aroE (aroE) allele sequence: id-221

Contig position

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Options

Sequence

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Translation


          T  T  L  H  R  F  W  *  S  C  C  T  Q  Q  I  P  T  N  S  S  M  L  C  R  T  R  R  C  A  N  *  I  H  A   F1
           P  R  Y  T  V  F  G  N  P  V  A  H  S  K  S  P  Q  I  H  Q  C  F  A  A  Q  E  G  A  Q  I  E  Y  T     F2
            H  V  T  P  F  L  V  I  L  L  H  T  A  N  P  H  K  F  I  N  A  L  P  H  K  K  V  R  K  L  N  T  R    F3
        1 ACCACGTTACACCGTTTTTGGTAATCCTGTTGCACACAGCAAATCCCCACAAATTCATCAATGCTTTGCCGCACAAGAAGGTGCGCAAATTGAATACACG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            H  L  C  R  K  H  R  T  R  F  W  R  W  R  S  R  F  F  C  T  R  R  T  R  R  K  C  N  P  A  V  Q  R    F1
          R  T  F  A  E  N  T  A  Q  D  F  G  D  G  V  R  A  F  F  A  Q  G  G  R  G  A  N  V  T  L  P  F  K  G   F2
           A  P  L  P  K  T  P  H  K  I  L  A  M  A  F  A  L  F  L  H  K  A  D  A  A  Q  M  *  P  C  R  S  K     F3
      101 CGCACCTTTGCCGAAAACACCGCACAAGATTTTGGCGATGGCGTTCGCGCTTTTTTTGCACAAGGCGGACGCGGCGCAAATGTAACCCTGCCGTTCAAAG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           F  C  L  *  F  S  T  G  A  H  R  T  R  S  C  S  G  R  S  Q  Y  A  D  S  A  S  K  R  H  F  A  G  R     F1
            F  A  Y  D  L  V  Q  A  H  T  E  R  A  R  A  A  G  A  V  N  T  L  I  P  Q  A  N  G  T  L  L  G  D    F2
          V  L  P  M  I  *  Y  R  R  T  P  N  A  L  V  Q  R  A  Q  S  I  R  *  F  R  K  Q  T  A  L  C  W  A  T   F3
      201 GTTTTGCCTATGATTTAGTACAGGCGCACACCGAACGCGCTCGTGCAGCGGGCGCAGTCAATACGCTGATTCCGCAAGCAAACGGCACTTTGCTGGGCGA 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          Q  H  R  R  R  R  L  G  A  R  L  M  P  A  L  A  I  Q  S  T  Q  *  K  H  F  A  F  G  R  R  W  R  D  S   F1
           N  T  D  G  E  G  L  V  R  D  L  C  Q  H  L  Q  F  N  L  H  N  K  N  I  L  L  L  G  A  G  G  A  T     F2
            T  P  T  A  K  A  W  C  A  T  Y  A  S  T  C  N  S  I  Y  T  I  K  T  F  C  F  W  A  Q  V  A  R  L    F3
      301 CAACACCGACGGCGAAGGCTTGGTGCGCGACTTATGCCAGCACTTGCAATTCAATCTACACAATAAAAACATTTTGCTTTTGGGCGCAGGTGGCGCGACT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            W  R  G  F  A  A  S  S  L  Q  S  C  Q  H  H  H  C  Q  S  H  T  R  *  S  H  *  I  G  S  V  V  *  Y    F1
          R  G  V  V  L  P  L  A  A  C  N  P  A  S  I  T  I  A  N  R  T  H  D  K  A  I  E  L  A  Q  L  F  D  I   F2
           V  A  W  F  C  R  *  Q  P  A  I  L  P  A  S  P  L  P  I  A  H  T  I  K  P  L  N  W  L  S  C  L  I     F3
      401 CGTGGCGTGGTTTTGCCGCTAGCAGCCTGCAATCCTGCCAGCATCACCATTGCCAATCGCACACACGATAAAGCCATTGAATTGGCTCAGTTGTTTGATA 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           C  R  S  A  L  L  S  I  K  S  I  L  *  H  Y  Y  Q  R  N  I  G  *  H  R  R  *  H  S  R  C  I  A  R     F1
            A  A  L  P  F  Y  Q  L  N  Q  S  Y  D  I  I  I  N  A  T  S  G  S  I  D  D  S  I  P  D  V  S  P  D    F2
          L  P  L  C  P  F  I  N  *  I  N  L  M  T  L  L  S  T  Q  H  R  V  A  *  T  I  A  F  Q  M  Y  R  P  I   F3
      501 TTGCCGCTCTGCCCTTTTATCAATTAAATCAATCTTATGACATTATTATCAACGCAACATCGGGTAGCATAGACGATAGCATTCCAGATGTATCGCCCGA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          Y  F  C  K  L  L  V  G  I  R  Y  V  L  C  E  P  A  H  R  V  H  A  I  C  R  A  T  W  R  T  A  N  I  *   F1
           I  F  A  S  C  S  L  A  Y  D  M  F  Y  A  N  Q  P  T  A  F  M  Q  F  A  A  Q  H  G  A  Q  Q  T  S     F2
            F  L  Q  A  A  R  W  H  T  I  C  F  M  R  T  S  P  P  R  S  C  N  L  P  R  N  M  A  H  S  K  H  L    F3
      601 TATTTTTGCAAGCTGCTCGTTGGCATACGATATGTTTTATGCGAACCAGCCCACCGCGTTCATGCAATTTGCCGCGCAACATGGCGCACAGCAAACATCT 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  L  G  Y  V  G                                                                                     F1
          D  G  L  G  M  L  X                                                                                    F2
           T  A  W  V  C  W                                                                                      F3
      701 GACGGCTTGGGTATGTTGG 719
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