aroE (aroE) allele sequence: id-219

Contig position

sequence bin id
10559
contig length
5920
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76
end
594
length
519
orientation
forward
complete
yes
Options

Sequence

CCTGTTGCAC ACAGCAAATC CCCACAAATT CATCAATGCT TTGCCGCACA AGAAGGTGCG CAAATTGAAT ACACGCGCAC CTTTGCCGAA AACACCGCAC AAGATTTTGG CGATGGCGTT CGCGCTTTTT TTGCACAAGG CGGACGCGGC GCAAATGTAA CCCTGCCGTT CAAAGGTTTT GCCTATGATT TAGTACAGGC GCACACCGAA CGCGCTCGTG CAGCAGGCGC AGTCAATACG CTGATTCCGC AAGCAGACGG CACTTTGTTG GGCGACAACA CCGATGGCGA AGGCTTGGTA CGCGACTTAT GCCAGCACTT GCAATTCAAT CTACACAATA AAAACATTTT GCTTTTGGGC GCAGGTGGCG CGACTCGTGG CGTGGTTTTG CCGCTAGCAG CCTGCAATCC TGCCAGCATC ACCATTGCCA ATCGCACACA CGATAAAGCC ATTGAATTGG CTCAGTTGTT TGATATTGCC GCTCTGCCCT TTCATCAATT AAATCAATCT TATGACATTA TTATCAACGC AACATCGGGT AGCATAGACG ATAGCATTCC AGATGTATCG CCCGATATTT TTGCAGGCTG CTCGTTGGCA TACGATATGT TTTATGCGAA CCAGCCCACC GCGTTCATGC AATTTGCCGC GCAACATGGC GCACAGCAAA CATCTGACGG CTTGGGTATG TTGG

Translation


          P  V  A  H  S  K  S  P  Q  I  H  Q  C  F  A  A  Q  E  G  A  Q  I  E  Y  T  R  T  F  A  E  N  T  A  Q   F1
           L  L  H  T  A  N  P  H  K  F  I  N  A  L  P  H  K  K  V  R  K  L  N  T  R  A  P  L  P  K  T  P  H     F2
            C  C  T  Q  Q  I  P  T  N  S  S  M  L  C  R  T  R  R  C  A  N  *  I  H  A  H  L  C  R  K  H  R  T    F3
        1 CCTGTTGCACACAGCAAATCCCCACAAATTCATCAATGCTTTGCCGCACAAGAAGGTGCGCAAATTGAATACACGCGCACCTTTGCCGAAAACACCGCAC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            D  F  G  D  G  V  R  A  F  F  A  Q  G  G  R  G  A  N  V  T  L  P  F  K  G  F  A  Y  D  L  V  Q  A    F1
          K  I  L  A  M  A  F  A  L  F  L  H  K  A  D  A  A  Q  M  *  P  C  R  S  K  V  L  P  M  I  *  Y  R  R   F2
           R  F  W  R  W  R  S  R  F  F  C  T  R  R  T  R  R  K  C  N  P  A  V  Q  R  F  C  L  *  F  S  T  G     F3
      101 AAGATTTTGGCGATGGCGTTCGCGCTTTTTTTGCACAAGGCGGACGCGGCGCAAATGTAACCCTGCCGTTCAAAGGTTTTGCCTATGATTTAGTACAGGC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           H  T  E  R  A  R  A  A  G  A  V  N  T  L  I  P  Q  A  D  G  T  L  L  G  D  N  T  D  G  E  G  L  V     F1
            T  P  N  A  L  V  Q  Q  A  Q  S  I  R  *  F  R  K  Q  T  A  L  C  W  A  T  T  P  M  A  K  A  W  Y    F2
          A  H  R  T  R  S  C  S  R  R  S  Q  Y  A  D  S  A  S  R  R  H  F  V  G  R  Q  H  R  W  R  R  L  G  T   F3
      201 GCACACCGAACGCGCTCGTGCAGCAGGCGCAGTCAATACGCTGATTCCGCAAGCAGACGGCACTTTGTTGGGCGACAACACCGATGGCGAAGGCTTGGTA 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          R  D  L  C  Q  H  L  Q  F  N  L  H  N  K  N  I  L  L  L  G  A  G  G  A  T  R  G  V  V  L  P  L  A  A   F1
           A  T  Y  A  S  T  C  N  S  I  Y  T  I  K  T  F  C  F  W  A  Q  V  A  R  L  V  A  W  F  C  R  *  Q     F2
            R  L  M  P  A  L  A  I  Q  S  T  Q  *  K  H  F  A  F  G  R  R  W  R  D  S  W  R  G  F  A  A  S  S    F3
      301 CGCGACTTATGCCAGCACTTGCAATTCAATCTACACAATAAAAACATTTTGCTTTTGGGCGCAGGTGGCGCGACTCGTGGCGTGGTTTTGCCGCTAGCAG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            C  N  P  A  S  I  T  I  A  N  R  T  H  D  K  A  I  E  L  A  Q  L  F  D  I  A  A  L  P  F  H  Q  L    F1
          P  A  I  L  P  A  S  P  L  P  I  A  H  T  I  K  P  L  N  W  L  S  C  L  I  L  P  L  C  P  F  I  N  *   F2
           L  Q  S  C  Q  H  H  H  C  Q  S  H  T  R  *  S  H  *  I  G  S  V  V  *  Y  C  R  S  A  L  S  S  I     F3
      401 CCTGCAATCCTGCCAGCATCACCATTGCCAATCGCACACACGATAAAGCCATTGAATTGGCTCAGTTGTTTGATATTGCCGCTCTGCCCTTTCATCAATT 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           N  Q  S  Y  D  I  I  I  N  A  T  S  G  S  I  D  D  S  I  P  D  V  S  P  D  I  F  A  G  C  S  L  A     F1
            I  N  L  M  T  L  L  S  T  Q  H  R  V  A  *  T  I  A  F  Q  M  Y  R  P  I  F  L  Q  A  A  R  W  H    F2
          K  S  I  L  *  H  Y  Y  Q  R  N  I  G  *  H  R  R  *  H  S  R  C  I  A  R  Y  F  C  R  L  L  V  G  I   F3
      501 AAATCAATCTTATGACATTATTATCAACGCAACATCGGGTAGCATAGACGATAGCATTCCAGATGTATCGCCCGATATTTTTGCAGGCTGCTCGTTGGCA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          Y  D  M  F  Y  A  N  Q  P  T  A  F  M  Q  F  A  A  Q  H  G  A  Q  Q  T  S  D  G  L  G  M  L  X         F1
           T  I  C  F  M  R  T  S  P  P  R  S  C  N  L  P  R  N  M  A  H  S  K  H  L  T  A  W  V  C  W           F2
            R  Y  V  L  C  E  P  A  H  R  V  H  A  I  C  R  A  T  W  R  T  A  N  I  *  R  L  G  Y  V  G          F3
      601 TACGATATGTTTTATGCGAACCAGCCCACCGCGTTCATGCAATTTGCCGCGCAACATGGCGCACAGCAAACATCTGACGGCTTGGGTATGTTGG 694
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