cya allele sequence: id-430

Contig position

sequence bin id
904
contig length
149923
start
77751
end
78260
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510
orientation
reverse
complete
yes
Options

Sequence

GTTCGGCCGC TACGTCGGCG AGGACGTGGC GCGCCGGGCG CTCGAATACG GCACCGAACT GGGAGGCCAG GAGCGCAGCG TCGCGGTGCT CTTCGTCGAC CTGGTGGGGT CCACCCAGTT GGCGTCCACT CGGGGGCCTG CGGTGGTCGT ACGGGTGCTC AACGAGTTCT TCCGGGTCAT CGTCGACACC GTCAACAAGC ACGGCGGCTT CGTGAACAAG TTCCAGGGTG ACGCGGCGCT GGCGATTTTT GGTGCCCCGA TCGACCACCC GGACGGCGCC GCAGCGGCAC TTGCGGCCGC TCGTGAGCTG TCGGGCGAGC TGACCAATGT GTTGGGCTCC AATGACTTCG GCATAGGAGT CTCCGCCGGA CGGGCGATCG CCGGGCATAT CGGCGCACAG GCCCGATTCG AGTACACCGT GATCGGCGAC CCGGTGAACG AAGCGGCCCG ACTCACCGAG CTGGCTAAGA ACGAGCCGGG CAACGTGCTC GCGTCGGCCT CCGCAGTCAT GGAGGCGCGC GACGAGGAGG CACTGCGCTG GGATGTCGGC GAGACCGTCG AGCTGCGCGG CCGCACGGTC TCAACGCAGG TTGCGCGCCC GCGTCACGGC TAAGTCGCCT TCTTCGCGGC CTTTTTCGCG GTCGCCTTTT TGGCCGGGGC CTTCTTGGCA GCCTTCGCCG GTGCCTTTTT GGCCCGCTTC ACCGGCCCGC

Translation


          V  R  P  L  R  R  R  G  R  G  A  P  G  A  R  I  R  H  R  T  G  R  P  G  A  Q  R  R  G  A  L  R  R  P   F1
           F  G  R  Y  V  G  E  D  V  A  R  R  A  L  E  Y  G  T  E  L  G  G  Q  E  R  S  V  A  V  L  F  V  D     F2
            S  A  A  T  S  A  R  T  W  R  A  G  R  S  N  T  A  P  N  W  E  A  R  S  A  A  S  R  C  S  S  S  T    F3
        1 GTTCGGCCGCTACGTCGGCGAGGACGTGGCGCGCCGGGCGCTCGAATACGGCACCGAACTGGGAGGCCAGGAGCGCAGCGTCGCGGTGCTCTTCGTCGAC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  G  V  H  P  V  G  V  H  S  G  A  C  G  G  R  T  G  A  Q  R  V  L  P  G  H  R  R  H  R  Q  Q  A    F1
          L  V  G  S  T  Q  L  A  S  T  R  G  P  A  V  V  V  R  V  L  N  E  F  F  R  V  I  V  D  T  V  N  K  H   F2
           W  W  G  P  P  S  W  R  P  L  G  G  L  R  W  S  Y  G  C  S  T  S  S  S  G  S  S  S  T  P  S  T  S     F3
      101 CTGGTGGGGTCCACCCAGTTGGCGTCCACTCGGGGGCCTGCGGTGGTCGTACGGGTGCTCAACGAGTTCTTCCGGGTCATCGTCGACACCGTCAACAAGC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  R  L  R  E  Q  V  P  G  *  R  G  A  G  D  F  W  C  P  D  R  P  P  G  R  R  R  S  G  T  C  G  R     F1
            G  G  F  V  N  K  F  Q  G  D  A  A  L  A  I  F  G  A  P  I  D  H  P  D  G  A  A  A  A  L  A  A  A    F2
          T  A  A  S  *  T  S  S  R  V  T  R  R  W  R  F  L  V  P  R  S  T  T  R  T  A  P  Q  R  H  L  R  P  L   F3
      201 ACGGCGGCTTCGTGAACAAGTTCCAGGGTGACGCGGCGCTGGCGATTTTTGGTGCCCCGATCGACCACCCGGACGGCGCCGCAGCGGCACTTGCGGCCGC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          S  *  A  V  G  R  A  D  Q  C  V  G  L  Q  *  L  R  H  R  S  L  R  R  T  G  D  R  R  A  Y  R  R  T  G   F1
           R  E  L  S  G  E  L  T  N  V  L  G  S  N  D  F  G  I  G  V  S  A  G  R  A  I  A  G  H  I  G  A  Q     F2
            V  S  C  R  A  S  *  P  M  C  W  A  P  M  T  S  A  *  E  S  P  P  D  G  R  S  P  G  I  S  A  H  R    F3
      301 TCGTGAGCTGTCGGGCGAGCTGACCAATGTGTTGGGCTCCAATGACTTCGGCATAGGAGTCTCCGCCGGACGGGCGATCGCCGGGCATATCGGCGCACAG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            P  I  R  V  H  R  D  R  R  P  G  E  R  S  G  P  T  H  R  A  G  *  E  R  A  G  Q  R  A  R  V  G  L    F1
          A  R  F  E  Y  T  V  I  G  D  P  V  N  E  A  A  R  L  T  E  L  A  K  N  E  P  G  N  V  L  A  S  A  S   F2
           P  D  S  S  T  P  *  S  A  T  R  *  T  K  R  P  D  S  P  S  W  L  R  T  S  R  A  T  C  S  R  R  P     F3
      401 GCCCGATTCGAGTACACCGTGATCGGCGACCCGGTGAACGAAGCGGCCCGACTCACCGAGCTGGCTAAGAACGAGCCGGGCAACGTGCTCGCGTCGGCCT 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  S  H  G  G  A  R  R  G  G  T  A  L  G  C  R  R  D  R  R  A  A  R  P  H  G  L  N  A  G  C  A  P     F1
            A  V  M  E  A  R  D  E  E  A  L  R  W  D  V  G  E  T  V  E  L  R  G  R  T  V  S  T  Q  V  A  R  P    F2
          P  Q  S  W  R  R  A  T  R  R  H  C  A  G  M  S  A  R  P  S  S  C  A  A  A  R  S  Q  R  R  L  R  A  R   F3
      501 CCGCAGTCATGGAGGCGCGCGACGAGGAGGCACTGCGCTGGGATGTCGGCGAGACCGTCGAGCTGCGCGGCCGCACGGTCTCAACGCAGGTTGCGCGCCC 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          A  S  R  L  S  R  L  L  R  G  L  F  R  G  R  L  F  G  R  G  L  L  G  S  L  R  R  C  L  F  G  P  L  H   F1
           R  H  G  *  V  A  F  F  A  A  F  F  A  V  A  F  L  A  G  A  F  L  A  A  F  A  G  A  F  L  A  R  F     F2
            V  T  A  K  S  P  S  S  R  P  F  S  R  S  P  F  W  P  G  P  S  W  Q  P  S  P  V  P  F  W  P  A  S    F3
      601 GCGTCACGGCTAAGTCGCCTTCTTCGCGGCCTTTTTCGCGGTCGCCTTTTTGGCCGGGGCCTTCTTGGCAGCCTTCGCCGGTGCCTTTTTGGCCCGCTTC 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  P  A                                                                                              F1
          T  G  P  X                                                                                             F2
           P  A  R                                                                                               F3
      701 ACCGGCCCGC 710
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