gdh (gdh) allele sequence: id-190

Contig position

sequence bin id
16716
contig length
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start
25769
end
26344
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576
orientation
reverse
complete
yes
Options

Sequence

ATCGGTGCAA ATCACGGTGG CAGAACAACT GGGCGTGGAA GAGCGCGGCG AGTTTTATGA CATCACAGGC GCATTGCGCG ACATGATGCA AAACCACATC ATGCAAATGC TGTGTTTTGT GGCAATGGAA CAACCTAAAT CGTTGAGCGC AGACGATGTA CGCGACGAAA AATTGAAAGT GGTGGCTGCA CTCAAACCGA TGACTTTGGC AGATGTGGAT AAAAACGTGA TTCGCGCACA ATATGTGGCA AACGGCGAGC AAAACGGCTA TTTGCAAGAA CACAATGTGC CAGCCGACAG CCGTACCGAA ACCTATGTTG CCATTCGCGC CGAAATTGAT ACGCCACGTT GGGCAGGCGT GCCGTTTTAT TTGCGTACAG GCAAACGCTT GGCAACGCGC ACAGCAGAAA TTGTTTTGAA TTTCAAAGAC CAAGCCAATG GTTTGTTTGG CACAAATCCT AATCGTTTGG TGATTTCGTT GCAGCCTGAT GAAACCGTAT CGCTCAAATT GTATGTGAAA CAAGTGGGCA GCGGCTTGGA CGTGCAGCCA ACCGAAATGG TGTTGGACAT GGGCACAGTG TCAGACGAAC GCCGCGCCGA AGCGTATGAA TTGCTGTTGC GCGAAGTGAT TGACGGACGT TTGAGCTTGT TCAATCGCCG CGACGAGCTG GAAAAAGCGT GGGAATGGGT CATGCCAATT TTGGACAACT GGGCAACTTC GCCTGTTGCA CCAGCCACTT ACGCTGCATC TAGCTGGGGG CCAAAAGAAG CGCAAG

Translation


          I  G  A  N  H  G  G  R  T  T  G  R  G  R  A  R  R  V  L  *  H  H  R  R  I  A  R  H  D  A  K  P  H  H   F1
           S  V  Q  I  T  V  A  E  Q  L  G  V  E  E  R  G  E  F  Y  D  I  T  G  A  L  R  D  M  M  Q  N  H  I     F2
            R  C  K  S  R  W  Q  N  N  W  A  W  K  S  A  A  S  F  M  T  S  Q  A  H  C  A  T  *  C  K  T  T  S    F3
        1 ATCGGTGCAAATCACGGTGGCAGAACAACTGGGCGTGGAAGAGCGCGGCGAGTTTTATGACATCACAGGCGCATTGCGCGACATGATGCAAAACCACATC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            A  N  A  V  F  C  G  N  G  T  T  *  I  V  E  R  R  R  C  T  R  R  K  I  E  S  G  G  C  T  Q  T  D    F1
          M  Q  M  L  C  F  V  A  M  E  Q  P  K  S  L  S  A  D  D  V  R  D  E  K  L  K  V  V  A  A  L  K  P  M   F2
           C  K  C  C  V  L  W  Q  W  N  N  L  N  R  *  A  Q  T  M  Y  A  T  K  N  *  K  W  W  L  H  S  N  R     F3
      101 ATGCAAATGCTGTGTTTTGTGGCAATGGAACAACCTAAATCGTTGAGCGCAGACGATGTACGCGACGAAAAATTGAAAGTGGTGGCTGCACTCAAACCGA 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           D  F  G  R  C  G  *  K  R  D  S  R  T  I  C  G  K  R  R  A  K  R  L  F  A  R  T  Q  C  A  S  R  Q     F1
            T  L  A  D  V  D  K  N  V  I  R  A  Q  Y  V  A  N  G  E  Q  N  G  Y  L  Q  E  H  N  V  P  A  D  S    F2
          *  L  W  Q  M  W  I  K  T  *  F  A  H  N  M  W  Q  T  A  S  K  T  A  I  C  K  N  T  M  C  Q  P  T  A   F3
      201 TGACTTTGGCAGATGTGGATAAAAACGTGATTCGCGCACAATATGTGGCAAACGGCGAGCAAAACGGCTATTTGCAAGAACACAATGTGCCAGCCGACAG 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  Y  R  N  L  C  C  H  S  R  R  N  *  Y  A  T  L  G  R  R  A  V  L  F  A  Y  R  Q  T  L  G  N  A  H   F1
           R  T  E  T  Y  V  A  I  R  A  E  I  D  T  P  R  W  A  G  V  P  F  Y  L  R  T  G  K  R  L  A  T  R     F2
            V  P  K  P  M  L  P  F  A  P  K  L  I  R  H  V  G  Q  A  C  R  F  I  C  V  Q  A  N  A  W  Q  R  A    F3
      301 CCGTACCGAAACCTATGTTGCCATTCGCGCCGAAATTGATACGCCACGTTGGGCAGGCGTGCCGTTTTATTTGCGTACAGGCAAACGCTTGGCAACGCGC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            S  R  N  C  F  E  F  Q  R  P  S  Q  W  F  V  W  H  K  S  *  S  F  G  D  F  V  A  A  *  *  N  R  I    F1
          T  A  E  I  V  L  N  F  K  D  Q  A  N  G  L  F  G  T  N  P  N  R  L  V  I  S  L  Q  P  D  E  T  V  S   F2
           Q  Q  K  L  F  *  I  S  K  T  K  P  M  V  C  L  A  Q  I  L  I  V  W  *  F  R  C  S  L  M  K  P  Y     F3
      401 ACAGCAGAAATTGTTTTGAATTTCAAAGACCAAGCCAATGGTTTGTTTGGCACAAATCCTAATCGTTTGGTGATTTCGTTGCAGCCTGATGAAACCGTAT 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           A  Q  I  V  C  E  T  S  G  Q  R  L  G  R  A  A  N  R  N  G  V  G  H  G  H  S  V  R  R  T  P  R  R     F1
            L  K  L  Y  V  K  Q  V  G  S  G  L  D  V  Q  P  T  E  M  V  L  D  M  G  T  V  S  D  E  R  R  A  E    F2
          R  S  N  C  M  *  N  K  W  A  A  A  W  T  C  S  Q  P  K  W  C  W  T  W  A  Q  C  Q  T  N  A  A  P  K   F3
      501 CGCTCAAATTGTATGTGAAACAAGTGGGCAGCGGCTTGGACGTGCAGCCAACCGAAATGGTGTTGGACATGGGCACAGTGTCAGACGAACGCCGCGCCGA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          S  V  *  I  A  V  A  R  S  D  *  R  T  F  E  L  V  Q  S  P  R  R  A  G  K  S  V  G  M  G  H  A  N  F   F1
           A  Y  E  L  L  L  R  E  V  I  D  G  R  L  S  L  F  N  R  R  D  E  L  E  K  A  W  E  W  V  M  P  I     F2
            R  M  N  C  C  C  A  K  *  L  T  D  V  *  A  C  S  I  A  A  T  S  W  K  K  R  G  N  G  S  C  Q  F    F3
      601 AGCGTATGAATTGCTGTTGCGCGAAGTGATTGACGGACGTTTGAGCTTGTTCAATCGCCGCGACGAGCTGGAAAAAGCGTGGGAATGGGTCATGCCAATT 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  Q  L  G  N  F  A  C  C  T  S  H  L  R  C  I  *  L  G  A  K  R  S  A  X                            F1
          L  D  N  W  A  T  S  P  V  A  P  A  T  Y  A  A  S  S  W  G  P  K  E  A  Q  X                           F2
           W  T  T  G  Q  L  R  L  L  H  Q  P  L  T  L  H  L  A  G  G  Q  K  K  R  K                             F3
      701 TTGGACAACTGGGCAACTTCGCCTGTTGCACCAGCCACTTACGCTGCATCTAGCTGGGGGCCAAAAGAAGCGCAAG 776
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