pta allele sequence: id-546

Contig position

sequence bin id
9877
contig length
123855
start
61341
end
61826
length
486
orientation
forward
complete
yes
Options

Sequence

CCGTGAGGCC ACCAGCTTCA TGGTCGCGGG CATGACAGCC GAACATTGCC TGGAGCGGCT CAAGGAGGGC CAGGCCGTCA TCTTCCCCGC GGACCGCTCG GACGTACTAC TGGCCGTGGC AAGCGCGCAT GTGGCAGAAG GCTTTCCGTC GCTATCGGCC ATCATCTTGA ACGGTGGGCT CAAGCTGCAC CCGCGCATCG CAGATCTGGT GGACGGTATC GGGCTGCGGT TGCCGATCAT CGAGACGGAC TCCGGCACCT TCGAGACCGC GAGCGCGGCC GCGCATGCGC GTGGCCGGGT GACGGTGGCT TCTGCGCGCA AGATCGATAC CGCGCTCGCG CTGATGGACA GGTACGTGGA TGGCGCGGAT CTCGTTGCGC AGCTCGCTAT CCCGATACCG TCGGTTACCA CGCCGCAGAT GTTCGAGTAC CAGCTGCTGG ACCGGGCACG CGACAACCGC AAGCGCATCG TGTTGCCCGA GGGCGACGAC GACAGGATTC TCAAGGCCGC CGGCCGGCTA TTGCAGCGTC AGGTCGCCGA CCTGACGATC CTGGGCGAAG AGGCCGAAAT CCGCTCCCGT GCCGCCGAGC TCGGTGTCGA CATCTCGAAC GCGCTCGTTG TCAGTCCCAA GACCAGCGAT CTGGCCGAGA AGTTCGCGGA CCAGTACTTC GAGCTGCGTA AGCACA

Translation


          P  *  G  H  Q  L  H  G  R  G  H  D  S  R  T  L  P  G  A  A  Q  G  G  P  G  R  H  L  P  R  G  P  L  G   F1
           R  E  A  T  S  F  M  V  A  G  M  T  A  E  H  C  L  E  R  L  K  E  G  Q  A  V  I  F  P  A  D  R  S     F2
            V  R  P  P  A  S  W  S  R  A  *  Q  P  N  I  A  W  S  G  S  R  R  A  R  P  S  S  S  P  R  T  A  R    F3
        1 CCGTGAGGCCACCAGCTTCATGGTCGCGGGCATGACAGCCGAACATTGCCTGGAGCGGCTCAAGGAGGGCCAGGCCGTCATCTTCCCCGCGGACCGCTCG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  T  T  G  R  G  K  R  A  C  G  R  R  L  S  V  A  I  G  H  H  L  E  R  W  A  Q  A  A  P  A  H  R    F1
          D  V  L  L  A  V  A  S  A  H  V  A  E  G  F  P  S  L  S  A  I  I  L  N  G  G  L  K  L  H  P  R  I  A   F2
           T  Y  Y  W  P  W  Q  A  R  M  W  Q  K  A  F  R  R  Y  R  P  S  S  *  T  V  G  S  S  C  T  R  A  S     F3
      101 GACGTACTACTGGCCGTGGCAAGCGCGCATGTGGCAGAAGGCTTTCCGTCGCTATCGGCCATCATCTTGAACGGTGGGCTCAAGCTGCACCCGCGCATCG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  S  G  G  R  Y  R  A  A  V  A  D  H  R  D  G  L  R  H  L  R  D  R  E  R  G  R  A  C  A  W  P  G     F1
            D  L  V  D  G  I  G  L  R  L  P  I  I  E  T  D  S  G  T  F  E  T  A  S  A  A  A  H  A  R  G  R  V    F2
          Q  I  W  W  T  V  S  G  C  G  C  R  S  S  R  R  T  P  A  P  S  R  P  R  A  R  P  R  M  R  V  A  G  *   F3
      201 CAGATCTGGTGGACGGTATCGGGCTGCGGTTGCCGATCATCGAGACGGACTCCGGCACCTTCGAGACCGCGAGCGCGGCCGCGCATGCGCGTGGCCGGGT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          D  G  G  F  C  A  Q  D  R  Y  R  A  R  A  D  G  Q  V  R  G  W  R  G  S  R  C  A  A  R  Y  P  D  T  V   F1
           T  V  A  S  A  R  K  I  D  T  A  L  A  L  M  D  R  Y  V  D  G  A  D  L  V  A  Q  L  A  I  P  I  P     F2
            R  W  L  L  R  A  R  S  I  P  R  S  R  *  W  T  G  T  W  M  A  R  I  S  L  R  S  S  L  S  R  Y  R    F3
      301 GACGGTGGCTTCTGCGCGCAAGATCGATACCGCGCTCGCGCTGATGGACAGGTACGTGGATGGCGCGGATCTCGTTGCGCAGCTCGCTATCCCGATACCG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  Y  H  A  A  D  V  R  V  P  A  A  G  P  G  T  R  Q  P  Q  A  H  R  V  A  R  G  R  R  R  Q  D  S    F1
          S  V  T  T  P  Q  M  F  E  Y  Q  L  L  D  R  A  R  D  N  R  K  R  I  V  L  P  E  G  D  D  D  R  I  L   F2
           R  L  P  R  R  R  C  S  S  T  S  C  W  T  G  H  A  T  T  A  S  A  S  C  C  P  R  A  T  T  T  G  F     F3
      401 TCGGTTACCACGCCGCAGATGTTCGAGTACCAGCTGCTGGACCGGGCACGCGACAACCGCAAGCGCATCGTGTTGCCCGAGGGCGACGACGACAGGATTC 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           Q  G  R  R  P  A  I  A  A  S  G  R  R  P  D  D  P  G  R  R  G  R  N  P  L  P  C  R  R  A  R  C  R     F1
            K  A  A  G  R  L  L  Q  R  Q  V  A  D  L  T  I  L  G  E  E  A  E  I  R  S  R  A  A  E  L  G  V  D    F2
          S  R  P  P  A  G  Y  C  S  V  R  S  P  T  *  R  S  W  A  K  R  P  K  S  A  P  V  P  P  S  S  V  S  T   F3
      501 TCAAGGCCGCCGGCCGGCTATTGCAGCGTCAGGTCGCCGACCTGACGATCCTGGGCGAAGAGGCCGAAATCCGCTCCCGTGCCGCCGAGCTCGGTGTCGA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          H  L  E  R  A  R  C  Q  S  Q  D  Q  R  S  G  R  E  V  R  G  P  V  L  R  A  A  *  A  X                  F1
           I  S  N  A  L  V  V  S  P  K  T  S  D  L  A  E  K  F  A  D  Q  Y  F  E  L  R  K  H  X                 F2
            S  R  T  R  S  L  S  V  P  R  P  A  I  W  P  R  S  S  R  T  S  T  S  S  C  V  S  T                   F3
      601 CATCTCGAACGCGCTCGTTGTCAGTCCCAAGACCAGCGATCTGGCCGAGAAGTTCGCGGACCAGTACTTCGAGCTGCGTAAGCACA 686
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