abcZ (abcZ) allele sequence: id-216

Contig position

sequence bin id
10177
contig length
180685
start
139168
end
139620
length
453
orientation
reverse
complete
yes
Options

Sequence

CGGTCAAATC ATCGTGCAAA ACGGCATGAA AATTGTCTAT GTGCCACAAG AAAGCGTGTT TGACGACCAA GCGAGCGTGT TTGATGTCGT GTCGCAGGGC TTGGGCGATT TGCGCGATGT GTTGCGCCGT TATCATCAGG TTAGCCACGC GCTGGAAACG CAGCATTCTG ATGATTTAAT TCGCCAACTC AACGAGTTAC AAAATGAAAT TGAATCGCAA GACGGCTGGC AGTTTGACGC GGCAATCCGC CAAACGATTA GCGAATTGGG GCTGCCTGAA AATGAATTGA TTGGCAATCT GTCGGGTGGT CAGAAAAAAC GGGTTGCGTT GGCTCAAGCG TGGGTGCAAA AACCCGATAT TTTGTTGCTG GACGAACCGA CTAACCATTT GGATATTAAC GCGATTATTT GGCTGGAAAA TTTGTTGCAA GCGTTTTCAG GCAGCATGGT GGTGATTACG CACGACCGCC GTTTTTTGGA CAACATCGCT AATCGGATTG TGGAATTGGA TAGGGGCGTG TTGCGTTCGT ACGAAGGCAG TTTCAGCAAA TACAGCGAGA AAAAGGCGCA GGAATTGGCG GTTGAGGCGG AACACAATCG CCTGTTTGAC AAATTTCACG CGCAGGAAGA AGTGTGGATT CGCAAAGGCA TTG

Translation


          R  S  N  H  R  A  K  R  H  E  N  C  L  C  A  T  R  K  R  V  *  R  P  S  E  R  V  *  C  R  V  A  G  L   F1
           G  Q  I  I  V  Q  N  G  M  K  I  V  Y  V  P  Q  E  S  V  F  D  D  Q  A  S  V  F  D  V  V  S  Q  G     F2
            V  K  S  S  C  K  T  A  *  K  L  S  M  C  H  K  K  A  C  L  T  T  K  R  A  C  L  M  S  C  R  R  A    F3
        1 CGGTCAAATCATCGTGCAAAACGGCATGAAAATTGTCTATGTGCCACAAGAAAGCGTGTTTGACGACCAAGCGAGCGTGTTTGATGTCGTGTCGCAGGGC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  R  F  A  R  C  V  A  P  L  S  S  G  *  P  R  A  G  N  A  A  F  *  *  F  N  S  P  T  Q  R  V  T    F1
          L  G  D  L  R  D  V  L  R  R  Y  H  Q  V  S  H  A  L  E  T  Q  H  S  D  D  L  I  R  Q  L  N  E  L  Q   F2
           W  A  I  C  A  M  C  C  A  V  I  I  R  L  A  T  R  W  K  R  S  I  L  M  I  *  F  A  N  S  T  S  Y     F3
      101 TTGGGCGATTTGCGCGATGTGTTGCGCCGTTATCATCAGGTTAGCCACGCGCTGGAAACGCAGCATTCTGATGATTTAATTCGCCAACTCAACGAGTTAC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           K  *  N  *  I  A  R  R  L  A  V  *  R  G  N  P  P  N  D  *  R  I  G  A  A  *  K  *  I  D  W  Q  S     F1
            N  E  I  E  S  Q  D  G  W  Q  F  D  A  A  I  R  Q  T  I  S  E  L  G  L  P  E  N  E  L  I  G  N  L    F2
          K  M  K  L  N  R  K  T  A  G  S  L  T  R  Q  S  A  K  R  L  A  N  W  G  C  L  K  M  N  *  L  A  I  C   F3
      201 AAAATGAAATTGAATCGCAAGACGGCTGGCAGTTTGACGCGGCAATCCGCCAAACGATTAGCGAATTGGGGCTGCCTGAAAATGAATTGATTGGCAATCT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          V  G  W  S  E  K  T  G  C  V  G  S  S  V  G  A  K  T  R  Y  F  V  A  G  R  T  D  *  P  F  G  Y  *  R   F1
           S  G  G  Q  K  K  R  V  A  L  A  Q  A  W  V  Q  K  P  D  I  L  L  L  D  E  P  T  N  H  L  D  I  N     F2
            R  V  V  R  K  N  G  L  R  W  L  K  R  G  C  K  N  P  I  F  C  C  W  T  N  R  L  T  I  W  I  L  T    F3
      301 GTCGGGTGGTCAGAAAAAACGGGTTGCGTTGGCTCAAGCGTGGGTGCAAAAACCCGATATTTTGTTGCTGGACGAACCGACTAACCATTTGGATATTAAC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            D  Y  L  A  G  K  F  V  A  S  V  F  R  Q  H  G  G  D  Y  A  R  P  P  F  F  G  Q  H  R  *  S  D  C    F1
          A  I  I  W  L  E  N  L  L  Q  A  F  S  G  S  M  V  V  I  T  H  D  R  R  F  L  D  N  I  A  N  R  I  V   F2
           R  L  F  G  W  K  I  C  C  K  R  F  Q  A  A  W  W  *  L  R  T  T  A  V  F  W  T  T  S  L  I  G  L     F3
      401 GCGATTATTTGGCTGGAAAATTTGTTGCAAGCGTTTTCAGGCAGCATGGTGGTGATTACGCACGACCGCCGTTTTTTGGACAACATCGCTAATCGGATTG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  I  G  *  G  R  V  A  F  V  R  R  Q  F  Q  Q  I  Q  R  E  K  G  A  G  I  G  G  *  G  G  T  Q  S     F1
            E  L  D  R  G  V  L  R  S  Y  E  G  S  F  S  K  Y  S  E  K  K  A  Q  E  L  A  V  E  A  E  H  N  R    F2
          W  N  W  I  G  A  C  C  V  R  T  K  A  V  S  A  N  T  A  R  K  R  R  R  N  W  R  L  R  R  N  T  I  A   F3
      501 TGGAATTGGATAGGGGCGTGTTGCGTTCGTACGAAGGCAGTTTCAGCAAATACAGCGAGAAAAAGGCGCAGGAATTGGCGGTTGAGGCGGAACACAATCG 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  V  *  Q  I  S  R  A  G  R  S  V  D  S  Q  R  H  X                                                   F1
           L  F  D  K  F  H  A  Q  E  E  V  W  I  R  K  G  I  X                                                  F2
            C  L  T  N  F  T  R  R  K  K  C  G  F  A  K  A  L                                                    F3
      601 CCTGTTTGACAAATTTCACGCGCAGGAAGAAGTGTGGATTCGCAAAGGCATTG 653
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