recA (recA) allele sequence: id-217
Contig position
- sequence bin id
- 10312
- contig length
- 56338
- start
- 44601
- end
- 44954
- length
- 354
- orientation
- forward
- complete
- yes
Sequence
GGCACAAATT GAGAAAAACT ACGGCAAAGG CGCAGTCATG AAAATGGACG GTAGCCACCA AGACGAAGAA TTGCAAGTCA TTTCCACAGG TTCGCTCACA TTGGACATTG CCTTGGGTGT GGGCGGTTTA CCACGCGGTC GTATTGTGGA AATTTACGGC GCAGAATCAT CGGGCAAAAC CACTTTATGT TTGGAATCGA TTGCACAATG CCAAAAAGCA GGCGGAACGT GTGCGTTTAT TGACGCAGAA CACGCATTTG ACCCTATTTA CGCGCGTAAA TTGGGCGTAG AAGTCGAAAA ATTGTTGGTA TCGCAACCCG ACACAGGCGA ACAAGCATTG GAAATTTGCG ATATGTTGGT GCGCTCGGGT GGTGTGGATA TGGTCGTGAT TGATTCGGTT GCCGCGCTTG TTCCCAAAGC GGAAATTGAA GGCGACATGG GTGATAGCCA CGTTGGTTTG CACGCTCGTT TGATGAGCCA AGCCTTGCGT AAACTGGCAG GACACATCAA AAAAACCAAC ACGCTGGCGG TGTTCATCAA CCAAACGCGC ATGA
Translation
G T N * E K L R Q R R S H E N G R * P P R R R I A S H F H R F A H I F1
A Q I E K N Y G K G A V M K M D G S H Q D E E L Q V I S T G S L T F2
H K L R K T T A K A Q S * K W T V A T K T K N C K S F P Q V R S H F3
1 GGCACAAATTGAGAAAAACTACGGCAAAGGCGCAGTCATGAAAATGGACGGTAGCCACCAAGACGAAGAATTGCAAGTCATTTCCACAGGTTCGCTCACA 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G H C L G C G R F T T R S Y C G N L R R R I I G Q N H F M F G I D F1
L D I A L G V G G L P R G R I V E I Y G A E S S G K T T L C L E S I F2
W T L P W V W A V Y H A V V L W K F T A Q N H R A K P L Y V W N R F3
101 TTGGACATTGCCTTGGGTGTGGGCGGTTTACCACGCGGTCGTATTGTGGAAATTTACGGCGCAGAATCATCGGGCAAAACCACTTTATGTTTGGAATCGA 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
C T M P K S R R N V C V Y * R R T R I * P Y L R A * I G R R S R K F1
A Q C Q K A G G T C A F I D A E H A F D P I Y A R K L G V E V E K F2
L H N A K K Q A E R V R L L T Q N T H L T L F T R V N W A * K S K N F3
201 TTGCACAATGCCAAAAAGCAGGCGGAACGTGTGCGTTTATTGACGCAGAACACGCATTTGACCCTATTTACGCGCGTAAATTGGGCGTAGAAGTCGAAAA 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
I V G I A T R H R R T S I G N L R Y V G A L G W C G Y G R D * F G C F1
L L V S Q P D T G E Q A L E I C D M L V R S G G V D M V V I D S V F2
C W Y R N P T Q A N K H W K F A I C W C A R V V W I W S * L I R L F3
301 ATTGTTGGTATCGCAACCCGACACAGGCGAACAAGCATTGGAAATTTGCGATATGTTGGTGCGCTCGGGTGGTGTGGATATGGTCGTGATTGATTCGGTT 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R A C S Q S G N * R R H G * * P R W F A R S F D E P S L A * T G R F1
A A L V P K A E I E G D M G D S H V G L H A R L M S Q A L R K L A G F2
P R L F P K R K L K A T W V I A T L V C T L V * * A K P C V N W Q F3
401 GCCGCGCTTGTTCCCAAAGCGGAAATTGAAGGCGACATGGGTGATAGCCACGTTGGTTTGCACGCTCGTTTGATGAGCCAAGCCTTGCGTAAACTGGCAG 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
T H Q K N Q H A G G V H Q P N A H X F1
H I K K T N T L A V F I N Q T R M X F2
D T S K K P T R W R C S S T K R A * F3
501 GACACATCAAAAAAACCAACACGCTGGCGGTGTTCATCAACCAAACGCGCATGA 554
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----