Sequence bin for ATCC 12228

Contig summary statistics

Contigs
7
Total length
2,564,615
Minimum length
4,439
Maximum length
2,499,279
Mean length
366,374
N50
2,499,279
L50
1
N90
2,499,279
L90
1
N95
2,499,279
L95
1

FASTAEMBLGBKGFF3

SequenceSequencing methodOriginal designationLengthCommentsLocusStartEndDirectionAnnotation
45079AE015929.1 Staphylococcus epidermidis ATCC 12228, complete genome2499279SE0002 20263159 EMBL GBK
x_1 35893825
SE0003 38224937
SE0004 49486879
SE0007 1164812934
SE0010 1551815847
SE0014 2027220718
BACT000038 (rplI) 2027220718
SE0022 3018930989
CcrB_SERP2499 4244444069
CcrA_SERP2498 4409445440
SE0156 144775145755
PSM-b1_A0A0Q0WMS6 168725168874
SE0183 173167173490
SE0197 188759189532
SE0210 198201198950
SE0216 205962207179
SE0219 210026210928
SE0224 214351215310
SE0230 221209221433
SE0234 223234224199
SE0237 226640227215
SE0238 227219227593
SE0244 240814241437
SE0247 244210245613
SE0249 247560248063
SE0254 253574254527
SE0259 258290259900
SE0262 261489262451
SE0271 270787271401
SE0284 282683283144
SE0285 283165283728
SE0286 283718284725
SE0290 290578292032
x_2 290672291037
SE0291 292405293046
SE0292 293030294430
SE0293 294423294821
SE0294 294811295578
SE0295 295575296102
BACT000062 (rpmG) 296871297014
SE0298 297077297259
SE0299 297270297818
BACT000040 (rplK) 298150298572
BACT000030 (rplA) 298785299480
SE0301 298785299480
BACT000039 (rplJ) 299756300256
SE0303 299756300256
SE0304 300294300662
BACT000036 (rplL) 300294300662
SE0307 305361308984
SE0308 309312309572
BACT000012 (rpsL) 309663310076
SE0310 310147310617
BACT000007 (rpsG) 310147310617
fusA 310737312818
SE0312 313037314221
SE0318 319770320846
SE0325 328194328856
SE0326 328849329511
SE0337 338886339764
SE0338 339778340443
SE0342 342580343128
SE0347 346492346854
SE0348 346858347118
SE0359 356818357807
SE0361 359353360273
SE0362 360278361261
SE0363 361274362350
SE0369 367268368566
SE0370 368623369129
SE0373 371189372025
SE0374 372036373304
SE0384 380966381910
SE0386 382675383472
SE0388 384429385148
SE0395 389655389879
SE0396 389895390101
SE0401 395468395950
SE0405 399912400841
SE0406 400838401674
SE0410 404235405029
SE0418 411040412767
SE0424 419196420248
SE0425 420807421313
SE0426 421422422345
SE0427 422364423038
SE0429 424217424978
SE0433 429214430014
SE0437 434248434964
SE0438 434964435440
SE0439 435692436366
SE0441 437703437888
SE0442 438171438770
SE0448 443204443500
SE0450 444473445039
SE0454 447126447998
SE0459 452440453366
SE0471 462892463812
SE0473 466144467316
SE0477 470159471265
SE0480 473054473527
SE0485 475817476530
SE0487 476955477626
SE0488 477923478510
SE0490 479653480261
SE0491 480310480516
SE0492 480535481266
SE0493 481254482258
SE0501 490043491824
SE0503 492991494505
SE0505 495886496425
SE0511 503381504256
SE0512 505011505409
SE0517 510732511511
SE0519 512784513098
SE0524 516443517573
SE0526 518923519417
SE0528 520389521465
SE0530 522945523586
SE0531 523731524597
SE0535 527966530500
SE0538 533261533902
SE0543 539880540812
SE0544 540818541657
SE0545 541654542190
SE0547 543661544593
SE0548 544769545677
SE0550 546801547745
SE0551 548073548657
SE0553 549141550040
SE0555 551698551934
SE0556 552290553303
SE0557 553355554365
SE0558 554559555749
SE0559 555880556641
SE0561 558300559604
SE0562 559770560228
SE0563 560297560530
SE0575 572125572319
PSM-e 575333575404
SE0584 579818580006
x_3 580031580288
SE0593 585005585547
SE0596 586723587103
SE0599 587742588038
SE0601 589309590004
SE0602 590025590837
SE0604 591440591631
SE0607 593735595042
SE0608 595110596351
SE0609 596341596805
SE0613 599731600756
SE0615 601984602811
SE0617 604305605219
SE0619 605855606121
SE0620 606240606674
SE0623 608871609017
SE0624 609033610490
SE0626 611719611955
SE0631 617295617615
SE0634 619427619786
SE0638 624590624964
SE0640 626482626838
SE0641 626816627109
SE0642 627109627588
SE0644 629073629420
SE0645 629420629848
SE0647 632440632820
SE0648 632886633479
SE0649 633776634156
SE0654 638095639339
SE0660 645891646412
SE0662 646431647006
SE0677 668267669208
SE0685 676896677885
SE0690 682335684143
SE0692 685427685870
SE0694 686748687095
SE0695 687112687747
SE0697 688567689421
SE0713 702038703156
x_4 702645702953
SE0716 705031706224
SE0717 706202707377
SE0718 707898709382
SE0719 709372709617
SE0726 717390717992
SE0727 717998718183
SE0729 719452719670
SE0744 728369730042
AtlE_SERP0636 735138739142
SE0756 745402745692
SE0757 745689746294
SE0758 746284748272
SE0759 748272749396
SE0760 749934750251
SE0761 750624751484
SE0762 751689752171
SE0763 752158753285
SE0764 753286753990
SE0765 753990754250
SE0766 754252754923
SE0767 754916757105
SE0769 758561759592
SE0770 759592760158
SE0771 760175761653
SE0774 763852765255
SE0777 768554768688
SE0778 768840770132
SE0779 770443771615
SE0780 771675772214
SE0781 772370772636
SE0788 780814781032
SE0793 785219786520
x_5 785557785892
SE0794 786525787931
SE0796 788650789189
SE0797 789201790295
SE0800 791906792979
SE0804 796730797341
SE0806 798893799084
SE0810 802155802637
SE0811 802782803057
SE0816 810823811284
SE0817 811726812778
SE0818 812799813233
SE0822 815156815545
SE0823 815612816154
SE0826 818306818860
BACT000061 (rpmF) 818938819111
SE0831 823521824579
SE0832 824579826981
SE0834 828220828486
SE0835 828487829008
SE0838 833409833723
SE0840 835972836586
SE0843 839510840313
SE0845 840908841417
PSM-b3_SERP0736 842048842209
PSM-b2_SERP0737 842268842399
PSM-b1_SERP0738 842454842585
PSM-b1_SERP0738 842644842775
SE0853 846062846493
SE0854 846508847443
SE0857 850354851319
SE0858 851321852670
SE0862 857214858005
SE0865 859318859608
SE0873 868101868628
SE0875 868861870168
SE0877 871093872370
SE0878 872371873471
SE0879 873464876637
SE0882 877984878208
SE0883 878746879153
Fbe_SERP0775 879218880912
SE0885 881182881805
SE0889 886270886473
SE0890 886695887183
SE0893 889415890509
SE0894 890516891259
SE0896 893553894443
SE0898 895093895728
BACT000057 (rpmB) 895811895999
SE0899 895811895999
SE0900 896357896731
SE0901 896746898404
SE0911 910179910511
BACT000016 (rpsP) 912341912616
SE0914 912743913246
SE0915 913246913983
BACT000048 (rplS) 914089914439
SE0916 914089914439
SE0921 920496921359
SE0922 921364922134
SE0924 923430924338
SE0928 929825930715
SE0929 930719931261
BACT000002 (rpsB) 933889934677
SE0932 933889934677
SE0934 935848936570
SE0937 938136938918
SE0939 940457942160
SE0941 946899947366
SE0943 948628948912
SE0944 948912949229
SE0947 951699952049
SE0949 953120954091
SE0950 954211954480
BACT000015 (rpsO) 954211954480
SE0954 961420962133
SE0955 962164963435
SE0956 963435964724
SE0957 964721965425
SE0959 966424966816
SE0960 966845967426
SE0964 970471972030
SE0965 972119972334
SE0967 973405975165
SE0968 975166976032
SE0969 976618977235
SE0970 977292977582
SE0972 979471979836
SE0973 979860980354
SE0975 983188985125
SE0978 987025988524
SE0979 988701990374
SE0981 991536992534
SE0982 992488992727
SE0996 10037551003952
SE1009 10142061015486
SE1010 10154921016556
BACT000062 (rpmG) 10233221023471
BACT000014 (rpsN) 10236381023907
SE1023 10271921027425
SE1026 10302491030476
SE1033 10410091041476
SE1035 10420671042675
SE1037 10448761047278
SE1047 10581671059255
SE1049 10613171061883
SE1057 10673451068598
SE1058 10686241069877
SE1061 10726981073474
SE1066 10779521078599
SE1067 10786061079481
SE1076 10896671090389
x_6 10982641098572
SE1092 11043271105118
SE1094 11055241106333
SE1095 11065281106707
SE1110 11225371123610
SE1111 11236281124131
SE1114 11262871126511
SE1115 11265111127011
SE1124 11331591133419
SE1125 11334311133625
SE1133 11717831172919
SE1134 11735621173900
SE1135 11739141174480
SE1137 11751651175794
SE1141 11791981179884
SE1142 11799771181269
SE1147 11874371187754
SE1156 11951551195634
SE1158 11967051197430
SE1160 11984711198743
SE1163 11999341201244
SE1171 12090531210015
SE1172 12101241210372
SE1179 12157821216582
SE1181 12171881218075
SE1182 12181181218567
SE1183 12186721219214
SE1187 12222121223132
SE1190 12252321226122
SE1192 12282101229616
SE1194 12311981232175
SE1197 12341621235145
SE1198 12351381236136
SE1203 12411501241380
SE1204 12413731242710
SE1206 12431901243552
SE1207 12435641244922
SE1213 12499111250468
SE1214 12504951251556
SE1217 12525101253340
SE1224 12589541259466
SE1227 12603261260775
SE1228 12607531261079
SE1234 12650931265293
BACT000062 (rpmG) 12674721267621
SE1240 12702171270816
SE1241 12712291271648
SE1246 12758141276914
SE1247 12769041277593
SE1254 12851921286091
SE1257 12868531287320
SE1261 12902571290967
BACT000021 (rpsU) 12918121291988
SE1262 12918121291988
SE1263 12921141293469
SE1264 12934661294227
SE1268 12983131298945
SE1269 12989741299951
SE1270 13000511301175
BACT000020 (rpsT) 13034101303661
SE1278 13090141309367
SE1279 13093681309952
SE1284 13127301313257
SE1285 13132771313963
SE1295 13221481323416
SE1296 13234341324357
SE1298 13254241325732
SE1300 13261771326437
SE1305 13338431334985
SE1306 13351651336223
SE1308 13367521337174
SE1313 13435881344463
SE1314 13444601344912
SE1317 13476341348152
SE1321 13538191354079
SE1322 13540951355234
SE1325 13573001357902
SE1326 13579151358379
BACT000056 (rpmA) 13598201360104
SE1328 13598201360104
SE1329 13601161360436
BACT000050 (rplU) 13604411360749
SE1335 13635121363691
SE1338 13653261366591
SE1340 13695751370135
SE1344 13739301374610
SE1346 13756241376436
SE1351 13816841382607
SE1353 13836531384009
BACT000049 (rplT) 13836531384009
SE1354 13840611384261
BACT000064 (rpmI) 13840611384261
SE1356 13850241386526
SE1358 13892451390165
SE1361 13925261393551
SE1366 13950221395894
SE1369 14005321401242
SE1373 14060771407834
SE1379 14156581416596
SE1380 14166301417928
SE1381 14181261418539
SE1384 14208201421935
SE1388 14245621425509
SE1389 14256381426132
x_7 14268191427181
SE1391 14271781428401
SE1392 14284011429549
SE1395 14322421432358
BACT000004 (rpsD) 14323901432992
SE1396 14323901432992
SE1402 14374811438605
SE1404 14403831441006
SE1406 14427151443980
SE1409 14474661448455
SE1410 14487111449802
SE1412 14515381452029
SE1413 14521041453417
SE1422 14612041462004
SE1424 14632341464643
SE1430 14811371481448
SE1432 14841801485394
SE1433 14855011486454
SE1440 14921381492776
SE1441 14927771493820
SE1442 14942571495750
SE1443 14960891496940
SE1451 15005761500941
SE1457 15061941507102
SE1461 15113691511845
SE1514 15636921564195
SE1516 15654331566656
SE1519 15680211568392
SE1520 15685581569118
SE1522 15704471570551
SE1548 16022501603539
SE1549 16038461604940
SE1550 16051001606836
SE1551 16070781607620
SE1552 16077271608770
SE1553 16089511609925
SE1561 16158191615980
SE1562 16161391617281
SE1565 16192711619486
SE1566 16196271620091
SE1567 16200991620383
SE1569 16220251622654
SE1570 16226441623690
SE1571 16236871624388
SE1575 16270121627548
SE1576 16279891628714
SE1579 16309401631494
SE1585 16376551639112
SE1586 16391141639416
SE1589 16428801644877
SE1591 16470671647759
SE1592 16480831648385
SE1593 16485101649805
SE1594 16502171650408
SE1595 16503801651006
SE1596 16510801651907
SE1624 16780721678986
SE1625 16789861679363
SdrH_SERP1487 16864701687912
Hld_SERP1489 16894331689507
SE1640 16936151695087
SE1645 16981041698328
SE1647 16999451700580
SE1648 17009281702862
SE1649 17032041704820
SE1651 17059221706383
SE1652 17063561707018
SE1653 17069991707460
x_8 17083971708738
x_9 17092041709461
SE1656 17113861711619
SE1661 17167251717294
SE1670 17290071729333
SE1671 17294331730434
SE1673 17311381731308
SE1679 17357341737263
SE1682 17403941741605
SE1686 17422001742493
SE1688 17443331744986
SE1692 17474781748299
SE1694 17492651749924
SE1696 17508981751338
SE1697 17516561752093
x_10 17535021753735
SE1699 17538841754288
SE1700 17543081755720
SE1701 17557421756608
SE1702 17566931758204
SE1703 17582271758766
SE1704 17587661759281
SE1705 17593791759591
SE1706 17596341760362
SE1707 17603881760738
SE1710 17627191763957
BACT000060 (rpmE) 17690231769280
SE1718 17690231769280
SE1723 17760471776907
SE1725 17778751779482
SE1728 17816291782426
SE1736 17895941790256
SE1737 17904641791174
SE1738 17912981791744
SE1739 17919321792342
SE1747 17971051798076
SE1757 18148271816266
SE1759 18171941818531
SE1763 18214001821660
SE1764 18218131822127
x_11 18265941826992
SE1771 18299901831171
SE1772 18312741833235
SE1774 18332961833796
SE1775 18338701834109
SE1778 18365641837568
SE1784 18434561844433
SE1785 18444371845369
SE1787 18459121846340
BACT000009 (rpsI) 18487641849156
SE1790 18487641849156
BACT000042 (rplM) 18491761849613
SE1792 18498741850677
SE1793 18506811851487
SE1795 18523341853179
BACT000046 (rplQ) 18534741853842
SE1796 18534741853842
SE1798 18548801855269
BACT000011 (rpsK) 18548801855269
SE1799 18552921855657
BACT000013 (rpsM) 18552921855657
BACT000065 (rpmJ) 18556801855793
SE1800 18556801855793
SE1801 18558251856043
SE1802 18562311856878
BACT000044 (rplO) 18581881858628
SE1804 18581881858628
BACT000059 (rpmD) 18586451858824
BACT000005 (rpsE) 18588411859341
SE1806 18588411859341
SE1807 18593611859723
BACT000047 (rplR) 18593611859723
BACT000035 (rplF) 18597551860291
SE1808 18597551860291
SE1809 18603161860714
BACT000008 (rpsH) 18603161860714
BACT000014 (rpsN) 18607451860930
SE1810 18607451860930
SE1811 18609531861492
BACT000034 (rplE) 18609531861492
BACT000053 (rplX) 18615181861835
SE1812 18615181861835
SE1813 18618301862252
BACT000043 (rplN) 18618771862245
SE1814 18618771862245
BACT000017 (rpsQ) 18622761862539
SE1815 18622761862539
BACT000058 (rpmC) 18625641862773
SE1816 18625641862773
SE1817 18627631863197
BACT000045 (rplP) 18627631863197
BACT000003 (rpsC) 18632001863853
SE1818 18632001863853
BACT000051 (rplV) 18638771864230
BACT000019 (rpsS) 18642581864536
SE1820 18642581864536
SE1821 18646031865436
BACT000031 (rplB) 18646031865436
BACT000052 (rplW) 18654651865740
SE1823 18657401866363
BACT000033 (rplD) 18657401866363
BACT000032 (rplC) 18663921867054
BACT000010 (rpsJ) 18670821867390
SE1825 18670821867390
SE1827 18682011869535
SE1831 18739511874859
SE1835 18790631880313
SE1843 18865341886767
SE1845 18872171887693
SE1846 18876901888949
SE1851 18918091892480
SE1856 18951921895740
SE1861 18998541900156
SE1863 19005741902289
SE1865 19027481903437
SE1866 19034501904064
SE1867 19040641904900
SE1869 19057541906077
SE1874 19121091913179
SE1878 19153361915653
SE1885 19224231923112
SE1888 19246041925656
SE1889 19256531926540
SE1902 19389671940268
SE1907 19446691945604
SE1908 19458521947000
x_12 19466511947007
SE1911 19479861948678
SE1921 19557191956279
SE1923 19562761956596
SE1930 19625401963172
x_13 19638521964112
SE1941 19734461974120
SE1948 19833101985475
SE1950 19865271987519
SE1951 19875831987984
SE1952 19880531988469
x_14 19991741999530
SE1971 20057092006161
SE1973 20068512007453
SE1976 20128242013759
SE1977 20137502014064
SE1993 20291202029908
SE1995 20304132031099
SE1996 20313752032262
SE2010 20477952049195
SE2013 20522682052726
SE2014 20527302053431
SE2024 20640562064832
SE2030 20693022070378
SE2031 20703952070583
SE2032 20707462071564
SE2038 20786332078824
SE2045 20885852090126
SE2046 20901502090830
SE2053 20967002097113
SE2055 20992692099559
SE2059 21033522103552
SE2060 21035542104321
SE2061 21043232105321
SE2062 21054292106043
SE2063 21062172108181
SE2066 21105392111588
SE2076 21218442122455
SE2089 21342912135895
SE2090 21358982136074
SE2092 21371462137598
SE2093 21376002138757
SE2096 21406572141520
SE2098 21422372143289
SE2103 21468542148593
SE2104 21486432149332
SE2105 21493292149721
SE2107 21511052151320
SE2110 21536082154774
SE2116 21592152160759
SE2117 21612612162130
SE2126 21717352172442
SE2130 21759832177362
SE2132 21786502179714
SE2140 21847862185646
SE2141 21856392186457
SE2143 21877992188503
SE2144 21886152190279
SE2156 22015182202408
SE2160 22063872209014
SE2162 22112942211740
SE2165 22139302215648
SE2168 22183812220003
SE2170 22204242221758
SE2171 22220862222622
SE2173 22247882225093
SE2174 22254172226016
SE2210 22619582263607
SE2225 22794372280225
x_15 22836422283830
SE2229 22848792285829
SE2233 22939012294329
SE2243 23008702302378
SE2253 23187352319550
SE2254 23195472320347
SE2255 23203492321122
SE2258 23240742325609
SE2267 23407472341226
SE2268 23412272341592
SE2271 23439532344834
SE2273 23474662348005
SE2275 23495812349982
SE2276 23500762350477
SE2277 23505012350764
SE2278 23507612351951
SE2279 23519482353489
SE2280 23534792356988
SE2281 23569852357557
SE2282 23578102358469
SE2283 23586392359604
SE2284 23597482361103
SE2285 23617132362021
SE2286 23620812362461
SE2288 23633222364170
SE2289 23645632364826
SE2290 23649262365816
SE2291 23658172366362
SE2292 23665692367342
SE2295 23703882370636
SE2297 23714502371797
SE2298 23718142372617
SE2299 23726192373545
SE2315 23978312398616
SE2316 23991292399515
SE2321 24043762405035
SE2328 24111072411835
x_16 24128652413113
SE2330 24131552413523
PSM-a_SERP0083 24183132418378
PSM-d_SERP0082 24184262418536
SE2334 24187882419051
SE2348 24293122430778
SE2349 24308162432084
SE2350 24320842432662
SE2351 24332592433666
SE2352 24337942434459
SE2354 24357962437184
SE2357 24394282439997
SE2358 24400122441535
SE2365 24439872444652
SE2368 24455672445827
BACT000018 (rpsR) 24462972446539
SE2372 24471162447412
BACT000006 (rpsF) 24471162447412
SE2373 24477972448606
SE2374 24486802448871
ychF 24491042450201
SE2377 24504372451312
SE2378 24514672452309
SE2379 24530382454141
SE2382 24571022459348
SE2384 24603312461515
SE2398 24793562480000
SE2399 24800162480417
SE2402 24833632483554
SE2403 24836262485680
SE2405 24866702487866
SE2411 24920122492407
gidA 24947842496661
SE2418 24982592498606
BACT000063 (rpmH) 24987652498902
SE2419 24987652498902
45085 AE015934.1 Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-05, complete sequence 24365
45083 AE015933.1 Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-04, complete sequence 17261
45082 AE015932.1 Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-03, complete sequence 8007
45080 AE015935.1 Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-06, complete sequence 6585
45081 AE015931.1 Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-02, complete sequence 4679
45084 AE015930.1 Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-01, complete sequence 4439