abcZ (abcZ) allele sequence: id-212

Contig position

sequence bin id
9726
contig length
132159
start
5890
end
6342
length
453
orientation
reverse
complete
yes
Options

Sequence

CGGTCAAATC ATCGTGCAAA ACGGCATGAA AATTGTCTAT GTGCCGCAAG AAAGCGTGTT TGACGACCAA GCGAGCGTGT TTGATGTCGT GTCGCAGGGT TTGGGTGATT TGCGCGATGT GTTGCGCCGT TATCATCAGG TTAGCCACGC ACTTGAAACG CAACATTCTG ATTATTTAAT TCGCCAACTC AACGAGTTAC AAAATGAAAT TGAATCGCAA GACGGCTGGC AGTTTGACGC GGCAATCCGC CAAACGATTA GCGAATTGGG GCTGCCTGAA AATGAATTGA TTGGCAACTT GTCGGGTGGT CAGAAAAAAC GGGTTGCGTT GGCGCAAGCG TGGGTGCAAA AACCCGATAT TTTGCTATTG GACGAACCGA CTAACCACTT GGATATTAAC GCGATTATTT GGCTGGAAAA TTTGTTGCAA GCGTTTTCAG GCAGCATGGT GGTGATTACG CACGACCGCC GTTTTTTGGA CAACATCGCC AATCGGATTG TGGAATTGGA CAGGGGCGTG TTGCGTTTGT ACGAAGGCAG TTTCAGTAAA TACAGCGAAA AAAAGGCGCA GGAATTGGCG GTTGAGGCGG AACACAATCG CCTGTTTGAC AAATTTCACG CACAGGAAGA AGTGTGGATT CGCAAAGGCA TTG

Translation


          R  S  N  H  R  A  K  R  H  E  N  C  L  C  A  A  R  K  R  V  *  R  P  S  E  R  V  *  C  R  V  A  G  F   F1
           G  Q  I  I  V  Q  N  G  M  K  I  V  Y  V  P  Q  E  S  V  F  D  D  Q  A  S  V  F  D  V  V  S  Q  G     F2
            V  K  S  S  C  K  T  A  *  K  L  S  M  C  R  K  K  A  C  L  T  T  K  R  A  C  L  M  S  C  R  R  V    F3
        1 CGGTCAAATCATCGTGCAAAACGGCATGAAAATTGTCTATGTGCCGCAAGAAAGCGTGTTTGACGACCAAGCGAGCGTGTTTGATGTCGTGTCGCAGGGT 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  *  F  A  R  C  V  A  P  L  S  S  G  *  P  R  T  *  N  A  T  F  *  L  F  N  S  P  T  Q  R  V  T    F1
          L  G  D  L  R  D  V  L  R  R  Y  H  Q  V  S  H  A  L  E  T  Q  H  S  D  Y  L  I  R  Q  L  N  E  L  Q   F2
           W  V  I  C  A  M  C  C  A  V  I  I  R  L  A  T  H  L  K  R  N  I  L  I  I  *  F  A  N  S  T  S  Y     F3
      101 TTGGGTGATTTGCGCGATGTGTTGCGCCGTTATCATCAGGTTAGCCACGCACTTGAAACGCAACATTCTGATTATTTAATTCGCCAACTCAACGAGTTAC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           K  *  N  *  I  A  R  R  L  A  V  *  R  G  N  P  P  N  D  *  R  I  G  A  A  *  K  *  I  D  W  Q  L     F1
            N  E  I  E  S  Q  D  G  W  Q  F  D  A  A  I  R  Q  T  I  S  E  L  G  L  P  E  N  E  L  I  G  N  L    F2
          K  M  K  L  N  R  K  T  A  G  S  L  T  R  Q  S  A  K  R  L  A  N  W  G  C  L  K  M  N  *  L  A  T  C   F3
      201 AAAATGAAATTGAATCGCAAGACGGCTGGCAGTTTGACGCGGCAATCCGCCAAACGATTAGCGAATTGGGGCTGCCTGAAAATGAATTGATTGGCAACTT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          V  G  W  S  E  K  T  G  C  V  G  A  S  V  G  A  K  T  R  Y  F  A  I  G  R  T  D  *  P  L  G  Y  *  R   F1
           S  G  G  Q  K  K  R  V  A  L  A  Q  A  W  V  Q  K  P  D  I  L  L  L  D  E  P  T  N  H  L  D  I  N     F2
            R  V  V  R  K  N  G  L  R  W  R  K  R  G  C  K  N  P  I  F  C  Y  W  T  N  R  L  T  T  W  I  L  T    F3
      301 GTCGGGTGGTCAGAAAAAACGGGTTGCGTTGGCGCAAGCGTGGGTGCAAAAACCCGATATTTTGCTATTGGACGAACCGACTAACCACTTGGATATTAAC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            D  Y  L  A  G  K  F  V  A  S  V  F  R  Q  H  G  G  D  Y  A  R  P  P  F  F  G  Q  H  R  Q  S  D  C    F1
          A  I  I  W  L  E  N  L  L  Q  A  F  S  G  S  M  V  V  I  T  H  D  R  R  F  L  D  N  I  A  N  R  I  V   F2
           R  L  F  G  W  K  I  C  C  K  R  F  Q  A  A  W  W  *  L  R  T  T  A  V  F  W  T  T  S  P  I  G  L     F3
      401 GCGATTATTTGGCTGGAAAATTTGTTGCAAGCGTTTTCAGGCAGCATGGTGGTGATTACGCACGACCGCCGTTTTTTGGACAACATCGCCAATCGGATTG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  I  G  Q  G  R  V  A  F  V  R  R  Q  F  Q  *  I  Q  R  K  K  G  A  G  I  G  G  *  G  G  T  Q  S     F1
            E  L  D  R  G  V  L  R  L  Y  E  G  S  F  S  K  Y  S  E  K  K  A  Q  E  L  A  V  E  A  E  H  N  R    F2
          W  N  W  T  G  A  C  C  V  C  T  K  A  V  S  V  N  T  A  K  K  R  R  R  N  W  R  L  R  R  N  T  I  A   F3
      501 TGGAATTGGACAGGGGCGTGTTGCGTTTGTACGAAGGCAGTTTCAGTAAATACAGCGAAAAAAAGGCGCAGGAATTGGCGGTTGAGGCGGAACACAATCG 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  V  *  Q  I  S  R  T  G  R  S  V  D  S  Q  R  H  X                                                   F1
           L  F  D  K  F  H  A  Q  E  E  V  W  I  R  K  G  I  X                                                  F2
            C  L  T  N  F  T  H  R  K  K  C  G  F  A  K  A  L                                                    F3
      601 CCTGTTTGACAAATTTCACGCACAGGAAGAAGTGTGGATTCGCAAAGGCATTG 653
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