAGTCATGGAGGCGCGCGACGAGGAGGCGCTGCGCTGGGATGTCGGCGAGACGGTCGAGCTGCGCGGCCGCACGGTCTCAACGCAGGTTGCGCGCCC 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          A  S  R  L  S  R  L  L  R  S  L  F  R  G  R  L  F  S  R  S  L  L  G  S  L  R  G  C  L  F  S  P  L  H   F1
           R  H  G  *  V  A  F  F  A  A  F  F  A  G  A  F  L  A  G  A  F  L  A  A  F  A  G  A  F  L  A  R  F     F2
            V  T  A  K  S  P  S  S  Q  P  F  S  R  A  P  F  *  P  E  P  S  W  Q  P  S  R  V  P  F  *  P  A  S    F3
      601 GCGTCACGGCTAAGTCGCCTTCTTCGCAGCCTTTTTCGCGGGCGCCTTTTTAGCCGGAGCCTTCTTGGCAGCCTTCGCGGGTGCCTTTTTAGCCCGCTTC 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  P  T                                                                                              F1
          T  G  P  X                                                                                             F2
           P  A  H                                                                                               F3
      701 ACCGGCCCAC 710
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