cpn60 (cpn60) allele sequence: id-216
Contig position
- sequence bin id
- 10177
- contig length
- 180685
- start
- 3900
- end
- 4202
- length
- 303
- orientation
- forward
- complete
- yes
Sequence
GGTTAAAGAA GTTGCTTCTA AAACCAATGA TGTGGCTGGC GACGGCACAA CCACCGCAAC CGTGTTGGCG CAAGCGATTG TTGCTGAAGG CATGAAATAC GTTACCGCAG GCATGAACCC TACCGATTTG AAACGCGGTA TTGACAAAGC AGTGGCAGCT TTGGTTGGCG AATTGGCAAA CATCGCGAAA CCTTGCGAAA CATACGAGCA AATCGCTCAA GTGGGCGCGA TTTCTGCGAA CTCTGACGAG CAAGTTGGCA AAATCATTGC AGACGCGATG CAAGAAGTCG GCAAAGAGGG CGTGATTACC GTTGAAGACG GCAAATCATT GGAAAACGAG TTAGAAGTGG TTAAAGGTAT GCAATTTGAC CGTGGCTACT TGTCGCCTTA TTTCGTGAAT GATTTGGAAA AACAAATCGC TGGTTTGGAC AGCCCATTTG TGTTGTTGTT TGACAAAAAA ATCAGCAATA TCCGTGATTT GTTACCCGTT TTGGAACAAG TGG
Translation
G * R S C F * N Q * C G W R R H N H R N R V G A S D C C * R H E I R F1
V K E V A S K T N D V A G D G T T T A T V L A Q A I V A E G M K Y F2
L K K L L L K P M M W L A T A Q P P Q P C W R K R L L L K A * N T F3
1 GGTTAAAGAAGTTGCTTCTAAAACCAATGATGTGGCTGGCGACGGCACAACCACCGCAACCGTGTTGGCGCAAGCGATTGTTGCTGAAGGCATGAAATAC 100
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Y R R H E P Y R F E T R Y * Q S S G S F G W R I G K H R E T L R N F1
V T A G M N P T D L K R G I D K A V A A L V G E L A N I A K P C E T F2
L P Q A * T L P I * N A V L T K Q W Q L W L A N W Q T S R N L A K F3
101 GTTACCGCAGGCATGAACCCTACCGATTTGAAACGCGGTATTGACAAAGCAGTGGCAGCTTTGGTTGGCGAATTGGCAAACATCGCGAAACCTTGCGAAA 200
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I R A N R S S G R D F C E L * R A S W Q N H C R R D A R S R Q R G F1
Y E Q I A Q V G A I S A N S D E Q V G K I I A D A M Q E V G K E G F2
H T S K S L K W A R F L R T L T S K L A K S L Q T R C K K S A K R A F3
201 CATACGAGCAAATCGCTCAAGTGGGCGCGATTTCTGCGAACTCTGACGAGCAAGTTGGCAAAATCATTGCAGACGCGATGCAAGAAGTCGGCAAAGAGGG 300
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R D Y R * R R Q I I G K R V R S G * R Y A I * P W L L V A L F R E * F1
V I T V E D G K S L E N E L E V V K G M Q F D R G Y L S P Y F V N F2
* L P L K T A N H W K T S * K W L K V C N L T V A T C R L I S * M F3
301 CGTGATTACCGTTGAAGACGGCAAATCATTGGAAAACGAGTTAGAAGTGGTTAAAGGTATGCAATTTGACCGTGGCTACTTGTCGCCTTATTTCGTGAAT 400
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F G K T N R W F G Q P I C V V V * Q K N Q Q Y P * F V T R F G T S F1
D L E K Q I A G L D S P F V L L F D K K I S N I R D L L P V L E Q V F2
I W K N K S L V W T A H L C C C L T K K S A I S V I C Y P F W N K F3
401 GATTTGGAAAAACAAATCGCTGGTTTGGACAGCCCATTTGTGTTGTTGTTTGACAAAAAAATCAGCAATATCCGTGATTTGTTACCCGTTTTGGAACAAG 500
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G F1
X F2
W F3
501 TGG 503
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