aroE (aroE) allele sequence: id-208
Contig position
- sequence bin id
- 9225
- contig length
- 21259
- start
- 5733
- end
- 6251
- length
- 519
- orientation
- reverse
- complete
- yes
Sequence
ACCACGTTAC ACCGTTTTTG GTAATCCTGT TGCACACAGC AAATCCCCAC AAATTCATCA ATGCTTTGCC GCACAAGAAG GCGTACAAAT TGAATACACG CGCACCTTTG CCGAAAACAC CGCACAAGAT TTTGGCGATG GCGTTCGCGC TTTTTTTGCA CAAAATGGAC GTGGCGCAAA TGTGACCCTG CCGTTTAAAG GTTTTGCCCA CGATTTGGTG CAGGCACACA CCGAACGCGC TCGGGCAGCG GGCGCAGTCA ATACGCTGAT TCCGCAAGCA GACGGCACTT TGCTGGGCGA CAACACCGAC GGCGAAGGCT TGGTGCGCGA CTTATGCCAG CACTTGCAAT TCAATCTACA CAATAAAAAC ATTTTGCTTT TGGGCGCAGG TGGCGCGACT CGTGGCGTGG TTTTGCCGCT AGCAGCCTGC AATCCTGCCA GCATCACCAT TGCCAATCGC ACACACGATA AAGCCATTGA ATTGGCTCAG TTGTTTGATA TTGCCGCTCT GCCCTTTCAT CAATTAAATC AATCTTATGA CATTATTATC AACGCAACAT CGGGTAGCAT AGACGATAGC ATTCCAGATG TATCGCCCGA TATTTTTGCA GGCTGCTCGT TGGCATACGA TATGTTTTAT GCGAACCAGC CCACCGCGTT CATGCAATTT GCCGCGCAAC ATGGCGCACA GCAAACATCT GACGGCTTGG GTATGTTGG
Translation
T T L H R F W * S C C T Q Q I P T N S S M L C R T R R R T N * I H A F1
P R Y T V F G N P V A H S K S P Q I H Q C F A A Q E G V Q I E Y T F2
H V T P F L V I L L H T A N P H K F I N A L P H K K A Y K L N T R F3
1 ACCACGTTACACCGTTTTTGGTAATCCTGTTGCACACAGCAAATCCCCACAAATTCATCAATGCTTTGCCGCACAAGAAGGCGTACAAATTGAATACACG 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
H L C R K H R T R F W R W R S R F F C T K W T W R K C D P A V * R F1
R T F A E N T A Q D F G D G V R A F F A Q N G R G A N V T L P F K G F2
A P L P K T P H K I L A M A F A L F L H K M D V A Q M * P C R L K F3
101 CGCACCTTTGCCGAAAACACCGCACAAGATTTTGGCGATGGCGTTCGCGCTTTTTTTGCACAAAATGGACGTGGCGCAAATGTGACCCTGCCGTTTAAAG 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
F C P R F G A G T H R T R S G S G R S Q Y A D S A S R R H F A G R F1
F A H D L V Q A H T E R A R A A G A V N T L I P Q A D G T L L G D F2
V L P T I W C R H T P N A L G Q R A Q S I R * F R K Q T A L C W A T F3
201 GTTTTGCCCACGATTTGGTGCAGGCACACACCGAACGCGCTCGGGCAGCGGGCGCAGTCAATACGCTGATTCCGCAAGCAGACGGCACTTTGCTGGGCGA 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
Q H R R R R L G A R L M P A L A I Q S T Q * K H F A F G R R W R D S F1
N T D G E G L V R D L C Q H L Q F N L H N K N I L L L G A G G A T F2
T P T A K A W C A T Y A S T C N S I Y T I K T F C F W A Q V A R L F3
301 CAACACCGACGGCGAAGGCTTGGTGCGCGACTTATGCCAGCACTTGCAATTCAATCTACACAATAAAAACATTTTGCTTTTGGGCGCAGGTGGCGCGACT 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
W R G F A A S S L Q S C Q H H H C Q S H T R * S H * I G S V V * Y F1
R G V V L P L A A C N P A S I T I A N R T H D K A I E L A Q L F D I F2
V A W F C R * Q P A I L P A S P L P I A H T I K P L N W L S C L I F3
401 CGTGGCGTGGTTTTGCCGCTAGCAGCCTGCAATCCTGCCAGCATCACCATTGCCAATCGCACACACGATAAAGCCATTGAATTGGCTCAGTTGTTTGATA 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
C R S A L S S I K S I L * H Y Y Q R N I G * H R R * H S R C I A R F1
A A L P F H Q L N Q S Y D I I I N A T S G S I D D S I P D V S P D F2
L P L C P F I N * I N L M T L L S T Q H R V A * T I A F Q M Y R P I F3
501 TTGCCGCTCTGCCCTTTCATCAATTAAATCAATCTTATGACATTATTATCAACGCAACATCGGGTAGCATAGACGATAGCATTCCAGATGTATCGCCCGA 600
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
Y F C R L L V G I R Y V L C E P A H R V H A I C R A T W R T A N I * F1
I F A G C S L A Y D M F Y A N Q P T A F M Q F A A Q H G A Q Q T S F2
F L Q A A R W H T I C F M R T S P P R S C N L P R N M A H S K H L F3
601 TATTTTTGCAGGCTGCTCGTTGGCATACGATATGTTTTATGCGAACCAGCCCACCGCGTTCATGCAATTTGCCGCGCAACATGGCGCACAGCAAACATCT 700
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R L G Y V G F1
D G L G M L X F2
T A W V C W F3
701 GACGGCTTGGGTATGTTGG 719
----:----|----:----