gdh (gdh) allele sequence: id-216
Contig position
- sequence bin id
- 10135
- contig length
- 59252
- start
- 36075
- end
- 36650
- length
- 576
- orientation
- reverse
- complete
- yes
Sequence
ATCGGTGCAA ATCACGGTGG CAGAACAACT GGGCGTGGAA GAGCGCGGCG AGTTTTATGA CATCACAGGC GCATTGCGCG ACATGATGCA AAACCACATC ATGCAAATGC TGTGTTTTGT GGCAATGGAA CAACCCAAAT CGTTGAGCGC AGACGATGTA CGCGATGAAA AATTGAAAGT GGTGGCTGCG CTCAAACCGA TGACTTCGGC AGATGTAGAT AAAAACGTGA TTCGCGCACA ATATGTGGCA AACGGCGAGC AAAACGGCTA TTTGCAAGAA CACAATGTGC CAGCCGACAG CCGCACCGAA ACCTATGTTG CCATTCGCGC CGAAATTGAT ACGCCACGTT GGGCAGGCGT GCCGTTTTAT TTGCGTACAG GCAAACGCTT GGCAACGCGC ACAGCAGAAA TTGTTTTGAA TTTCAAAGAC CAAGCCAATG GTTTGTTTGG CACAAATCCT AATCGTTTGG TGATTTCGTT GCAGCCTGAT GAAACCGTAT CGCTCAAATT GTATGTGAAA CAAGTGGGCA GCGGCTTGGA CGTGCAGCCA ACCGAAATGG TGTTGGACAT GGGCACAGTG TCAGACGAAC GCCGCGCCGA AGCGTATGAA TTGCTGTTGC GCGAAGTGAT TGACGGACGT TTGAGCTTGT TCAATCGCCG CGACGAGCTG GAAAAAGCGT GGGAATGGGT CATGCCAATT TTGGACAACT GGGCAACTTC GCCTGTTGCA CCAGCCACTT ACGCTGCATC TAGCTGGGGG CCAAAAGAAG CGCAAG
Translation
I G A N H G G R T T G R G R A R R V L * H H R R I A R H D A K P H H F1
S V Q I T V A E Q L G V E E R G E F Y D I T G A L R D M M Q N H I F2
R C K S R W Q N N W A W K S A A S F M T S Q A H C A T * C K T T S F3
1 ATCGGTGCAAATCACGGTGGCAGAACAACTGGGCGTGGAAGAGCGCGGCGAGTTTTATGACATCACAGGCGCATTGCGCGACATGATGCAAAACCACATC 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
A N A V F C G N G T T Q I V E R R R C T R * K I E S G G C A Q T D F1
M Q M L C F V A M E Q P K S L S A D D V R D E K L K V V A A L K P M F2
C K C C V L W Q W N N P N R * A Q T M Y A M K N * K W W L R S N R F3
101 ATGCAAATGCTGTGTTTTGTGGCAATGGAACAACCCAAATCGTTGAGCGCAGACGATGTACGCGATGAAAAATTGAAAGTGGTGGCTGCGCTCAAACCGA 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
D F G R C R * K R D S R T I C G K R R A K R L F A R T Q C A S R Q F1
T S A D V D K N V I R A Q Y V A N G E Q N G Y L Q E H N V P A D S F2
* L R Q M * I K T * F A H N M W Q T A S K T A I C K N T M C Q P T A F3
201 TGACTTCGGCAGATGTAGATAAAAACGTGATTCGCGCACAATATGTGGCAAACGGCGAGCAAAACGGCTATTTGCAAGAACACAATGTGCCAGCCGACAG 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
P H R N L C C H S R R N * Y A T L G R R A V L F A Y R Q T L G N A H F1
R T E T Y V A I R A E I D T P R W A G V P F Y L R T G K R L A T R F2
A P K P M L P F A P K L I R H V G Q A C R F I C V Q A N A W Q R A F3
301 CCGCACCGAAACCTATGTTGCCATTCGCGCCGAAATTGATACGCCACGTTGGGCAGGCGTGCCGTTTTATTTGCGTACAGGCAAACGCTTGGCAACGCGC 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
S R N C F E F Q R P S Q W F V W H K S * S F G D F V A A * * N R I F1
T A E I V L N F K D Q A N G L F G T N P N R L V I S L Q P D E T V S F2
Q Q K L F * I S K T K P M V C L A Q I L I V W * F R C S L M K P Y F3
401 ACAGCAGAAATTGTTTTGAATTTCAAAGACCAAGCCAATGGTTTGTTTGGCACAAATCCTAATCGTTTGGTGATTTCGTTGCAGCCTGATGAAACCGTAT 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
A Q I V C E T S G Q R L G R A A N R N G V G H G H S V R R T P R R F1
L K L Y V K Q V G S G L D V Q P T E M V L D M G T V S D E R R A E F2
R S N C M * N K W A A A W T C S Q P K W C W T W A Q C Q T N A A P K F3
501 CGCTCAAATTGTATGTGAAACAAGTGGGCAGCGGCTTGGACGTGCAGCCAACCGAAATGGTGTTGGACATGGGCACAGTGTCAGACGAACGCCGCGCCGA 600
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
S V * I A V A R S D * R T F E L V Q S P R R A G K S V G M G H A N F F1
A Y E L L L R E V I D G R L S L F N R R D E L E K A W E W V M P I F2
R M N C C C A K * L T D V * A C S I A A T S W K K R G N G S C Q F F3
601 AGCGTATGAATTGCTGTTGCGCGAAGTGATTGACGGACGTTTGAGCTTGTTCAATCGCCGCGACGAGCTGGAAAAAGCGTGGGAATGGGTCATGCCAATT 700
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G Q L G N F A C C T S H L R C I * L G A K R S A X F1
L D N W A T S P V A P A T Y A A S S W G P K E A Q X F2
W T T G Q L R L L H Q P L T L H L A G G Q K K R K F3
701 TTGGACAACTGGGCAACTTCGCCTGTTGCACCAGCCACTTACGCTGCATCTAGCTGGGGGCCAAAAGAAGCGCAAG 776
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:-