recA (recA) allele sequence: id-224

Contig position

sequence bin id
11207
contig length
28754
start
22626
end
22979
length
354
orientation
reverse
complete
yes
Options

Sequence

GGCACAAATT GAGAAAAACT ACGGCAAAGG CGCAGTCATG AAAATGGACG GCAGCCACCA AGACGAAGAA TTGCAAGTCA TTTCCACAGG TTCGCTCACA TTGGACATTG CCTTGGGTGT GGGCGGTTTA CCACGCGGTC GTATTGTGGA AATTTACGGC GCAGAATCAT CGGGCAAAAC CACTTTATGT TTGGAATCGA TTGCACAATG CCAAAAAGCA GGCGGAACGT GTGCGTTTAT TGACGCAGAA CACGCATTTG ACCCAATTTA CGCGCGTAAA TTGGGCGTAG AAGTCGAAAA ATTGTTGGTA TCGCAACCCG ACACAGGCGA ACAAGCATTG GAAATTTGTG ATATGTTGGT GCGCTCGGGT GGTGTGGATA TGGTCGTGAT TGATTCGGTT GCCGCGCTTG TTCCCAAAGC GGAAATTGAA GGCGACATGG GTGATAGCCA CGTTGGTTTG CACGCTCGTT TGATGAGCCA AGCCTTGCGT AAACTGGCAG GACACATCAA AAAAACCAAC ACGCTGGCGG TGTTCATCAA CCAAACGCGC ATGA

Translation


          G  T  N  *  E  K  L  R  Q  R  R  S  H  E  N  G  R  Q  P  P  R  R  R  I  A  S  H  F  H  R  F  A  H  I   F1
           A  Q  I  E  K  N  Y  G  K  G  A  V  M  K  M  D  G  S  H  Q  D  E  E  L  Q  V  I  S  T  G  S  L  T     F2
            H  K  L  R  K  T  T  A  K  A  Q  S  *  K  W  T  A  A  T  K  T  K  N  C  K  S  F  P  Q  V  R  S  H    F3
        1 GGCACAAATTGAGAAAAACTACGGCAAAGGCGCAGTCATGAAAATGGACGGCAGCCACCAAGACGAAGAATTGCAAGTCATTTCCACAGGTTCGCTCACA 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  H  C  L  G  C  G  R  F  T  T  R  S  Y  C  G  N  L  R  R  R  I  I  G  Q  N  H  F  M  F  G  I  D    F1
          L  D  I  A  L  G  V  G  G  L  P  R  G  R  I  V  E  I  Y  G  A  E  S  S  G  K  T  T  L  C  L  E  S  I   F2
           W  T  L  P  W  V  W  A  V  Y  H  A  V  V  L  W  K  F  T  A  Q  N  H  R  A  K  P  L  Y  V  W  N  R     F3
      101 TTGGACATTGCCTTGGGTGTGGGCGGTTTACCACGCGGTCGTATTGTGGAAATTTACGGCGCAGAATCATCGGGCAAAACCACTTTATGTTTGGAATCGA 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           C  T  M  P  K  S  R  R  N  V  C  V  Y  *  R  R  T  R  I  *  P  N  L  R  A  *  I  G  R  R  S  R  K     F1
            A  Q  C  Q  K  A  G  G  T  C  A  F  I  D  A  E  H  A  F  D  P  I  Y  A  R  K  L  G  V  E  V  E  K    F2
          L  H  N  A  K  K  Q  A  E  R  V  R  L  L  T  Q  N  T  H  L  T  Q  F  T  R  V  N  W  A  *  K  S  K  N   F3
      201 TTGCACAATGCCAAAAAGCAGGCGGAACGTGTGCGTTTATTGACGCAGAACACGCATTTGACCCAATTTACGCGCGTAAATTGGGCGTAGAAGTCGAAAA 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          I  V  G  I  A  T  R  H  R  R  T  S  I  G  N  L  *  Y  V  G  A  L  G  W  C  G  Y  G  R  D  *  F  G  C   F1
           L  L  V  S  Q  P  D  T  G  E  Q  A  L  E  I  C  D  M  L  V  R  S  G  G  V  D  M  V  V  I  D  S  V     F2
            C  W  Y  R  N  P  T  Q  A  N  K  H  W  K  F  V  I  C  W  C  A  R  V  V  W  I  W  S  *  L  I  R  L    F3
      301 ATTGTTGGTATCGCAACCCGACACAGGCGAACAAGCATTGGAAATTTGTGATATGTTGGTGCGCTCGGGTGGTGTGGATATGGTCGTGATTGATTCGGTT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  A  C  S  Q  S  G  N  *  R  R  H  G  *  *  P  R  W  F  A  R  S  F  D  E  P  S  L  A  *  T  G  R    F1
          A  A  L  V  P  K  A  E  I  E  G  D  M  G  D  S  H  V  G  L  H  A  R  L  M  S  Q  A  L  R  K  L  A  G   F2
           P  R  L  F  P  K  R  K  L  K  A  T  W  V  I  A  T  L  V  C  T  L  V  *  *  A  K  P  C  V  N  W  Q     F3
      401 GCCGCGCTTGTTCCCAAAGCGGAAATTGAAGGCGACATGGGTGATAGCCACGTTGGTTTGCACGCTCGTTTGATGAGCCAAGCCTTGCGTAAACTGGCAG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           T  H  Q  K  N  Q  H  A  G  G  V  H  Q  P  N  A  H  X                                                  F1
            H  I  K  K  T  N  T  L  A  V  F  I  N  Q  T  R  M  X                                                 F2
          D  T  S  K  K  P  T  R  W  R  C  S  S  T  K  R  A  *                                                   F3
      501 GACACATCAAAAAAACCAACACGCTGGCGGTGTTCATCAACCAAACGCGCATGA 554
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