cpn60 (cpn60) allele sequence: id-212
Contig position
- sequence bin id
- 9657
- contig length
- 45203
- start
- 41002
- end
- 41304
- length
- 303
- orientation
- reverse
- complete
- yes
Sequence
GGTTAAAGAA GTTGCTTCTA AAACCAATGA TGTGGCTGGC GACGGCACAA CCACCGCAAC CGTGTTGGCG CAAGCGATTG TTGCTGAAGG CATGAAATAC GTTACCGCAG GCATGAACCC TACCGATTTG AAACGCGGTA TTGACAAAGC AGTGGCGGCT TTGGTTGGCG AATTGGCAAA CATCGCGAAA CCTTGCGAAA CATACGAGCA AATCGCTCAA GTGGGCGCGA TTTCTGCGAA CTCTGACGAG CAAGTTGGCA AAATCATTGC AGACGCGATG CAAGAAGTCG GCAAAGAGGG CGTGATTACC GTTGAAGACG GCAAATCGTT GGAAAACGAG TTGGAAGTGG TTAAAGGTAT GCAATTTGAC CGCGGCTACT TGTCGCCTTA TTTTGTGAAT GATTTGGAAA AACAAATCGC TGGTTTGGAC AGCCCATTTG TGTTGCTGTT TGACAAAAAA ATCAGCAATA TCCGTGATTT GTTGCCCGTT TTGGAACAAG TGG
Translation
G * R S C F * N Q * C G W R R H N H R N R V G A S D C C * R H E I R F1
V K E V A S K T N D V A G D G T T T A T V L A Q A I V A E G M K Y F2
L K K L L L K P M M W L A T A Q P P Q P C W R K R L L L K A * N T F3
1 GGTTAAAGAAGTTGCTTCTAAAACCAATGATGTGGCTGGCGACGGCACAACCACCGCAACCGTGTTGGCGCAAGCGATTGTTGCTGAAGGCATGAAATAC 100
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Y R R H E P Y R F E T R Y * Q S S G G F G W R I G K H R E T L R N F1
V T A G M N P T D L K R G I D K A V A A L V G E L A N I A K P C E T F2
L P Q A * T L P I * N A V L T K Q W R L W L A N W Q T S R N L A K F3
101 GTTACCGCAGGCATGAACCCTACCGATTTGAAACGCGGTATTGACAAAGCAGTGGCGGCTTTGGTTGGCGAATTGGCAAACATCGCGAAACCTTGCGAAA 200
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I R A N R S S G R D F C E L * R A S W Q N H C R R D A R S R Q R G F1
Y E Q I A Q V G A I S A N S D E Q V G K I I A D A M Q E V G K E G F2
H T S K S L K W A R F L R T L T S K L A K S L Q T R C K K S A K R A F3
201 CATACGAGCAAATCGCTCAAGTGGGCGCGATTTCTGCGAACTCTGACGAGCAAGTTGGCAAAATCATTGCAGACGCGATGCAAGAAGTCGGCAAAGAGGG 300
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R D Y R * R R Q I V G K R V G S G * R Y A I * P R L L V A L F C E * F1
V I T V E D G K S L E N E L E V V K G M Q F D R G Y L S P Y F V N F2
* L P L K T A N R W K T S W K W L K V C N L T A A T C R L I L * M F3
301 CGTGATTACCGTTGAAGACGGCAAATCGTTGGAAAACGAGTTGGAAGTGGTTAAAGGTATGCAATTTGACCGCGGCTACTTGTCGCCTTATTTTGTGAAT 400
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F G K T N R W F G Q P I C V A V * Q K N Q Q Y P * F V A R F G T S F1
D L E K Q I A G L D S P F V L L F D K K I S N I R D L L P V L E Q V F2
I W K N K S L V W T A H L C C C L T K K S A I S V I C C P F W N K F3
401 GATTTGGAAAAACAAATCGCTGGTTTGGACAGCCCATTTGTGTTGCTGTTTGACAAAAAAATCAGCAATATCCGTGATTTGTTGCCCGTTTTGGAACAAG 500
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G F1
X F2
W F3
501 TGG 503
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