gnd allele sequence: id-430
Contig position
- sequence bin id
- 886
- contig length
- 459336
- start
- 292128
- end
- 292607
- length
- 480
- orientation
- reverse
- complete
- yes
Sequence
GGCCGTGTTC GCCCGTGCGC TGTCCGGCTC GAAGCCGCAA CGCGCCGCTT CCGTCGGCTT CGCCTCAGGT CAGCTCGGCG AAAAGCCAAG CGATGCAAAA CAGTTCGTTG AAGATGTGCG CCAAGCGCTG TACGCCTCCA AGATCGTGGC CTACGCCCAG GGGTTCAACC AGATCGCGGC GGGCAGCGCC GAGTACGGCT GGAACGTCAA CCCTGGCGAT CTGGCCACCA TTTGGCGTGG CGGCTGCATC ATCCGCGCGC AGTTCCTCAA TCGGGTCAAA GAAGCATTCG CCGATCGGCC GGACCTGGCC ACGCTGATCG CGGCACCGTA CTTCCGCGAC GCCGTCGAGA AGGGCATCGA CAGCTGGCGG CGCGTGGTGG TCACCGCCAC CCAGCTGGGT ATTCCGGTAC CAGGCTTCGC CTCGTCGCTG TCCTACTACG ACGGTCTGCG TACCGATCGC CTGCCCGCCG CACTGACCCA GGCGCAACGC GACTTCTTCG GTGCCCACAC CTATGAGCGC ATCGACGCCC CCGGCAAGTT CCACACGCTC TGGAGCGGCG ACCGCAACGA AGTAGAGGCG TAACGGCCAG AAGAGTAGGG CGTCACATAT GAAGTTCCTG GACGGGCAGC GGCCGCCGTA CGATCTCACG TATGACGACG TCTTCGTGGT GCCCAACCAC
Translation
G R V R P C A V R L E A A T R R F R R L R L R S A R R K A K R C K T F1
A V F A R A L S G S K P Q R A A S V G F A S G Q L G E K P S D A K F2
P C S P V R C P A R S R N A P L P S A S P Q V S S A K S Q A M Q N F3
1 GGCCGTGTTCGCCCGTGCGCTGTCCGGCTCGAAGCCGCAACGCGCCGCTTCCGTCGGCTTCGCCTCAGGTCAGCTCGGCGAAAAGCCAAGCGATGCAAAA 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
V R * R C A P S A V R L Q D R G L R P G V Q P D R G G Q R R V R L F1
Q F V E D V R Q A L Y A S K I V A Y A Q G F N Q I A A G S A E Y G W F2
S S L K M C A K R C T P P R S W P T P R G S T R S R R A A P S T A F3
101 CAGTTCGTTGAAGATGTGCGCCAAGCGCTGTACGCCTCCAAGATCGTGGCCTACGCCCAGGGGTTCAACCAGATCGCGGCGGGCAGCGCCGAGTACGGCT 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
E R Q P W R S G H H L A W R L H H P R A V P Q S G Q R S I R R S A F1
N V N P G D L A T I W R G G C I I R A Q F L N R V K E A F A D R P F2
G T S T L A I W P P F G V A A A S S A R S S S I G S K K H S P I G R F3
201 GGAACGTCAACCCTGGCGATCTGGCCACCATTTGGCGTGGCGGCTGCATCATCCGCGCGCAGTTCCTCAATCGGGTCAAAGAAGCATTCGCCGATCGGCC 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G P G H A D R G T V L P R R R R E G H R Q L A A R G G H R H P A G Y F1
D L A T L I A A P Y F R D A V E K G I D S W R R V V V T A T Q L G F2
T W P R * S R H R T S A T P S R R A S T A G G A W W S P P P S W V F3
301 GGACCTGGCCACGCTGATCGCGGCACCGTACTTCCGCGACGCCGTCGAGAAGGGCATCGACAGCTGGCGGCGCGTGGTGGTCACCGCCACCCAGCTGGGT 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
S G T R L R L V A V L L R R S A Y R S P A R R T D P G A T R L L R F1
I P V P G F A S S L S Y Y D G L R T D R L P A A L T Q A Q R D F F G F2
F R Y Q A S P R R C P T T T V C V P I A C P P H * P R R N A T S S F3
401 ATTCCGGTACCAGGCTTCGCCTCGTCGCTGTCCTACTACGACGGTCTGCGTACCGATCGCCTGCCCGCCGCACTGACCCAGGCGCAACGCGACTTCTTCG 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
C P H L * A H R R P R Q V P H A L E R R P Q R S R G V T A R R V G F1
A H T Y E R I D A P G K F H T L W S G D R N E V E A * R P E E * G F2
V P T P M S A S T P P A S S T R S G A A T A T K * R R N G Q K S R A F3
501 GTGCCCACACCTATGAGCGCATCGACGCCCCCGGCAAGTTCCACACGCTCTGGAGCGGCGACCGCAACGAAGTAGAGGCGTAACGGCCAGAAGAGTAGGG 600
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R H I * S S W T G S G R R T I S R M T T S S W C P T T F1
V T Y E V P G R A A A A V R S H V * R R L R G A Q P X F2
S H M K F L D G Q R P P Y D L T Y D D V F V V P N H F3
601 CGTCACATATGAAGTTCCTGGACGGGCAGCGGCCGCCGTACGATCTCACGTATGACGACGTCTTCGTGGTGCCCAACCAC 680
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|