pta allele sequence: id-430

Contig position

sequence bin id
918
contig length
681574
start
442034
end
442519
length
486
orientation
forward
complete
yes
Options

Sequence

CCGTGAGGCC ACCAGCTTCA TGGTCGCGGG CATGACAGCC GAACATTGCC TGGAGCGGCT CAAGGAGGGG CAGGCCGTCA TCTTCCCCGC GGACCGCTCG GACGTACTAC TGGCCGTGGC AAGCGCGCAT GTGGCAGAAG GCTTTCCGTC GCTTTCGGCC ATCATCTTGA ACGGTGGGCT CAAGCTGCAC CCGCGCATCG CCGATCTGGT GGACGGTATC GGGCTGCGGT TGCCGATCAT CGAGACGGAC TCCGGCACCT TCGAGACCGC GAGCGCGGCC GCGCATGCGC GTGGCCGGGT GACGGTGGCT TCTGCGCGCA AGATCGATAC CGCGCTCGCG CTGATGGACA GGTACGTGGA TGGCGCGGAT CTCGTTGCGC AGCTCGCTAT CCCGATACCG TCGGTCACCA CGCCGCAGAT GTTCGAGTAC CAGCTGTTGG ACCGGGCACG CGACAACCGC AAGCGCATCG TGTTGCCCGA GGGCGACGAC GACAGGATTC TCAAGGCCGC CGGCCGGCTG TTGCAGCGCC AGGTCGCCGA CCTGACGATC CTGGGCGAAG AGGCCGAAAT CCGCTCCCGT GCTGCCGAGC TCGGCGTTGA CATCTCGAAC GCACTCGTTG TCAGTCCCAA GACCAGCGAT CTGGCCGAGA AGTTCGCAGA CCAGTACTTC GAGCTGCGTA AGCACA

Translation


          P  *  G  H  Q  L  H  G  R  G  H  D  S  R  T  L  P  G  A  A  Q  G  G  A  G  R  H  L  P  R  G  P  L  G   F1
           R  E  A  T  S  F  M  V  A  G  M  T  A  E  H  C  L  E  R  L  K  E  G  Q  A  V  I  F  P  A  D  R  S     F2
            V  R  P  P  A  S  W  S  R  A  *  Q  P  N  I  A  W  S  G  S  R  R  G  R  P  S  S  S  P  R  T  A  R    F3
        1 CCGTGAGGCCACCAGCTTCATGGTCGCGGGCATGACAGCCGAACATTGCCTGGAGCGGCTCAAGGAGGGGCAGGCCGTCATCTTCCCCGCGGACCGCTCG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  T  T  G  R  G  K  R  A  C  G  R  R  L  S  V  A  F  G  H  H  L  E  R  W  A  Q  A  A  P  A  H  R    F1
          D  V  L  L  A  V  A  S  A  H  V  A  E  G  F  P  S  L  S  A  I  I  L  N  G  G  L  K  L  H  P  R  I  A   F2
           T  Y  Y  W  P  W  Q  A  R  M  W  Q  K  A  F  R  R  F  R  P  S  S  *  T  V  G  S  S  C  T  R  A  S     F3
      101 GACGTACTACTGGCCGTGGCAAGCGCGCATGTGGCAGAAGGCTTTCCGTCGCTTTCGGCCATCATCTTGAACGGTGGGCTCAAGCTGCACCCGCGCATCG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  S  G  G  R  Y  R  A  A  V  A  D  H  R  D  G  L  R  H  L  R  D  R  E  R  G  R  A  C  A  W  P  G     F1
            D  L  V  D  G  I  G  L  R  L  P  I  I  E  T  D  S  G  T  F  E  T  A  S  A  A  A  H  A  R  G  R  V    F2
          P  I  W  W  T  V  S  G  C  G  C  R  S  S  R  R  T  P  A  P  S  R  P  R  A  R  P  R  M  R  V  A  G  *   F3
      201 CCGATCTGGTGGACGGTATCGGGCTGCGGTTGCCGATCATCGAGACGGACTCCGGCACCTTCGAGACCGCGAGCGCGGCCGCGCATGCGCGTGGCCGGGT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          D  G  G  F  C  A  Q  D  R  Y  R  A  R  A  D  G  Q  V  R  G  W  R  G  S  R  C  A  A  R  Y  P  D  T  V   F1
           T  V  A  S  A  R  K  I  D  T  A  L  A  L  M  D  R  Y  V  D  G  A  D  L  V  A  Q  L  A  I  P  I  P     F2
            R  W  L  L  R  A  R  S  I  P  R  S  R  *  W  T  G  T  W  M  A  R  I  S  L  R  S  S  L  S  R  Y  R    F3
      301 GACGGTGGCTTCTGCGCGCAAGATCGATACCGCGCTCGCGCTGATGGACAGGTACGTGGATGGCGCGGATCTCGTTGCGCAGCTCGCTATCCCGATACCG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  H  H  A  A  D  V  R  V  P  A  V  G  P  G  T  R  Q  P  Q  A  H  R  V  A  R  G  R  R  R  Q  D  S    F1
          S  V  T  T  P  Q  M  F  E  Y  Q  L  L  D  R  A  R  D  N  R  K  R  I  V  L  P  E  G  D  D  D  R  I  L   F2
           R  S  P  R  R  R  C  S  S  T  S  C  W  T  G  H  A  T  T  A  S  A  S  C  C  P  R  A  T  T  T  G  F     F3
      401 TCGGTCACCACGCCGCAGATGTTCGAGTACCAGCTGTTGGACCGGGCACGCGACAACCGCAAGCGCATCGTGTTGCCCGAGGGCGACGACGACAGGATTC 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           Q  G  R  R  P  A  V  A  A  P  G  R  R  P  D  D  P  G  R  R  G  R  N  P  L  P  C  C  R  A  R  R  *     F1
            K  A  A  G  R  L  L  Q  R  Q  V  A  D  L  T  I  L  G  E  E  A  E  I  R  S  R  A  A  E  L  G  V  D    F2
          S  R  P  P  A  G  C  C  S  A  R  S  P  T  *  R  S  W  A  K  R  P  K  S  A  P  V  L  P  S  S  A  L  T   F3
      501 TCAAGGCCGCCGGCCGGCTGTTGCAGCGCCAGGTCGCCGACCTGACGATCCTGGGCGAAGAGGCCGAAATCCGCTCCCGTGCTGCCGAGCTCGGCGTTGA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          H  L  E  R  T  R  C  Q  S  Q  D  Q  R  S  G  R  E  V  R  R  P  V  L  R  A  A  *  A  X                  F1
           I  S  N  A  L  V  V  S  P  K  T  S  D  L  A  E  K  F  A  D  Q  Y  F  E  L  R  K  H  X                 F2
            S  R  T  H  S  L  S  V  P  R  P  A  I  W  P  R  S  S  Q  T  S  T  S  S  C  V  S  T                   F3
      601 CATCTCGAACGCACTCGTTGTCAGTCCCAAGACCAGCGATCTGGCCGAGAAGTTCGCAGACCAGTACTTCGAGCTGCGTAAGCACA 686
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