recA (recA) allele sequence: id-213

Contig position

sequence bin id
9893
contig length
17024
start
5464
end
5817
length
354
orientation
forward
complete
yes
Options

Sequence

GGCACAAATT GAGAAAAACT ACGGCAAAGG CGCAGTCATG AAAATGGACG GCAGCCACCA AGACGAAGAA TTGCAAGTCA TTTCCACAGG TTCGCTCACA TTGGACATTG CCTTGGGTGT GGGCGGTTTA CCACGCGGTC GTATTGTGGA AATTTACGGC GCAGAATCAT CGGGCAAAAC CACTTTATGT TTGGAATCGA TTGCACAATG CCAAAAAGCA GGCGGAACGT GTGCGTTTAT TGACGCAGAA CACGCATTTG ACCCTATTTA CGCGCGTAAA TTGGGCGTAG AAGTCGAAAA ATTGTTGGTA TCGCAACCCG ACACAGGCGA ACAAGCATTG GAAATTTGTG ATATGTTGGT GCGCTCGGGT GGTGTGGATA TGGTCGTGAT TGATTCGGTT GCCGCGCTTG TTCCCAAAGC GGAAATTGAA GGCGACATGG GTGATAGCCA CGTTGGTTTG CACGCTCGTT TGATGAGCCA AGCCTTGCGT AAACTGGCAG GACACATCAA AAAAACCAAC ACGCTGGCGG TGTTCATCAA CCAAACGCGC ATGA

Translation


          G  T  N  *  E  K  L  R  Q  R  R  S  H  E  N  G  R  Q  P  P  R  R  R  I  A  S  H  F  H  R  F  A  H  I   F1
           A  Q  I  E  K  N  Y  G  K  G  A  V  M  K  M  D  G  S  H  Q  D  E  E  L  Q  V  I  S  T  G  S  L  T     F2
            H  K  L  R  K  T  T  A  K  A  Q  S  *  K  W  T  A  A  T  K  T  K  N  C  K  S  F  P  Q  V  R  S  H    F3
        1 GGCACAAATTGAGAAAAACTACGGCAAAGGCGCAGTCATGAAAATGGACGGCAGCCACCAAGACGAAGAATTGCAAGTCATTTCCACAGGTTCGCTCACA 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  H  C  L  G  C  G  R  F  T  T  R  S  Y  C  G  N  L  R  R  R  I  I  G  Q  N  H  F  M  F  G  I  D    F1
          L  D  I  A  L  G  V  G  G  L  P  R  G  R  I  V  E  I  Y  G  A  E  S  S  G  K  T  T  L  C  L  E  S  I   F2
           W  T  L  P  W  V  W  A  V  Y  H  A  V  V  L  W  K  F  T  A  Q  N  H  R  A  K  P  L  Y  V  W  N  R     F3
      101 TTGGACATTGCCTTGGGTGTGGGCGGTTTACCACGCGGTCGTATTGTGGAAATTTACGGCGCAGAATCATCGGGCAAAACCACTTTATGTTTGGAATCGA 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           C  T  M  P  K  S  R  R  N  V  C  V  Y  *  R  R  T  R  I  *  P  Y  L  R  A  *  I  G  R  R  S  R  K     F1
            A  Q  C  Q  K  A  G  G  T  C  A  F  I  D  A  E  H  A  F  D  P  I  Y  A  R  K  L  G  V  E  V  E  K    F2
          L  H  N  A  K  K  Q  A  E  R  V  R  L  L  T  Q  N  T  H  L  T  L  F  T  R  V  N  W  A  *  K  S  K  N   F3
      201 TTGCACAATGCCAAAAAGCAGGCGGAACGTGTGCGTTTATTGACGCAGAACACGCATTTGACCCTATTTACGCGCGTAAATTGGGCGTAGAAGTCGAAAA 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          I  V  G  I  A  T  R  H  R  R  T  S  I  G  N  L  *  Y  V  G  A  L  G  W  C  G  Y  G  R  D  *  F  G  C   F1
           L  L  V  S  Q  P  D  T  G  E  Q  A  L  E  I  C  D  M  L  V  R  S  G  G  V  D  M  V  V  I  D  S  V     F2
            C  W  Y  R  N  P  T  Q  A  N  K  H  W  K  F  V  I  C  W  C  A  R  V  V  W  I  W  S  *  L  I  R  L    F3
      301 ATTGTTGGTATCGCAACCCGACACAGGCGAACAAGCATTGGAAATTTGTGATATGTTGGTGCGCTCGGGTGGTGTGGATATGGTCGTGATTGATTCGGTT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  A  C  S  Q  S  G  N  *  R  R  H  G  *  *  P  R  W  F  A  R  S  F  D  E  P  S  L  A  *  T  G  R    F1
          A  A  L  V  P  K  A  E  I  E  G  D  M  G  D  S  H  V  G  L  H  A  R  L  M  S  Q  A  L  R  K  L  A  G   F2
           P  R  L  F  P  K  R  K  L  K  A  T  W  V  I  A  T  L  V  C  T  L  V  *  *  A  K  P  C  V  N  W  Q     F3
      401 GCCGCGCTTGTTCCCAAAGCGGAAATTGAAGGCGACATGGGTGATAGCCACGTTGGTTTGCACGCTCGTTTGATGAGCCAAGCCTTGCGTAAACTGGCAG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           T  H  Q  K  N  Q  H  A  G  G  V  H  Q  P  N  A  H  X                                                  F1
            H  I  K  K  T  N  T  L  A  V  F  I  N  Q  T  R  M  X                                                 F2
          D  T  S  K  K  P  T  R  W  R  C  S  S  T  K  R  A  *                                                   F3
      501 GACACATCAAAAAAACCAACACGCTGGCGGTGTTCATCAACCAAACGCGCATGA 554
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----