abcZ (abcZ) allele sequence: id-223

Contig position

sequence bin id
10988
contig length
88632
start
82368
end
82820
length
453
orientation
forward
complete
yes
Options

Sequence

TGGTCAAATC ATCGTGCAAA ACGGCATGAA AATTGTCTAT GTGCCGCAAG AAAGCGTGTT TGACGACCAA GCGAGCGTGT TTGATGTCGT GTCGCAAGGT TTGGGCGATT TGCGCGATGT GTTGCGCCGT TATCATCAGG TTAGTCACGC GCTGGAAACG CAGCATTCTG ATGATTTAAT TCGCCAACTC AATGAGTTAC AAAATGAAAT TGAATCGCAG GACGGCTGGC AGTTTGACGC GGCAATCCGC CAAACGATTA GCGAATTGGG GCTGCCTGAA AATGAATGGA TTGGCAACTT GTCGGGTGGT CAGAAAAAAC GTGTGGCGTT GGCGCAAGCG TGGGTGCAAA AACCCGATAT TTTGTTGCTG GACGAACCGA CTAACCATTT GGATATTAAC GCGATTATTT GGCTGGAAAA TTTGTTGCAA ACGTTTTCAG GCAGCATGGT GGTGATTACG CACGACCGCC GTTTTTTGGA CAACATCGCC AATCGGATTG TGGAATTAGA CAGGGGCGTG TTGCGTTCGT ACGAAGGCAG TTTCAGCAAA TACAGCGAGA AAAAGGCGCA GGAATTGGCG GTTGAGGCGG AACACAATCG CCTGTTTGAT AAATTTCACG CGCAGGAAGA AGTATGGATT CGCAAGGGCA TTG

Translation


          W  S  N  H  R  A  K  R  H  E  N  C  L  C  A  A  R  K  R  V  *  R  P  S  E  R  V  *  C  R  V  A  R  F   F1
           G  Q  I  I  V  Q  N  G  M  K  I  V  Y  V  P  Q  E  S  V  F  D  D  Q  A  S  V  F  D  V  V  S  Q  G     F2
            V  K  S  S  C  K  T  A  *  K  L  S  M  C  R  K  K  A  C  L  T  T  K  R  A  C  L  M  S  C  R  K  V    F3
        1 TGGTCAAATCATCGTGCAAAACGGCATGAAAATTGTCTATGTGCCGCAAGAAAGCGTGTTTGACGACCAAGCGAGCGTGTTTGATGTCGTGTCGCAAGGT 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  R  F  A  R  C  V  A  P  L  S  S  G  *  S  R  A  G  N  A  A  F  *  *  F  N  S  P  T  Q  *  V  T    F1
          L  G  D  L  R  D  V  L  R  R  Y  H  Q  V  S  H  A  L  E  T  Q  H  S  D  D  L  I  R  Q  L  N  E  L  Q   F2
           W  A  I  C  A  M  C  C  A  V  I  I  R  L  V  T  R  W  K  R  S  I  L  M  I  *  F  A  N  S  M  S  Y     F3
      101 TTGGGCGATTTGCGCGATGTGTTGCGCCGTTATCATCAGGTTAGTCACGCGCTGGAAACGCAGCATTCTGATGATTTAATTCGCCAACTCAATGAGTTAC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           K  *  N  *  I  A  G  R  L  A  V  *  R  G  N  P  P  N  D  *  R  I  G  A  A  *  K  *  M  D  W  Q  L     F1
            N  E  I  E  S  Q  D  G  W  Q  F  D  A  A  I  R  Q  T  I  S  E  L  G  L  P  E  N  E  W  I  G  N  L    F2
          K  M  K  L  N  R  R  T  A  G  S  L  T  R  Q  S  A  K  R  L  A  N  W  G  C  L  K  M  N  G  L  A  T  C   F3
      201 AAAATGAAATTGAATCGCAGGACGGCTGGCAGTTTGACGCGGCAATCCGCCAAACGATTAGCGAATTGGGGCTGCCTGAAAATGAATGGATTGGCAACTT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          V  G  W  S  E  K  T  C  G  V  G  A  S  V  G  A  K  T  R  Y  F  V  A  G  R  T  D  *  P  F  G  Y  *  R   F1
           S  G  G  Q  K  K  R  V  A  L  A  Q  A  W  V  Q  K  P  D  I  L  L  L  D  E  P  T  N  H  L  D  I  N     F2
            R  V  V  R  K  N  V  W  R  W  R  K  R  G  C  K  N  P  I  F  C  C  W  T  N  R  L  T  I  W  I  L  T    F3
      301 GTCGGGTGGTCAGAAAAAACGTGTGGCGTTGGCGCAAGCGTGGGTGCAAAAACCCGATATTTTGTTGCTGGACGAACCGACTAACCATTTGGATATTAAC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            D  Y  L  A  G  K  F  V  A  N  V  F  R  Q  H  G  G  D  Y  A  R  P  P  F  F  G  Q  H  R  Q  S  D  C    F1
          A  I  I  W  L  E  N  L  L  Q  T  F  S  G  S  M  V  V  I  T  H  D  R  R  F  L  D  N  I  A  N  R  I  V   F2
           R  L  F  G  W  K  I  C  C  K  R  F  Q  A  A  W  W  *  L  R  T  T  A  V  F  W  T  T  S  P  I  G  L     F3
      401 GCGATTATTTGGCTGGAAAATTTGTTGCAAACGTTTTCAGGCAGCATGGTGGTGATTACGCACGACCGCCGTTTTTTGGACAACATCGCCAATCGGATTG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  I  R  Q  G  R  V  A  F  V  R  R  Q  F  Q  Q  I  Q  R  E  K  G  A  G  I  G  G  *  G  G  T  Q  S     F1
            E  L  D  R  G  V  L  R  S  Y  E  G  S  F  S  K  Y  S  E  K  K  A  Q  E  L  A  V  E  A  E  H  N  R    F2
          W  N  *  T  G  A  C  C  V  R  T  K  A  V  S  A  N  T  A  R  K  R  R  R  N  W  R  L  R  R  N  T  I  A   F3
      501 TGGAATTAGACAGGGGCGTGTTGCGTTCGTACGAAGGCAGTTTCAGCAAATACAGCGAGAAAAAGGCGCAGGAATTGGCGGTTGAGGCGGAACACAATCG 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  V  *  *  I  S  R  A  G  R  S  M  D  S  Q  G  H  X                                                   F1
           L  F  D  K  F  H  A  Q  E  E  V  W  I  R  K  G  I  X                                                  F2
            C  L  I  N  F  T  R  R  K  K  Y  G  F  A  R  A  L                                                    F3
      601 CCTGTTTGATAAATTTCACGCGCAGGAAGAAGTATGGATTCGCAAGGGCATTG 653
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