abcZ (abcZ) allele sequence: id-214

Contig position

sequence bin id
9976
contig length
127012
start
67726
end
68178
length
453
orientation
reverse
complete
yes
Options

Sequence

TGGGCAAATT ATCGTGCAAA ACGGCTTAAA AATCGTGTAT GTGCCGCAAG AGAGCGTGTT TGACGACCAA GCGAGCGTGT TTGATGTCGT GTCGCAAGGT TTGGGCGATT TGCGCGATGT GTTGCGCCGT TATCATCAGG TTAGCCACGC GCTAGAAACG CAGCATTCTG ATGATTTAAT TCGCCAACTC AATGAGTTAC AAAATGAAAT TGAATCGCAA GACGGCTGGC AGTTTGACGC GGCAATCCGC CAAACGATTA GCGAATTGGG GCTGCCTGAA AATGAATTGA TTGGCAACTT GTCGGGTGGT CAGAAAAAAC GGGTTGCGTT GGCTCAAGCG TGGGTGCAAA AACCCGATAT TTTGTTGCTG GACGAACCGA CTAACCATTT GGATATTAAC GCGATTATTT GGCTGGAAAA TTTGTTGCAA GCGTTTTCAG GCAGCATGGT GGTGATTACG CACGACCGCC GTTTTTTGGA CAACATCGCC AATCGGATTG TGGAATTGGA TAGGGGCGTG TTGCGTTCGT ACGAGGGCAG TTTCAGCAAA TACAGCGAGA AAAAGGCGCA GGAATTGGCG GTTGAGGCGG AACACAATCG CCTGTTTGAC AAATTTCACA CGCAGGAAGA AGTGTGGATT CGCAAAGGCA TTG

Translation


          W  A  N  Y  R  A  K  R  L  K  N  R  V  C  A  A  R  E  R  V  *  R  P  S  E  R  V  *  C  R  V  A  R  F   F1
           G  Q  I  I  V  Q  N  G  L  K  I  V  Y  V  P  Q  E  S  V  F  D  D  Q  A  S  V  F  D  V  V  S  Q  G     F2
            G  K  L  S  C  K  T  A  *  K  S  C  M  C  R  K  R  A  C  L  T  T  K  R  A  C  L  M  S  C  R  K  V    F3
        1 TGGGCAAATTATCGTGCAAAACGGCTTAAAAATCGTGTATGTGCCGCAAGAGAGCGTGTTTGACGACCAAGCGAGCGTGTTTGATGTCGTGTCGCAAGGT 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  R  F  A  R  C  V  A  P  L  S  S  G  *  P  R  A  R  N  A  A  F  *  *  F  N  S  P  T  Q  *  V  T    F1
          L  G  D  L  R  D  V  L  R  R  Y  H  Q  V  S  H  A  L  E  T  Q  H  S  D  D  L  I  R  Q  L  N  E  L  Q   F2
           W  A  I  C  A  M  C  C  A  V  I  I  R  L  A  T  R  *  K  R  S  I  L  M  I  *  F  A  N  S  M  S  Y     F3
      101 TTGGGCGATTTGCGCGATGTGTTGCGCCGTTATCATCAGGTTAGCCACGCGCTAGAAACGCAGCATTCTGATGATTTAATTCGCCAACTCAATGAGTTAC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           K  *  N  *  I  A  R  R  L  A  V  *  R  G  N  P  P  N  D  *  R  I  G  A  A  *  K  *  I  D  W  Q  L     F1
            N  E  I  E  S  Q  D  G  W  Q  F  D  A  A  I  R  Q  T  I  S  E  L  G  L  P  E  N  E  L  I  G  N  L    F2
          K  M  K  L  N  R  K  T  A  G  S  L  T  R  Q  S  A  K  R  L  A  N  W  G  C  L  K  M  N  *  L  A  T  C   F3
      201 AAAATGAAATTGAATCGCAAGACGGCTGGCAGTTTGACGCGGCAATCCGCCAAACGATTAGCGAATTGGGGCTGCCTGAAAATGAATTGATTGGCAACTT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          V  G  W  S  E  K  T  G  C  V  G  S  S  V  G  A  K  T  R  Y  F  V  A  G  R  T  D  *  P  F  G  Y  *  R   F1
           S  G  G  Q  K  K  R  V  A  L  A  Q  A  W  V  Q  K  P  D  I  L  L  L  D  E  P  T  N  H  L  D  I  N     F2
            R  V  V  R  K  N  G  L  R  W  L  K  R  G  C  K  N  P  I  F  C  C  W  T  N  R  L  T  I  W  I  L  T    F3
      301 GTCGGGTGGTCAGAAAAAACGGGTTGCGTTGGCTCAAGCGTGGGTGCAAAAACCCGATATTTTGTTGCTGGACGAACCGACTAACCATTTGGATATTAAC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            D  Y  L  A  G  K  F  V  A  S  V  F  R  Q  H  G  G  D  Y  A  R  P  P  F  F  G  Q  H  R  Q  S  D  C    F1
          A  I  I  W  L  E  N  L  L  Q  A  F  S  G  S  M  V  V  I  T  H  D  R  R  F  L  D  N  I  A  N  R  I  V   F2
           R  L  F  G  W  K  I  C  C  K  R  F  Q  A  A  W  W  *  L  R  T  T  A  V  F  W  T  T  S  P  I  G  L     F3
      401 GCGATTATTTGGCTGGAAAATTTGTTGCAAGCGTTTTCAGGCAGCATGGTGGTGATTACGCACGACCGCCGTTTTTTGGACAACATCGCCAATCGGATTG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  I  G  *  G  R  V  A  F  V  R  G  Q  F  Q  Q  I  Q  R  E  K  G  A  G  I  G  G  *  G  G  T  Q  S     F1
            E  L  D  R  G  V  L  R  S  Y  E  G  S  F  S  K  Y  S  E  K  K  A  Q  E  L  A  V  E  A  E  H  N  R    F2
          W  N  W  I  G  A  C  C  V  R  T  R  A  V  S  A  N  T  A  R  K  R  R  R  N  W  R  L  R  R  N  T  I  A   F3
      501 TGGAATTGGATAGGGGCGTGTTGCGTTCGTACGAGGGCAGTTTCAGCAAATACAGCGAGAAAAAGGCGCAGGAATTGGCGGTTGAGGCGGAACACAATCG 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  V  *  Q  I  S  H  A  G  R  S  V  D  S  Q  R  H  X                                                   F1
           L  F  D  K  F  H  T  Q  E  E  V  W  I  R  K  G  I  X                                                  F2
            C  L  T  N  F  T  R  R  K  K  C  G  F  A  K  A  L                                                    F3
      601 CCTGTTTGACAAATTTCACACGCAGGAAGAAGTGTGGATTCGCAAAGGCATTG 653
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