abcZ (abcZ) allele sequence: id-224

Contig position

sequence bin id
11141
contig length
90380
start
31304
end
31756
length
453
orientation
reverse
complete
yes
Options

Sequence

CGGTCAAATC ATCGTGCAAA ACGGCATGAA AATTGTCTAT GTGCCGCAAG AAAGCGTGTT TGACGACCAA GCGAGCGTGT TTGATGTCGT GTCGCAAGGT TTGGGCGATT TGCGCGATGT GTTGCGCCGT TATCATCAGG TTAGTCACGC GCTGGAAACG CAGCATTCTG ATGATTTAAT TCGCCAACTC AATGAGTTAC AAAATGAAAT TGAATCGCAG GACGGCTGGC AGTTTGACGC GGCAATCCGC CAAACGATTA GCGAATTGGG GCTGCCTGAA AATGAATGGA TTGGCAACTT GTCGGGCGGT CAGAAAAAAC GCGTAGCGTT GGCGCAAGCG TGGGTGCAAA AACCCGATAT TTTGCTATTG GACGAACCAA CTAACCACTT GGATATTAAC GCGATTATTT GGCTGGAAAA TTTGTTGCAA GCGTTTTCAG GCAGCATGGT GGTGATTACG CACGACCGCC GTTTTTTGGA CAACATCGCC AATCGGATTG TGGAATTGGA TAGGGGCGTG TTGCGTTCGT ACGAGGGCAG TTTCAGCAAA TACAGCGAGA AAAAGGCGCA GGAATTGGCG GTTGAGGCGG AACACAATCG CCTGTTTGAC AAATTTCACG CGCAGGAAGA AGTGTGGATT CGCAAAGGCA TTG

Translation


          R  S  N  H  R  A  K  R  H  E  N  C  L  C  A  A  R  K  R  V  *  R  P  S  E  R  V  *  C  R  V  A  R  F   F1
           G  Q  I  I  V  Q  N  G  M  K  I  V  Y  V  P  Q  E  S  V  F  D  D  Q  A  S  V  F  D  V  V  S  Q  G     F2
            V  K  S  S  C  K  T  A  *  K  L  S  M  C  R  K  K  A  C  L  T  T  K  R  A  C  L  M  S  C  R  K  V    F3
        1 CGGTCAAATCATCGTGCAAAACGGCATGAAAATTGTCTATGTGCCGCAAGAAAGCGTGTTTGACGACCAAGCGAGCGTGTTTGATGTCGTGTCGCAAGGT 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  R  F  A  R  C  V  A  P  L  S  S  G  *  S  R  A  G  N  A  A  F  *  *  F  N  S  P  T  Q  *  V  T    F1
          L  G  D  L  R  D  V  L  R  R  Y  H  Q  V  S  H  A  L  E  T  Q  H  S  D  D  L  I  R  Q  L  N  E  L  Q   F2
           W  A  I  C  A  M  C  C  A  V  I  I  R  L  V  T  R  W  K  R  S  I  L  M  I  *  F  A  N  S  M  S  Y     F3
      101 TTGGGCGATTTGCGCGATGTGTTGCGCCGTTATCATCAGGTTAGTCACGCGCTGGAAACGCAGCATTCTGATGATTTAATTCGCCAACTCAATGAGTTAC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           K  *  N  *  I  A  G  R  L  A  V  *  R  G  N  P  P  N  D  *  R  I  G  A  A  *  K  *  M  D  W  Q  L     F1
            N  E  I  E  S  Q  D  G  W  Q  F  D  A  A  I  R  Q  T  I  S  E  L  G  L  P  E  N  E  W  I  G  N  L    F2
          K  M  K  L  N  R  R  T  A  G  S  L  T  R  Q  S  A  K  R  L  A  N  W  G  C  L  K  M  N  G  L  A  T  C   F3
      201 AAAATGAAATTGAATCGCAGGACGGCTGGCAGTTTGACGCGGCAATCCGCCAAACGATTAGCGAATTGGGGCTGCCTGAAAATGAATGGATTGGCAACTT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          V  G  R  S  E  K  T  R  S  V  G  A  S  V  G  A  K  T  R  Y  F  A  I  G  R  T  N  *  P  L  G  Y  *  R   F1
           S  G  G  Q  K  K  R  V  A  L  A  Q  A  W  V  Q  K  P  D  I  L  L  L  D  E  P  T  N  H  L  D  I  N     F2
            R  A  V  R  K  N  A  *  R  W  R  K  R  G  C  K  N  P  I  F  C  Y  W  T  N  Q  L  T  T  W  I  L  T    F3
      301 GTCGGGCGGTCAGAAAAAACGCGTAGCGTTGGCGCAAGCGTGGGTGCAAAAACCCGATATTTTGCTATTGGACGAACCAACTAACCACTTGGATATTAAC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            D  Y  L  A  G  K  F  V  A  S  V  F  R  Q  H  G  G  D  Y  A  R  P  P  F  F  G  Q  H  R  Q  S  D  C    F1
          A  I  I  W  L  E  N  L  L  Q  A  F  S  G  S  M  V  V  I  T  H  D  R  R  F  L  D  N  I  A  N  R  I  V   F2
           R  L  F  G  W  K  I  C  C  K  R  F  Q  A  A  W  W  *  L  R  T  T  A  V  F  W  T  T  S  P  I  G  L     F3
      401 GCGATTATTTGGCTGGAAAATTTGTTGCAAGCGTTTTCAGGCAGCATGGTGGTGATTACGCACGACCGCCGTTTTTTGGACAACATCGCCAATCGGATTG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  I  G  *  G  R  V  A  F  V  R  G  Q  F  Q  Q  I  Q  R  E  K  G  A  G  I  G  G  *  G  G  T  Q  S     F1
            E  L  D  R  G  V  L  R  S  Y  E  G  S  F  S  K  Y  S  E  K  K  A  Q  E  L  A  V  E  A  E  H  N  R    F2
          W  N  W  I  G  A  C  C  V  R  T  R  A  V  S  A  N  T  A  R  K  R  R  R  N  W  R  L  R  R  N  T  I  A   F3
      501 TGGAATTGGATAGGGGCGTGTTGCGTTCGTACGAGGGCAGTTTCAGCAAATACAGCGAGAAAAAGGCGCAGGAATTGGCGGTTGAGGCGGAACACAATCG 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  V  *  Q  I  S  R  A  G  R  S  V  D  S  Q  R  H  X                                                   F1
           L  F  D  K  F  H  A  Q  E  E  V  W  I  R  K  G  I  X                                                  F2
            C  L  T  N  F  T  R  R  K  K  C  G  F  A  K  A  L                                                    F3
      601 CCTGTTTGACAAATTTCACGCGCAGGAAGAAGTGTGGATTCGCAAAGGCATTG 653
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