cpn60 (cpn60) allele sequence: id-214
Contig position
- sequence bin id
- 9921
- contig length
- 69660
- start
- 3906
- end
- 4208
- length
- 303
- orientation
- forward
- complete
- yes
Sequence
GGTTAAAGAA GTGGCTTCTA AAACCAATGA TGTGGCTGGC GACGGCACAA CAACCGCGAC CGTGTTGGCA CAAGCGATTG TCGTAGAAGG CATGAAATAC GTTACCGCAG GCATGAATCC AACTGATTTG AAACGCGGTA TTGATAAAGC AGTGGCGGCG TTGGTTGGCG AATTGGCAAA CATCGCGAAA CCTTGCGAAA CTTACGAGCA AATCGCGCAA GTGGGCGCAA TTTCGGCAAA CTCTGACGAG CAAGTCGGCA AAATCATTGC AGACGCGATG CAAGAAGTCG GCAAAGAAGG CGTGATTACC GTTGAAGACG GCAAATCGTT GGAAAACGAG TTGGAAGTGG TTAAAGGTAT GCAATTTGAC CGTGGCTACT TGTCGCCTTA TTTCGTGAAT GATTTGGAAA AACAAATCGC TGGTTTGGAC AGCCCATTTG TGTTGTTGTT TGACAAAAAA ATCAGCAATA TCCGTGATTT GTTGCCCATT TTGGAACAAG TGG
Translation
G * R S G F * N Q * C G W R R H N N R D R V G T S D C R R R H E I R F1
V K E V A S K T N D V A G D G T T T A T V L A Q A I V V E G M K Y F2
L K K W L L K P M M W L A T A Q Q P R P C W H K R L S * K A * N T F3
1 GGTTAAAGAAGTGGCTTCTAAAACCAATGATGTGGCTGGCGACGGCACAACAACCGCGACCGTGTTGGCACAAGCGATTGTCGTAGAAGGCATGAAATAC 100
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Y R R H E S N * F E T R Y * * S S G G V G W R I G K H R E T L R N F1
V T A G M N P T D L K R G I D K A V A A L V G E L A N I A K P C E T F2
L P Q A * I Q L I * N A V L I K Q W R R W L A N W Q T S R N L A K F3
101 GTTACCGCAGGCATGAATCCAACTGATTTGAAACGCGGTATTGATAAAGCAGTGGCGGCGTTGGTTGGCGAATTGGCAAACATCGCGAAACCTTGCGAAA 200
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L R A N R A S G R N F G K L * R A S R Q N H C R R D A R S R Q R R F1
Y E Q I A Q V G A I S A N S D E Q V G K I I A D A M Q E V G K E G F2
L T S K S R K W A Q F R Q T L T S K S A K S L Q T R C K K S A K K A F3
201 CTTACGAGCAAATCGCGCAAGTGGGCGCAATTTCGGCAAACTCTGACGAGCAAGTCGGCAAAATCATTGCAGACGCGATGCAAGAAGTCGGCAAAGAAGG 300
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R D Y R * R R Q I V G K R V G S G * R Y A I * P W L L V A L F R E * F1
V I T V E D G K S L E N E L E V V K G M Q F D R G Y L S P Y F V N F2
* L P L K T A N R W K T S W K W L K V C N L T V A T C R L I S * M F3
301 CGTGATTACCGTTGAAGACGGCAAATCGTTGGAAAACGAGTTGGAAGTGGTTAAAGGTATGCAATTTGACCGTGGCTACTTGTCGCCTTATTTCGTGAAT 400
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F G K T N R W F G Q P I C V V V * Q K N Q Q Y P * F V A H F G T S F1
D L E K Q I A G L D S P F V L L F D K K I S N I R D L L P I L E Q V F2
I W K N K S L V W T A H L C C C L T K K S A I S V I C C P F W N K F3
401 GATTTGGAAAAACAAATCGCTGGTTTGGACAGCCCATTTGTGTTGTTGTTTGACAAAAAAATCAGCAATATCCGTGATTTGTTGCCCATTTTGGAACAAG 500
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G F1
X F2
W F3
501 TGG 503
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