abcZ (abcZ) allele sequence: id-218

Contig position

sequence bin id
10521
contig length
131350
start
71352
end
71804
length
453
orientation
reverse
complete
yes
Options

Sequence

CGGTCAAATC ATCGTGCAAA ACGGCATGAA AATTGTCTAT GTGCCACAAG AAAGCGTGTT TGACGACCAA GCGAGCGTGT TTGATGTCGT GTCGCAGGGC TTGGGCGATT TGCGCGATGT GTTGCGCCGT TATCATCAAG TTAGCCACGC GCTAGAAACG CAGCATTCTG ATGATTCAAT TCGCCAACTC AATGAGTTAC AAAATGAAAT TGAATCGCAA GACGGCTGGC AGTTTGACGC GGCAATCCGC CAAACGATTA GCGAATTGGG GCTGCCTGAA AATGAATTGA TTGGCAATCT GTCGGGCGGT CAGAAAAAAC GTGTGGCGTT GGCGCAAGCG TGGGTGCAAA AACCCGATAT TTTGTTGCTG GACGAACCAA CTAACCATTT GGATATTAAC GCGATTATTT GGCTGGAAAA TTTGTTGCAA GCGTTTTCAG GCAGCATGGT GGTGATTACG CACGACCGCC GTTTTTTGGA CAACATCGCC AATCGGATTG TGGAATTGGA TAGGGGCGTG TTGCGTTCGT ACGAAGGCAG TTTCAGCAAA TACAGCGAGA AAAAGGCGCA GGAATTGGCG GTTGAGGCGG AACACAATCG CCTGTTTGAC AAATTTCACG CGCAGGAAGA AGTGTGGATT CGCAAAGGCA TTG

Translation


          R  S  N  H  R  A  K  R  H  E  N  C  L  C  A  T  R  K  R  V  *  R  P  S  E  R  V  *  C  R  V  A  G  L   F1
           G  Q  I  I  V  Q  N  G  M  K  I  V  Y  V  P  Q  E  S  V  F  D  D  Q  A  S  V  F  D  V  V  S  Q  G     F2
            V  K  S  S  C  K  T  A  *  K  L  S  M  C  H  K  K  A  C  L  T  T  K  R  A  C  L  M  S  C  R  R  A    F3
        1 CGGTCAAATCATCGTGCAAAACGGCATGAAAATTGTCTATGTGCCACAAGAAAGCGTGTTTGACGACCAAGCGAGCGTGTTTGATGTCGTGTCGCAGGGC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  R  F  A  R  C  V  A  P  L  S  S  S  *  P  R  A  R  N  A  A  F  *  *  F  N  S  P  T  Q  *  V  T    F1
          L  G  D  L  R  D  V  L  R  R  Y  H  Q  V  S  H  A  L  E  T  Q  H  S  D  D  S  I  R  Q  L  N  E  L  Q   F2
           W  A  I  C  A  M  C  C  A  V  I  I  K  L  A  T  R  *  K  R  S  I  L  M  I  Q  F  A  N  S  M  S  Y     F3
      101 TTGGGCGATTTGCGCGATGTGTTGCGCCGTTATCATCAAGTTAGCCACGCGCTAGAAACGCAGCATTCTGATGATTCAATTCGCCAACTCAATGAGTTAC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           K  *  N  *  I  A  R  R  L  A  V  *  R  G  N  P  P  N  D  *  R  I  G  A  A  *  K  *  I  D  W  Q  S     F1
            N  E  I  E  S  Q  D  G  W  Q  F  D  A  A  I  R  Q  T  I  S  E  L  G  L  P  E  N  E  L  I  G  N  L    F2
          K  M  K  L  N  R  K  T  A  G  S  L  T  R  Q  S  A  K  R  L  A  N  W  G  C  L  K  M  N  *  L  A  I  C   F3
      201 AAAATGAAATTGAATCGCAAGACGGCTGGCAGTTTGACGCGGCAATCCGCCAAACGATTAGCGAATTGGGGCTGCCTGAAAATGAATTGATTGGCAATCT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          V  G  R  S  E  K  T  C  G  V  G  A  S  V  G  A  K  T  R  Y  F  V  A  G  R  T  N  *  P  F  G  Y  *  R   F1
           S  G  G  Q  K  K  R  V  A  L  A  Q  A  W  V  Q  K  P  D  I  L  L  L  D  E  P  T  N  H  L  D  I  N     F2
            R  A  V  R  K  N  V  W  R  W  R  K  R  G  C  K  N  P  I  F  C  C  W  T  N  Q  L  T  I  W  I  L  T    F3
      301 GTCGGGCGGTCAGAAAAAACGTGTGGCGTTGGCGCAAGCGTGGGTGCAAAAACCCGATATTTTGTTGCTGGACGAACCAACTAACCATTTGGATATTAAC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            D  Y  L  A  G  K  F  V  A  S  V  F  R  Q  H  G  G  D  Y  A  R  P  P  F  F  G  Q  H  R  Q  S  D  C    F1
          A  I  I  W  L  E  N  L  L  Q  A  F  S  G  S  M  V  V  I  T  H  D  R  R  F  L  D  N  I  A  N  R  I  V   F2
           R  L  F  G  W  K  I  C  C  K  R  F  Q  A  A  W  W  *  L  R  T  T  A  V  F  W  T  T  S  P  I  G  L     F3
      401 GCGATTATTTGGCTGGAAAATTTGTTGCAAGCGTTTTCAGGCAGCATGGTGGTGATTACGCACGACCGCCGTTTTTTGGACAACATCGCCAATCGGATTG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  I  G  *  G  R  V  A  F  V  R  R  Q  F  Q  Q  I  Q  R  E  K  G  A  G  I  G  G  *  G  G  T  Q  S     F1
            E  L  D  R  G  V  L  R  S  Y  E  G  S  F  S  K  Y  S  E  K  K  A  Q  E  L  A  V  E  A  E  H  N  R    F2
          W  N  W  I  G  A  C  C  V  R  T  K  A  V  S  A  N  T  A  R  K  R  R  R  N  W  R  L  R  R  N  T  I  A   F3
      501 TGGAATTGGATAGGGGCGTGTTGCGTTCGTACGAAGGCAGTTTCAGCAAATACAGCGAGAAAAAGGCGCAGGAATTGGCGGTTGAGGCGGAACACAATCG 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  V  *  Q  I  S  R  A  G  R  S  V  D  S  Q  R  H  X                                                   F1
           L  F  D  K  F  H  A  Q  E  E  V  W  I  R  K  G  I  X                                                  F2
            C  L  T  N  F  T  R  R  K  K  C  G  F  A  K  A  L                                                    F3
      601 CCTGTTTGACAAATTTCACGCGCAGGAAGAAGTGTGGATTCGCAAAGGCATTG 653
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