abcZ (abcZ) allele sequence: id-158
Contig position
- sequence bin id
- 2974
- contig length
- 88711
- start
- 5934
- end
- 6386
- length
- 453
- orientation
- reverse
- complete
- yes
Sequence
CGGTCAAATC ATCGTGCAAA ACGGCATGAA AATTGTCTAT GTGCCGCAAG AAAGCGTGTT TGACGACCAA GCGAGCGTGT TTGATGTCGT GTCGCAAGGT TTGGGCGATT TGCGCGATGT GTTGCGCCGT TATCATCAGG TTAGCCACGC GCTAGAAACG CAGAATTCTG ATGATTTAAT TCGCCAACTC AACGAGTTAC AAAATGAAAT TGAATCACAA GACGGCTGGC AGTTTGACGC GGCAATCCGC CAAACGATTA GCGAATTGGG GCTGCCTGAA AATGAATTGA TTGGCAACTT GTCGGGTGGT CAGAAAAAAC GGGTTGCGTT GGCTCAAGCA TGGGTGCAAA AACCCGATAT TTTGTTGCTG GACGAACCGA CTAACCATTT GGATATTAAC GCGATTATTT GGCTGGAAAA TTTGTTGCAA GCGTTTTCAG GCAGCATGGT GGTGATTACG CACGACCGCC GTTTTTTGGA CAATATCGCC AATCGGATTG TGGAATTGGA TAGGGGCGTG TTGCGTTCGT ACGAGGGCAG TTTCAGCAAA TACAGCGAGA AAAAGGCGCA GGAATTGGCG GTTGAGGCGG AACACAATCG CCTGTTTGAC AAATTTCACG CGCAGGAAGA AGTGTGGATT CGCAAAGGCA TTG
Translation
R S N H R A K R H E N C L C A A R K R V * R P S E R V * C R V A R F F1
G Q I I V Q N G M K I V Y V P Q E S V F D D Q A S V F D V V S Q G F2
V K S S C K T A * K L S M C R K K A C L T T K R A C L M S C R K V F3
1 CGGTCAAATCATCGTGCAAAACGGCATGAAAATTGTCTATGTGCCGCAAGAAAGCGTGTTTGACGACCAAGCGAGCGTGTTTGATGTCGTGTCGCAAGGT 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G R F A R C V A P L S S G * P R A R N A E F * * F N S P T Q R V T F1
L G D L R D V L R R Y H Q V S H A L E T Q N S D D L I R Q L N E L Q F2
W A I C A M C C A V I I R L A T R * K R R I L M I * F A N S T S Y F3
101 TTGGGCGATTTGCGCGATGTGTTGCGCCGTTATCATCAGGTTAGCCACGCGCTAGAAACGCAGAATTCTGATGATTTAATTCGCCAACTCAACGAGTTAC 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
K * N * I T R R L A V * R G N P P N D * R I G A A * K * I D W Q L F1
N E I E S Q D G W Q F D A A I R Q T I S E L G L P E N E L I G N L F2
K M K L N H K T A G S L T R Q S A K R L A N W G C L K M N * L A T C F3
201 AAAATGAAATTGAATCACAAGACGGCTGGCAGTTTGACGCGGCAATCCGCCAAACGATTAGCGAATTGGGGCTGCCTGAAAATGAATTGATTGGCAACTT 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
V G W S E K T G C V G S S M G A K T R Y F V A G R T D * P F G Y * R F1
S G G Q K K R V A L A Q A W V Q K P D I L L L D E P T N H L D I N F2
R V V R K N G L R W L K H G C K N P I F C C W T N R L T I W I L T F3
301 GTCGGGTGGTCAGAAAAAACGGGTTGCGTTGGCTCAAGCATGGGTGCAAAAACCCGATATTTTGTTGCTGGACGAACCGACTAACCATTTGGATATTAAC 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
D Y L A G K F V A S V F R Q H G G D Y A R P P F F G Q Y R Q S D C F1
A I I W L E N L L Q A F S G S M V V I T H D R R F L D N I A N R I V F2
R L F G W K I C C K R F Q A A W W * L R T T A V F W T I S P I G L F3
401 GCGATTATTTGGCTGGAAAATTTGTTGCAAGCGTTTTCAGGCAGCATGGTGGTGATTACGCACGACCGCCGTTTTTTGGACAATATCGCCAATCGGATTG 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G I G * G R V A F V R G Q F Q Q I Q R E K G A G I G G * G G T Q S F1
E L D R G V L R S Y E G S F S K Y S E K K A Q E L A V E A E H N R F2
W N W I G A C C V R T R A V S A N T A R K R R R N W R L R R N T I A F3
501 TGGAATTGGATAGGGGCGTGTTGCGTTCGTACGAGGGCAGTTTCAGCAAATACAGCGAGAAAAAGGCGCAGGAATTGGCGGTTGAGGCGGAACACAATCG 600
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
P V * Q I S R A G R S V D S Q R H X F1
L F D K F H A Q E E V W I R K G I X F2
C L T N F T R R K K C G F A K A L F3
601 CCTGTTTGACAAATTTCACGCGCAGGAAGAAGTGTGGATTCGCAAAGGCATTG 653
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|---