cpn60 (cpn60) allele sequence: id-225
Contig position
- sequence bin id
- 11259
- contig length
- 102880
- start
- 3912
- end
- 4214
- length
- 303
- orientation
- forward
- complete
- yes
Sequence
GGTTAAAGAA GTTGCTTCTA AAACCAATGA TGTGGCTGGC GACGGCACAA CCACCGCAAC CGTGTTGGCG CAAGCGATTG TTGCTGAAGG CATGAAATAC GTTACCGCAG GCATGAATCC TACCGATTTG AAACGCGGTA TTGACAAAGC AGTGGCGGCT TTGGTTGGCG AATTGGCAAA CATCGCGAAA CCTTGCGAAA CATACGAGCA AATCGCTCAA GTGGGCGCGA TTTCTGCGAA CTCTGACGAG CAAGTTGGCA AAATCATTGC AGACGCGATG CAAGAAGTCG GCAAAGAGGG CGTGATTACC GTTGAAGACG GCAAATCATT GGAAAACGAG TTGGAAGTGG TTAAAGGTAT GCAATTTGAC CGTGGCTACT TGTCGCCTTA TTTCGTGAAT GATTTGGAAA AACAAATCGC TGGTTTGGAC AGCCCATTTG TGTTGTTGTT TGACAAAAAA ATCAGCAATA TCCGTGATTT GTTGCCTGTT TTGGAACAAG TGG
Translation
G * R S C F * N Q * C G W R R H N H R N R V G A S D C C * R H E I R F1
V K E V A S K T N D V A G D G T T T A T V L A Q A I V A E G M K Y F2
L K K L L L K P M M W L A T A Q P P Q P C W R K R L L L K A * N T F3
1 GGTTAAAGAAGTTGCTTCTAAAACCAATGATGTGGCTGGCGACGGCACAACCACCGCAACCGTGTTGGCGCAAGCGATTGTTGCTGAAGGCATGAAATAC 100
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Y R R H E S Y R F E T R Y * Q S S G G F G W R I G K H R E T L R N F1
V T A G M N P T D L K R G I D K A V A A L V G E L A N I A K P C E T F2
L P Q A * I L P I * N A V L T K Q W R L W L A N W Q T S R N L A K F3
101 GTTACCGCAGGCATGAATCCTACCGATTTGAAACGCGGTATTGACAAAGCAGTGGCGGCTTTGGTTGGCGAATTGGCAAACATCGCGAAACCTTGCGAAA 200
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I R A N R S S G R D F C E L * R A S W Q N H C R R D A R S R Q R G F1
Y E Q I A Q V G A I S A N S D E Q V G K I I A D A M Q E V G K E G F2
H T S K S L K W A R F L R T L T S K L A K S L Q T R C K K S A K R A F3
201 CATACGAGCAAATCGCTCAAGTGGGCGCGATTTCTGCGAACTCTGACGAGCAAGTTGGCAAAATCATTGCAGACGCGATGCAAGAAGTCGGCAAAGAGGG 300
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R D Y R * R R Q I I G K R V G S G * R Y A I * P W L L V A L F R E * F1
V I T V E D G K S L E N E L E V V K G M Q F D R G Y L S P Y F V N F2
* L P L K T A N H W K T S W K W L K V C N L T V A T C R L I S * M F3
301 CGTGATTACCGTTGAAGACGGCAAATCATTGGAAAACGAGTTGGAAGTGGTTAAAGGTATGCAATTTGACCGTGGCTACTTGTCGCCTTATTTCGTGAAT 400
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F G K T N R W F G Q P I C V V V * Q K N Q Q Y P * F V A C F G T S F1
D L E K Q I A G L D S P F V L L F D K K I S N I R D L L P V L E Q V F2
I W K N K S L V W T A H L C C C L T K K S A I S V I C C L F W N K F3
401 GATTTGGAAAAACAAATCGCTGGTTTGGACAGCCCATTTGTGTTGTTGTTTGACAAAAAAATCAGCAATATCCGTGATTTGTTGCCTGTTTTGGAACAAG 500
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G F1
X F2
W F3
501 TGG 503
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