glpK allele sequence: id-546

Contig position

sequence bin id
9822
contig length
95922
start
85362
end
85895
length
534
orientation
forward
complete
yes
Options

Sequence

GCGGGATGCG GAGAATGGTG ACGCGCTCTT CGGGACGCCC GACAGCTGGG TGATCTGGAA TCTCACCGGC GGTGTCCGCA GCGGGGTACA TGTCACCGAT GTGACAAATG CCAGTCGCAC CATGTTGATG AACCTGGAGA CCCTGGACTG GGATGACGAG CTGTTGTCGT TCTTTTCCAT TCCGCGCCAG ATGCTTCCGC CGATCAAGGC GTCGTCGCCG GTGGAGCCGT TCGGCTTCAC GACGCAGCTG GGTCCGCTGG GCGGAGAGGT TCCCATCGCC GGCGATCTGG GTGATCAGCA GGCCGCGATG GTGGGGCAGG TGTGCCTGAA CCCCGGCGAG GCCAAGAACA CCTACGGCAC CGGAAACTTC TTGCTACTCA ACACCGGTGA GGAACTGGTC CATTCGAGCA ATGGGCTGTT GACCACCGTC TGTTATCAAT TCGGCGACAA CAAGCCGGTG TATGCGCTGG AGGGATCGAT CGCGGTGACG GGCTCCGCGG TGCAGTGGCT GCGCGACCAG CTGGGCATCA TCAGCGGTGC CTCGCAAAGC GAGGACCTGG CGCGCCAGGT CGAGGACAAC GGCGGCGTCT ATTTCGTGCC GGCCTTTTCC GGGCTGTTCG CGCCGTACTG GCGATCGGAT GCACGCGGCG CCATCGTGGG TCTGTCCCGG TTCAACACCA ACGCGCACTT GGCGCGCGCG ACACTCGAAG CCATCTGTTA CCAGAGCCGG GAAG

Translation


          A  G  C  G  E  W  *  R  A  L  R  D  A  R  Q  L  G  D  L  E  S  H  R  R  C  P  Q  R  G  T  C  H  R  C   F1
           R  D  A  E  N  G  D  A  L  F  G  T  P  D  S  W  V  I  W  N  L  T  G  G  V  R  S  G  V  H  V  T  D     F2
            G  M  R  R  M  V  T  R  S  S  G  R  P  T  A  G  *  S  G  I  S  P  A  V  S  A  A  G  Y  M  S  P  M    F3
        1 GCGGGATGCGGAGAATGGTGACGCGCTCTTCGGGACGCCCGACAGCTGGGTGATCTGGAATCTCACCGGCGGTGTCCGCAGCGGGGTACATGTCACCGAT 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            D  K  C  Q  S  H  H  V  D  E  P  G  D  P  G  L  G  *  R  A  V  V  V  L  F  H  S  A  P  D  A  S  A    F1
          V  T  N  A  S  R  T  M  L  M  N  L  E  T  L  D  W  D  D  E  L  L  S  F  F  S  I  P  R  Q  M  L  P  P   F2
           *  Q  M  P  V  A  P  C  *  *  T  W  R  P  W  T  G  M  T  S  C  C  R  S  F  P  F  R  A  R  C  F  R     F3
      101 GTGACAAATGCCAGTCGCACCATGTTGATGAACCTGGAGACCCTGGACTGGGATGACGAGCTGTTGTCGTTCTTTTCCATTCCGCGCCAGATGCTTCCGC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           D  Q  G  V  V  A  G  G  A  V  R  L  H  D  A  A  G  S  A  G  R  R  G  S  H  R  R  R  S  G  *  S  A     F1
            I  K  A  S  S  P  V  E  P  F  G  F  T  T  Q  L  G  P  L  G  G  E  V  P  I  A  G  D  L  G  D  Q  Q    F2
          R  S  R  R  R  R  R  W  S  R  S  A  S  R  R  S  W  V  R  W  A  E  R  F  P  S  P  A  I  W  V  I  S  R   F3
      201 CGATCAAGGCGTCGTCGCCGGTGGAGCCGTTCGGCTTCACGACGCAGCTGGGTCCGCTGGGCGGAGAGGTTCCCATCGCCGGCGATCTGGGTGATCAGCA 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          G  R  D  G  G  A  G  V  P  E  P  R  R  G  Q  E  H  L  R  H  R  K  L  L  A  T  Q  H  R  *  G  T  G  P   F1
           A  A  M  V  G  Q  V  C  L  N  P  G  E  A  K  N  T  Y  G  T  G  N  F  L  L  L  N  T  G  E  E  L  V     F2
            P  R  W  W  G  R  C  A  *  T  P  A  R  P  R  T  P  T  A  P  E  T  S  C  Y  S  T  P  V  R  N  W  S    F3
      301 GGCCGCGATGGTGGGGCAGGTGTGCCTGAACCCCGGCGAGGCCAAGAACACCTACGGCACCGGAAACTTCTTGCTACTCAACACCGGTGAGGAACTGGTC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            F  E  Q  W  A  V  D  H  R  L  L  S  I  R  R  Q  Q  A  G  V  C  A  G  G  I  D  R  G  D  G  L  R  G    F1
          H  S  S  N  G  L  L  T  T  V  C  Y  Q  F  G  D  N  K  P  V  Y  A  L  E  G  S  I  A  V  T  G  S  A  V   F2
           I  R  A  M  G  C  *  P  P  S  V  I  N  S  A  T  T  S  R  C  M  R  W  R  D  R  S  R  *  R  A  P  R     F3
      401 CATTCGAGCAATGGGCTGTTGACCACCGTCTGTTATCAATTCGGCGACAACAAGCCGGTGTATGCGCTGGAGGGATCGATCGCGGTGACGGGCTCCGCGG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           A  V  A  A  R  P  A  G  H  H  Q  R  C  L  A  K  R  G  P  G  A  P  G  R  G  Q  R  R  R  L  F  R  A     F1
            Q  W  L  R  D  Q  L  G  I  I  S  G  A  S  Q  S  E  D  L  A  R  Q  V  E  D  N  G  G  V  Y  F  V  P    F2
          C  S  G  C  A  T  S  W  A  S  S  A  V  P  R  K  A  R  T  W  R  A  R  S  R  T  T  A  A  S  I  S  C  R   F3
      501 TGCAGTGGCTGCGCGACCAGCTGGGCATCATCAGCGGTGCCTCGCAAAGCGAGGACCTGGCGCGCCAGGTCGAGGACAACGGCGGCGTCTATTTCGTGCC 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          G  L  F  R  A  V  R  A  V  L  A  I  G  C  T  R  R  H  R  G  S  V  P  V  Q  H  Q  R  A  L  G  A  R  D   F1
           A  F  S  G  L  F  A  P  Y  W  R  S  D  A  R  G  A  I  V  G  L  S  R  F  N  T  N  A  H  L  A  R  A     F2
            P  F  P  G  C  S  R  R  T  G  D  R  M  H  A  A  P  S  W  V  C  P  G  S  T  P  T  R  T  W  R  A  R    F3
      601 GGCCTTTTCCGGGCTGTTCGCGCCGTACTGGCGATCGGATGCACGCGGCGCCATCGTGGGTCTGTCCCGGTTCAACACCAACGCGCACTTGGCGCGCGCG 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            T  R  S  H  L  L  P  E  P  G  X                                                                      F1
          T  L  E  A  I  C  Y  Q  S  R  E  X                                                                     F2
           H  S  K  P  S  V  T  R  A  G  K                                                                       F3
      701 ACACTCGAAGCCATCTGTTACCAGAGCCGGGAAG 734
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