abcZ (abcZ) allele sequence: id-220

Contig position

sequence bin id
10774
contig length
91754
start
59892
end
60344
length
453
orientation
forward
complete
yes
Options

Sequence

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Translation


          R  S  N  H  R  A  K  R  H  E  N  C  L  C  A  T  R  K  R  V  *  R  P  S  E  R  V  *  C  R  V  A  G  L   F1
           G  Q  I  I  V  Q  N  G  M  K  I  V  Y  V  P  Q  E  S  V  F  D  D  Q  A  S  V  F  D  V  V  S  Q  G     F2
            V  K  S  S  C  K  T  A  *  K  L  S  M  C  H  K  K  A  C  L  T  T  K  R  A  C  L  M  S  C  R  R  A    F3
        1 CGGTCAAATCATCGTGCAAAACGGCATGAAAATTGTCTATGTGCCACAAGAAAGCGTGTTTGACGACCAAGCGAGCGTGTTTGATGTCGTGTCGCAGGGC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  R  F  A  R  C  V  A  P  L  S  S  G  *  P  R  A  G  N  A  A  F  *  *  F  N  S  P  T  Q  R  V  T    F1
          L  G  D  L  R  D  V  L  R  R  Y  H  Q  V  S  H  A  L  E  T  Q  H  S  D  D  L  I  R  Q  L  N  E  L  Q   F2
           W  A  I  C  A  M  C  C  A  V  I  I  R  L  A  T  R  W  K  R  S  I  L  M  I  *  F  A  N  S  T  S  Y     F3
      101 TTGGGCGATTTGCGCGATGTGTTGCGCCGTTATCATCAGGTTAGCCACGCGCTGGAAACGCAGCATTCTGATGATTTAATTCGCCAACTCAACGAGTTAC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           K  *  N  *  I  A  R  R  L  A  V  *  R  G  N  P  P  N  D  *  R  I  G  A  A  *  K  *  I  D  W  Q  S     F1
            N  E  I  E  S  Q  D  G  W  Q  F  D  A  A  I  R  Q  T  I  S  E  L  G  L  P  E  N  E  L  I  G  N  L    F2
          K  M  K  L  N  R  K  T  A  G  S  L  T  R  Q  S  A  K  R  L  A  N  W  G  C  L  K  M  N  *  L  A  I  C   F3
      201 AAAATGAAATTGAATCGCAAGACGGCTGGCAGTTTGACGCGGCAATCCGCCAAACGATTAGCGAATTGGGGCTGCCTGAAAATGAATTGATTGGCAATCT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          V  G  W  S  E  K  T  G  C  V  G  S  S  V  G  A  K  T  R  Y  F  V  A  G  R  T  D  *  P  F  G  Y  *  R   F1
           S  G  G  Q  K  K  R  V  A  L  A  Q  A  W  V  Q  K  P  D  I  L  L  L  D  E  P  T  N  H  L  D  I  N     F2
            R  V  V  R  K  N  G  L  R  W  L  K  R  G  C  K  N  P  I  F  C  C  W  T  N  R  L  T  I  W  I  L  T    F3
      301 GTCGGGTGGTCAGAAAAAACGGGTTGCGTTGGCTCAAGCGTGGGTGCAAAAACCCGATATTTTGTTGCTGGACGAACCGACTAACCATTTGGATATTAAC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            D  Y  L  A  G  K  F  V  A  S  V  F  R  Q  H  G  G  D  Y  A  R  P  P  F  F  G  Q  H  R  Q  S  D  C    F1
          A  I  I  W  L  E  N  L  L  Q  A  F  S  G  S  M  V  V  I  T  H  D  R  R  F  L  D  N  I  A  N  R  I  V   F2
           R  L  F  G  W  K  I  C  C  K  R  F  Q  A  A  W  W  *  L  R  T  T  A  V  F  W  T  T  S  P  I  G  L     F3
      401 GCGATTATTTGGCTGGAAAATTTGTTGCAAGCGTTTTCAGGCAGCATGGTGGTGATTACGCACGACCGCCGTTTTTTGGACAACATCGCCAATCGGATTG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  I  G  *  G  R  V  A  F  V  R  G  Q  F  Q  Q  I  Q  R  E  K  G  A  G  I  G  G  *  G  A  T  Q  S     F1
            E  L  D  R  G  V  L  R  S  Y  E  G  S  F  S  K  Y  S  E  K  K  A  Q  E  L  A  V  E  A  Q  H  N  R    F2
          W  N  W  I  G  A  C  C  V  R  T  R  A  V  S  A  N  T  A  R  K  R  R  R  N  W  R  L  R  R  N  T  I  A   F3
      501 TGGAATTGGATAGGGGCGTGTTGCGTTCGTACGAGGGCAGTTTCAGCAAATACAGCGAGAAAAAGGCGCAGGAATTGGCGGTTGAGGCGCAACACAATCG 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  V  *  Q  I  S  R  A  G  R  S  V  D  S  Q  R  H  X                                                   F1
           L  F  D  K  F  H  A  Q  E  E  V  W  I  R  K  G  I  X                                                  F2
            C  L  T  N  F  T  R  R  K  K  C  G  F  A  K  A  L                                                    F3
      601 CCTGTTTGACAAATTTCACGCGCAGGAAGAAGTGTGGATTCGCAAAGGCATTG 653
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