gdh (gdh) allele sequence: id-215

Contig position

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10061
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58628
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orientation
forward
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yes
Options

Sequence

ATCGGTGCAA ATCACGGTGG CAGAACAACT GGGTGTGGAA GAGCGCGGCG AGTTTTATGA CATCACAGGT GCATTGCGCG ACATGATGCA AAACCACATC ATGCAAATGC TGTGTTTTGT GGCAATGGAA CAACCCAAAT CGTTGAGTGC AGACGATGTA CGCGATGAAA AATTGAAAGT GGTGGCGGCA CTCAAACCGA TGACTTCGGC AGATGTAGAT AAAAACGTGG TTCGCGCACA ATATGTGGCA AACGGCGAGC AAAACGGCTA TTTGCAAGAA CACAATGTGC CAGCCGACAG CCGCACCGAA ACCTATGTTG CCATTCGCGC CGAAATTGAT ACGCCACGTT GGGCAGGCGT GCCGTTTTAT TTGCGTACAG GCAAACGCTT GGCAACGCGC ACAGCAGAAA TTGTTTTGAA TTTCAAAGAC CAAGCCAATG GTTTGTTTGG CACAAATCCT AATCGTTTGG TGATTTCGTT GCAGCCTGAT GAAACCGTAT CGCTCAAATT GTATGTGAAA CAAGTGGGCA GCGGCTTGGA CGTGCAGCCA ACCGAAATGG TGTTGGACAT GGGCACAGTG TCAGACGAAC GCCGCGCCGA AGCGTATGAA TTGCTGTTGC GCGAAGTGAT TGACGGACGT TTGAGCTTGT TCAATCGCCG CGACGAGCTG GAAAAAGCGT GGGAATGGGT CATGCCAATT TTGGACAACT GGGCAACTTC GCCTGTTGCA CCAGCCACTT ACGCTGCATC TAGCTGGGGG CCAAAAGAAG CGCAAG

Translation


          I  G  A  N  H  G  G  R  T  T  G  C  G  R  A  R  R  V  L  *  H  H  R  C  I  A  R  H  D  A  K  P  H  H   F1
           S  V  Q  I  T  V  A  E  Q  L  G  V  E  E  R  G  E  F  Y  D  I  T  G  A  L  R  D  M  M  Q  N  H  I     F2
            R  C  K  S  R  W  Q  N  N  W  V  W  K  S  A  A  S  F  M  T  S  Q  V  H  C  A  T  *  C  K  T  T  S    F3
        1 ATCGGTGCAAATCACGGTGGCAGAACAACTGGGTGTGGAAGAGCGCGGCGAGTTTTATGACATCACAGGTGCATTGCGCGACATGATGCAAAACCACATC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            A  N  A  V  F  C  G  N  G  T  T  Q  I  V  E  C  R  R  C  T  R  *  K  I  E  S  G  G  G  T  Q  T  D    F1
          M  Q  M  L  C  F  V  A  M  E  Q  P  K  S  L  S  A  D  D  V  R  D  E  K  L  K  V  V  A  A  L  K  P  M   F2
           C  K  C  C  V  L  W  Q  W  N  N  P  N  R  *  V  Q  T  M  Y  A  M  K  N  *  K  W  W  R  H  S  N  R     F3
      101 ATGCAAATGCTGTGTTTTGTGGCAATGGAACAACCCAAATCGTTGAGTGCAGACGATGTACGCGATGAAAAATTGAAAGTGGTGGCGGCACTCAAACCGA 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           D  F  G  R  C  R  *  K  R  G  S  R  T  I  C  G  K  R  R  A  K  R  L  F  A  R  T  Q  C  A  S  R  Q     F1
            T  S  A  D  V  D  K  N  V  V  R  A  Q  Y  V  A  N  G  E  Q  N  G  Y  L  Q  E  H  N  V  P  A  D  S    F2
          *  L  R  Q  M  *  I  K  T  W  F  A  H  N  M  W  Q  T  A  S  K  T  A  I  C  K  N  T  M  C  Q  P  T  A   F3
      201 TGACTTCGGCAGATGTAGATAAAAACGTGGTTCGCGCACAATATGTGGCAAACGGCGAGCAAAACGGCTATTTGCAAGAACACAATGTGCCAGCCGACAG 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  H  R  N  L  C  C  H  S  R  R  N  *  Y  A  T  L  G  R  R  A  V  L  F  A  Y  R  Q  T  L  G  N  A  H   F1
           R  T  E  T  Y  V  A  I  R  A  E  I  D  T  P  R  W  A  G  V  P  F  Y  L  R  T  G  K  R  L  A  T  R     F2
            A  P  K  P  M  L  P  F  A  P  K  L  I  R  H  V  G  Q  A  C  R  F  I  C  V  Q  A  N  A  W  Q  R  A    F3
      301 CCGCACCGAAACCTATGTTGCCATTCGCGCCGAAATTGATACGCCACGTTGGGCAGGCGTGCCGTTTTATTTGCGTACAGGCAAACGCTTGGCAACGCGC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            S  R  N  C  F  E  F  Q  R  P  S  Q  W  F  V  W  H  K  S  *  S  F  G  D  F  V  A  A  *  *  N  R  I    F1
          T  A  E  I  V  L  N  F  K  D  Q  A  N  G  L  F  G  T  N  P  N  R  L  V  I  S  L  Q  P  D  E  T  V  S   F2
           Q  Q  K  L  F  *  I  S  K  T  K  P  M  V  C  L  A  Q  I  L  I  V  W  *  F  R  C  S  L  M  K  P  Y     F3
      401 ACAGCAGAAATTGTTTTGAATTTCAAAGACCAAGCCAATGGTTTGTTTGGCACAAATCCTAATCGTTTGGTGATTTCGTTGCAGCCTGATGAAACCGTAT 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           A  Q  I  V  C  E  T  S  G  Q  R  L  G  R  A  A  N  R  N  G  V  G  H  G  H  S  V  R  R  T  P  R  R     F1
            L  K  L  Y  V  K  Q  V  G  S  G  L  D  V  Q  P  T  E  M  V  L  D  M  G  T  V  S  D  E  R  R  A  E    F2
          R  S  N  C  M  *  N  K  W  A  A  A  W  T  C  S  Q  P  K  W  C  W  T  W  A  Q  C  Q  T  N  A  A  P  K   F3
      501 CGCTCAAATTGTATGTGAAACAAGTGGGCAGCGGCTTGGACGTGCAGCCAACCGAAATGGTGTTGGACATGGGCACAGTGTCAGACGAACGCCGCGCCGA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          S  V  *  I  A  V  A  R  S  D  *  R  T  F  E  L  V  Q  S  P  R  R  A  G  K  S  V  G  M  G  H  A  N  F   F1
           A  Y  E  L  L  L  R  E  V  I  D  G  R  L  S  L  F  N  R  R  D  E  L  E  K  A  W  E  W  V  M  P  I     F2
            R  M  N  C  C  C  A  K  *  L  T  D  V  *  A  C  S  I  A  A  T  S  W  K  K  R  G  N  G  S  C  Q  F    F3
      601 AGCGTATGAATTGCTGTTGCGCGAAGTGATTGACGGACGTTTGAGCTTGTTCAATCGCCGCGACGAGCTGGAAAAAGCGTGGGAATGGGTCATGCCAATT 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  Q  L  G  N  F  A  C  C  T  S  H  L  R  C  I  *  L  G  A  K  R  S  A  X                            F1
          L  D  N  W  A  T  S  P  V  A  P  A  T  Y  A  A  S  S  W  G  P  K  E  A  Q  X                           F2
           W  T  T  G  Q  L  R  L  L  H  Q  P  L  T  L  H  L  A  G  G  Q  K  K  R  K                             F3
      701 TTGGACAACTGGGCAACTTCGCCTGTTGCACCAGCCACTTACGCTGCATCTAGCTGGGGGCCAAAAGAAGCGCAAG 776
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