gdh (gdh) allele sequence: id-225

Contig position

sequence bin id
11240
contig length
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start
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end
30812
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orientation
reverse
complete
yes
Options

Sequence

ATCGGTGCAA ATCACGGTGG CAGAACAACT GGGCGTGGAA GAGCGCGGCG AGTTTTATGA CATCACAGGT GCATTGCGCG ACATGATGCA AAACCACATC ATGCAAATGC TGTGTTTTGT GGCAATGGAA CAACCCAAAT CGTTGAGCGC AGACGATGTA CGCGATGAAA AATTGAAAGT GGTGGCTGCA CTCAAACCGA TGACTTCGGC AGATGTAGAT AAAAACGTGA TTCGCGCACA ATATGTGGCA AACGGCGAGC AAAACGGCTA TTTGCAAGAA CACAATGTGC CAGCCGACAG CCGTACCGAA ACCTATGTTG CCATTCGCGC CGAAATTGAT ACGCCACGTT GGGCAGGCGT GCCGTTTTAT TTGCGTACAG GCAAACGCTT GGCAACGCGC ACAGCAGAAA TTGTTTTGAA TTTCAAAGAC CAAGCCAATG GTTTGTTTGG CACAAATCCT AATCGTTTGG TGATTTCGTT GCAGCCCGAT GAAACCGTAT CGCTCAAATT GTATGTGAAA CAAGTGGGCA GCGGCTTGGA CGTGCAGCCA ACCGAAATGG TGTTGGACAT GGGCACAGTG TCAGACGAAC GCCGCGCCGA AGCGTATGAA TTGCTGTTGC GCGAAGTGAT TGACGGACGT TTGAGCTTGT TCAATCGCCG CGACGAGCTG GAAAAAGCGT GGGAATGGGT CATGCCAATT TTGGACAACT GGGCAACTTC GCCTGTTGCA CCAGCCACTT ACGCTGCATC TAGCTGGGGG CCAAAAGAAG CGCAAG

Translation


          I  G  A  N  H  G  G  R  T  T  G  R  G  R  A  R  R  V  L  *  H  H  R  C  I  A  R  H  D  A  K  P  H  H   F1
           S  V  Q  I  T  V  A  E  Q  L  G  V  E  E  R  G  E  F  Y  D  I  T  G  A  L  R  D  M  M  Q  N  H  I     F2
            R  C  K  S  R  W  Q  N  N  W  A  W  K  S  A  A  S  F  M  T  S  Q  V  H  C  A  T  *  C  K  T  T  S    F3
        1 ATCGGTGCAAATCACGGTGGCAGAACAACTGGGCGTGGAAGAGCGCGGCGAGTTTTATGACATCACAGGTGCATTGCGCGACATGATGCAAAACCACATC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            A  N  A  V  F  C  G  N  G  T  T  Q  I  V  E  R  R  R  C  T  R  *  K  I  E  S  G  G  C  T  Q  T  D    F1
          M  Q  M  L  C  F  V  A  M  E  Q  P  K  S  L  S  A  D  D  V  R  D  E  K  L  K  V  V  A  A  L  K  P  M   F2
           C  K  C  C  V  L  W  Q  W  N  N  P  N  R  *  A  Q  T  M  Y  A  M  K  N  *  K  W  W  L  H  S  N  R     F3
      101 ATGCAAATGCTGTGTTTTGTGGCAATGGAACAACCCAAATCGTTGAGCGCAGACGATGTACGCGATGAAAAATTGAAAGTGGTGGCTGCACTCAAACCGA 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           D  F  G  R  C  R  *  K  R  D  S  R  T  I  C  G  K  R  R  A  K  R  L  F  A  R  T  Q  C  A  S  R  Q     F1
            T  S  A  D  V  D  K  N  V  I  R  A  Q  Y  V  A  N  G  E  Q  N  G  Y  L  Q  E  H  N  V  P  A  D  S    F2
          *  L  R  Q  M  *  I  K  T  *  F  A  H  N  M  W  Q  T  A  S  K  T  A  I  C  K  N  T  M  C  Q  P  T  A   F3
      201 TGACTTCGGCAGATGTAGATAAAAACGTGATTCGCGCACAATATGTGGCAAACGGCGAGCAAAACGGCTATTTGCAAGAACACAATGTGCCAGCCGACAG 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  Y  R  N  L  C  C  H  S  R  R  N  *  Y  A  T  L  G  R  R  A  V  L  F  A  Y  R  Q  T  L  G  N  A  H   F1
           R  T  E  T  Y  V  A  I  R  A  E  I  D  T  P  R  W  A  G  V  P  F  Y  L  R  T  G  K  R  L  A  T  R     F2
            V  P  K  P  M  L  P  F  A  P  K  L  I  R  H  V  G  Q  A  C  R  F  I  C  V  Q  A  N  A  W  Q  R  A    F3
      301 CCGTACCGAAACCTATGTTGCCATTCGCGCCGAAATTGATACGCCACGTTGGGCAGGCGTGCCGTTTTATTTGCGTACAGGCAAACGCTTGGCAACGCGC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            S  R  N  C  F  E  F  Q  R  P  S  Q  W  F  V  W  H  K  S  *  S  F  G  D  F  V  A  A  R  *  N  R  I    F1
          T  A  E  I  V  L  N  F  K  D  Q  A  N  G  L  F  G  T  N  P  N  R  L  V  I  S  L  Q  P  D  E  T  V  S   F2
           Q  Q  K  L  F  *  I  S  K  T  K  P  M  V  C  L  A  Q  I  L  I  V  W  *  F  R  C  S  P  M  K  P  Y     F3
      401 ACAGCAGAAATTGTTTTGAATTTCAAAGACCAAGCCAATGGTTTGTTTGGCACAAATCCTAATCGTTTGGTGATTTCGTTGCAGCCCGATGAAACCGTAT 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           A  Q  I  V  C  E  T  S  G  Q  R  L  G  R  A  A  N  R  N  G  V  G  H  G  H  S  V  R  R  T  P  R  R     F1
            L  K  L  Y  V  K  Q  V  G  S  G  L  D  V  Q  P  T  E  M  V  L  D  M  G  T  V  S  D  E  R  R  A  E    F2
          R  S  N  C  M  *  N  K  W  A  A  A  W  T  C  S  Q  P  K  W  C  W  T  W  A  Q  C  Q  T  N  A  A  P  K   F3
      501 CGCTCAAATTGTATGTGAAACAAGTGGGCAGCGGCTTGGACGTGCAGCCAACCGAAATGGTGTTGGACATGGGCACAGTGTCAGACGAACGCCGCGCCGA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          S  V  *  I  A  V  A  R  S  D  *  R  T  F  E  L  V  Q  S  P  R  R  A  G  K  S  V  G  M  G  H  A  N  F   F1
           A  Y  E  L  L  L  R  E  V  I  D  G  R  L  S  L  F  N  R  R  D  E  L  E  K  A  W  E  W  V  M  P  I     F2
            R  M  N  C  C  C  A  K  *  L  T  D  V  *  A  C  S  I  A  A  T  S  W  K  K  R  G  N  G  S  C  Q  F    F3
      601 AGCGTATGAATTGCTGTTGCGCGAAGTGATTGACGGACGTTTGAGCTTGTTCAATCGCCGCGACGAGCTGGAAAAAGCGTGGGAATGGGTCATGCCAATT 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  Q  L  G  N  F  A  C  C  T  S  H  L  R  C  I  *  L  G  A  K  R  S  A  X                            F1
          L  D  N  W  A  T  S  P  V  A  P  A  T  Y  A  A  S  S  W  G  P  K  E  A  Q  X                           F2
           W  T  T  G  Q  L  R  L  L  H  Q  P  L  T  L  H  L  A  G  G  Q  K  K  R  K                             F3
      701 TTGGACAACTGGGCAACTTCGCCTGTTGCACCAGCCACTTACGCTGCATCTAGCTGGGGGCCAAAAGAAGCGCAAG 776
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