abcZ (abcZ) allele sequence: id-213

Contig position

sequence bin id
9882
contig length
166141
start
36022
end
36474
length
453
orientation
reverse
complete
yes
Options

Sequence

TGGGCAAATT ATCGTGCAAA ACGGCTTAAA AATCGTGTAT GTGCCGCAAG AGAGCGTGTT TGACGGTGAA GCAAGCGTGT TTGACGTGGT GTCAGAAGGT TTGGGTAGCC TGTGCGATGT TTTGCGTCAA TATCATCACG TTAGCCATCA ATTAGAATCG CATCATTCAG ACAATTTAAT TCGACAACTC AATGACTTAC AAAATCAAAT TGAAGCGCAA AACGGTTGGT CTGTTGATGC AGCGATTAAA CAAACCATTA GTGAACTCGG GCTGCCTGAA AATGAATTGA TTGGCAATCT GTCGGGCGGT CAGAAAAAAC GTGTGGCGTT GGCGCAAGCG TGGGTGCAAA AACCCGATAT TTTGTTGCTG GACGAACCAA CTAACCACTT GGATATTAAC GCGATTATTT GGCTGGAAAA TTTGTTGCAA GCGTTTTCAG GCAGCATGGT GGTGATTACG CACGACCGCC GTTTTTTGGA CAACATCGCC AATCGGATTG TGGAATTGGA TAGGGGCGTG TTGCGTTCGT ACGAGGGCAG TTTCAGCAAA TACAGCGAGA AAAAGGCGCA GGAATTGGCG GTTGAGGCGG AACACAATCG CCTGTTTGAC AAATTTCACG CGCAGGAAGA AGTGTGGATT CGCAAAGGCA TTG

Translation


          W  A  N  Y  R  A  K  R  L  K  N  R  V  C  A  A  R  E  R  V  *  R  *  S  K  R  V  *  R  G  V  R  R  F   F1
           G  Q  I  I  V  Q  N  G  L  K  I  V  Y  V  P  Q  E  S  V  F  D  G  E  A  S  V  F  D  V  V  S  E  G     F2
            G  K  L  S  C  K  T  A  *  K  S  C  M  C  R  K  R  A  C  L  T  V  K  Q  A  C  L  T  W  C  Q  K  V    F3
        1 TGGGCAAATTATCGTGCAAAACGGCTTAAAAATCGTGTATGTGCCGCAAGAGAGCGTGTTTGACGGTGAAGCAAGCGTGTTTGACGTGGTGTCAGAAGGT 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  *  P  V  R  C  F  A  S  I  S  S  R  *  P  S  I  R  I  A  S  F  R  Q  F  N  S  T  T  Q  *  L  T    F1
          L  G  S  L  C  D  V  L  R  Q  Y  H  H  V  S  H  Q  L  E  S  H  H  S  D  N  L  I  R  Q  L  N  D  L  Q   F2
           W  V  A  C  A  M  F  C  V  N  I  I  T  L  A  I  N  *  N  R  I  I  Q  T  I  *  F  D  N  S  M  T  Y     F3
      101 TTGGGTAGCCTGTGCGATGTTTTGCGTCAATATCATCACGTTAGCCATCAATTAGAATCGCATCATTCAGACAATTTAATTCGACAACTCAATGACTTAC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           K  S  N  *  S  A  K  R  L  V  C  *  C  S  D  *  T  N  H  *  *  T  R  A  A  *  K  *  I  D  W  Q  S     F1
            N  Q  I  E  A  Q  N  G  W  S  V  D  A  A  I  K  Q  T  I  S  E  L  G  L  P  E  N  E  L  I  G  N  L    F2
          K  I  K  L  K  R  K  T  V  G  L  L  M  Q  R  L  N  K  P  L  V  N  S  G  C  L  K  M  N  *  L  A  I  C   F3
      201 AAAATCAAATTGAAGCGCAAAACGGTTGGTCTGTTGATGCAGCGATTAAACAAACCATTAGTGAACTCGGGCTGCCTGAAAATGAATTGATTGGCAATCT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          V  G  R  S  E  K  T  C  G  V  G  A  S  V  G  A  K  T  R  Y  F  V  A  G  R  T  N  *  P  L  G  Y  *  R   F1
           S  G  G  Q  K  K  R  V  A  L  A  Q  A  W  V  Q  K  P  D  I  L  L  L  D  E  P  T  N  H  L  D  I  N     F2
            R  A  V  R  K  N  V  W  R  W  R  K  R  G  C  K  N  P  I  F  C  C  W  T  N  Q  L  T  T  W  I  L  T    F3
      301 GTCGGGCGGTCAGAAAAAACGTGTGGCGTTGGCGCAAGCGTGGGTGCAAAAACCCGATATTTTGTTGCTGGACGAACCAACTAACCACTTGGATATTAAC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            D  Y  L  A  G  K  F  V  A  S  V  F  R  Q  H  G  G  D  Y  A  R  P  P  F  F  G  Q  H  R  Q  S  D  C    F1
          A  I  I  W  L  E  N  L  L  Q  A  F  S  G  S  M  V  V  I  T  H  D  R  R  F  L  D  N  I  A  N  R  I  V   F2
           R  L  F  G  W  K  I  C  C  K  R  F  Q  A  A  W  W  *  L  R  T  T  A  V  F  W  T  T  S  P  I  G  L     F3
      401 GCGATTATTTGGCTGGAAAATTTGTTGCAAGCGTTTTCAGGCAGCATGGTGGTGATTACGCACGACCGCCGTTTTTTGGACAACATCGCCAATCGGATTG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  I  G  *  G  R  V  A  F  V  R  G  Q  F  Q  Q  I  Q  R  E  K  G  A  G  I  G  G  *  G  G  T  Q  S     F1
            E  L  D  R  G  V  L  R  S  Y  E  G  S  F  S  K  Y  S  E  K  K  A  Q  E  L  A  V  E  A  E  H  N  R    F2
          W  N  W  I  G  A  C  C  V  R  T  R  A  V  S  A  N  T  A  R  K  R  R  R  N  W  R  L  R  R  N  T  I  A   F3
      501 TGGAATTGGATAGGGGCGTGTTGCGTTCGTACGAGGGCAGTTTCAGCAAATACAGCGAGAAAAAGGCGCAGGAATTGGCGGTTGAGGCGGAACACAATCG 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  V  *  Q  I  S  R  A  G  R  S  V  D  S  Q  R  H  X                                                   F1
           L  F  D  K  F  H  A  Q  E  E  V  W  I  R  K  G  I  X                                                  F2
            C  L  T  N  F  T  R  R  K  K  C  G  F  A  K  A  L                                                    F3
      601 CCTGTTTGACAAATTTCACGCGCAGGAAGAAGTGTGGATTCGCAAAGGCATTG 653
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