abcZ (abcZ) allele sequence: id-225

Contig position

sequence bin id
11243
contig length
27056
start
6257
end
6709
length
453
orientation
reverse
complete
yes
Options

Sequence

TGGTCAAATC ATCGTGCAAA ACGGCATGAA AATTGTCTAT GTGCCGCAAG AAAGCGTGTT TGATGACCAA GCGAGCGTGT TTGATGTCGT GTCGCAAGGT TTGGGCGATT TGCGCGATGT GTTGCGCCGT TATCATCAGG TTAGCCACGC GCTAGAAACG CAGCATTCTG ATGATTTAAT TCGCCAACTC AATGAATTAC AAAATGAAAT TGAATCGCAG GACGGCTGGC AGTTTGACGC GGCAATCCGC CAAACGATTA GCGAATTGGG GCTGCCTGAA AATGAATGGA TTGGCAACTT GTCGGGTGGT CAGAAAAAAC GTGTGGCGTT GGCGCAAGCG TGGGTGCAAA AACCCGATAT TTTGTTGCTG GACGAACCGA CTAACCATTT GGATATTAAC GCGATTATTT GGCTGGAAAA TTTGTTGCAA ACGTTTTCAG GCAGCATGGT GGTGATTACG CACGACCGCC GTTTTTTGGA CAACATCGCC AATCGGATTG TGGAATTAGA CAGGGGCGTG TTGCGTTCGT ACGAAGGCAG TTTCAGCAAA TACAGCGAGA AAAAGGCGCA AGAATTGGCG GTTGAGGCGG AACACAATCG CTTGTTTGAC AAATTTCACG CGCAGGAAGA AGTGTGGATT CGCAAGGGCA TTG

Translation


          W  S  N  H  R  A  K  R  H  E  N  C  L  C  A  A  R  K  R  V  *  *  P  S  E  R  V  *  C  R  V  A  R  F   F1
           G  Q  I  I  V  Q  N  G  M  K  I  V  Y  V  P  Q  E  S  V  F  D  D  Q  A  S  V  F  D  V  V  S  Q  G     F2
            V  K  S  S  C  K  T  A  *  K  L  S  M  C  R  K  K  A  C  L  M  T  K  R  A  C  L  M  S  C  R  K  V    F3
        1 TGGTCAAATCATCGTGCAAAACGGCATGAAAATTGTCTATGTGCCGCAAGAAAGCGTGTTTGATGACCAAGCGAGCGTGTTTGATGTCGTGTCGCAAGGT 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  R  F  A  R  C  V  A  P  L  S  S  G  *  P  R  A  R  N  A  A  F  *  *  F  N  S  P  T  Q  *  I  T    F1
          L  G  D  L  R  D  V  L  R  R  Y  H  Q  V  S  H  A  L  E  T  Q  H  S  D  D  L  I  R  Q  L  N  E  L  Q   F2
           W  A  I  C  A  M  C  C  A  V  I  I  R  L  A  T  R  *  K  R  S  I  L  M  I  *  F  A  N  S  M  N  Y     F3
      101 TTGGGCGATTTGCGCGATGTGTTGCGCCGTTATCATCAGGTTAGCCACGCGCTAGAAACGCAGCATTCTGATGATTTAATTCGCCAACTCAATGAATTAC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           K  *  N  *  I  A  G  R  L  A  V  *  R  G  N  P  P  N  D  *  R  I  G  A  A  *  K  *  M  D  W  Q  L     F1
            N  E  I  E  S  Q  D  G  W  Q  F  D  A  A  I  R  Q  T  I  S  E  L  G  L  P  E  N  E  W  I  G  N  L    F2
          K  M  K  L  N  R  R  T  A  G  S  L  T  R  Q  S  A  K  R  L  A  N  W  G  C  L  K  M  N  G  L  A  T  C   F3
      201 AAAATGAAATTGAATCGCAGGACGGCTGGCAGTTTGACGCGGCAATCCGCCAAACGATTAGCGAATTGGGGCTGCCTGAAAATGAATGGATTGGCAACTT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          V  G  W  S  E  K  T  C  G  V  G  A  S  V  G  A  K  T  R  Y  F  V  A  G  R  T  D  *  P  F  G  Y  *  R   F1
           S  G  G  Q  K  K  R  V  A  L  A  Q  A  W  V  Q  K  P  D  I  L  L  L  D  E  P  T  N  H  L  D  I  N     F2
            R  V  V  R  K  N  V  W  R  W  R  K  R  G  C  K  N  P  I  F  C  C  W  T  N  R  L  T  I  W  I  L  T    F3
      301 GTCGGGTGGTCAGAAAAAACGTGTGGCGTTGGCGCAAGCGTGGGTGCAAAAACCCGATATTTTGTTGCTGGACGAACCGACTAACCATTTGGATATTAAC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            D  Y  L  A  G  K  F  V  A  N  V  F  R  Q  H  G  G  D  Y  A  R  P  P  F  F  G  Q  H  R  Q  S  D  C    F1
          A  I  I  W  L  E  N  L  L  Q  T  F  S  G  S  M  V  V  I  T  H  D  R  R  F  L  D  N  I  A  N  R  I  V   F2
           R  L  F  G  W  K  I  C  C  K  R  F  Q  A  A  W  W  *  L  R  T  T  A  V  F  W  T  T  S  P  I  G  L     F3
      401 GCGATTATTTGGCTGGAAAATTTGTTGCAAACGTTTTCAGGCAGCATGGTGGTGATTACGCACGACCGCCGTTTTTTGGACAACATCGCCAATCGGATTG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  I  R  Q  G  R  V  A  F  V  R  R  Q  F  Q  Q  I  Q  R  E  K  G  A  R  I  G  G  *  G  G  T  Q  S     F1
            E  L  D  R  G  V  L  R  S  Y  E  G  S  F  S  K  Y  S  E  K  K  A  Q  E  L  A  V  E  A  E  H  N  R    F2
          W  N  *  T  G  A  C  C  V  R  T  K  A  V  S  A  N  T  A  R  K  R  R  K  N  W  R  L  R  R  N  T  I  A   F3
      501 TGGAATTAGACAGGGGCGTGTTGCGTTCGTACGAAGGCAGTTTCAGCAAATACAGCGAGAAAAAGGCGCAAGAATTGGCGGTTGAGGCGGAACACAATCG 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          L  V  *  Q  I  S  R  A  G  R  S  V  D  S  Q  G  H  X                                                   F1
           L  F  D  K  F  H  A  Q  E  E  V  W  I  R  K  G  I  X                                                  F2
            C  L  T  N  F  T  R  R  K  K  C  G  F  A  R  A  L                                                    F3
      601 CTTGTTTGACAAATTTCACGCGCAGGAAGAAGTGTGGATTCGCAAGGGCATTG 653
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|---