recA (recA) allele sequence: id-190
Contig position
- sequence bin id
- 16715
- contig length
- 22148
- start
- 16034
- end
- 16387
- length
- 354
- orientation
- reverse
- complete
- yes
Sequence
GGCACAAATT GAGAAAAACT ACGGCAAAGG CGCAGTCATG AAAATGGACG GCAGCCACCA AGACGAAGAA TTGCAAGTCA TTTCCACGGG TTCGCTCACA TTGGACATTG CCTTGGGTGT GGGCGGTTTA CCACGCGGTC GTATTGTGGA AATTTACGGC GCAGAATCAT CGGGCAAAAC CACTTTATGT TTGGAATCGA TTGCACAATG CCAAAAAGCA GGCGGAACGT GTGCGTTTAT TGACGCAGAA CACGCATTTG ACCCTATTTA CGCGCGTAAA TTGGGCGTAG AAGTCGAAAA ATTGTTGGTA TCGCAACCCG ACACAGGCGA ACAAGCATTG GAAATTTGCG ATATGTTGGT GCGCTCAGGT GGTGTGGATA TGGTCGTGAT TGATTCGGTT GCCGCGCTTG TTCCCAAAGC GGAAATTGAA GGCGACATGG GTGATAGCCA CGTTGGTTTG CACGCTCGTT TGATGAGCCA AGCCTTGCGT AAACTGGCAG GACACATCAA AAAAACCAAC ACGCTGGCGG TGTTCATCAA CCAAACGCGC ATGA
Translation
G T N * E K L R Q R R S H E N G R Q P P R R R I A S H F H G F A H I F1
A Q I E K N Y G K G A V M K M D G S H Q D E E L Q V I S T G S L T F2
H K L R K T T A K A Q S * K W T A A T K T K N C K S F P R V R S H F3
1 GGCACAAATTGAGAAAAACTACGGCAAAGGCGCAGTCATGAAAATGGACGGCAGCCACCAAGACGAAGAATTGCAAGTCATTTCCACGGGTTCGCTCACA 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G H C L G C G R F T T R S Y C G N L R R R I I G Q N H F M F G I D F1
L D I A L G V G G L P R G R I V E I Y G A E S S G K T T L C L E S I F2
W T L P W V W A V Y H A V V L W K F T A Q N H R A K P L Y V W N R F3
101 TTGGACATTGCCTTGGGTGTGGGCGGTTTACCACGCGGTCGTATTGTGGAAATTTACGGCGCAGAATCATCGGGCAAAACCACTTTATGTTTGGAATCGA 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
C T M P K S R R N V C V Y * R R T R I * P Y L R A * I G R R S R K F1
A Q C Q K A G G T C A F I D A E H A F D P I Y A R K L G V E V E K F2
L H N A K K Q A E R V R L L T Q N T H L T L F T R V N W A * K S K N F3
201 TTGCACAATGCCAAAAAGCAGGCGGAACGTGTGCGTTTATTGACGCAGAACACGCATTTGACCCTATTTACGCGCGTAAATTGGGCGTAGAAGTCGAAAA 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
I V G I A T R H R R T S I G N L R Y V G A L R W C G Y G R D * F G C F1
L L V S Q P D T G E Q A L E I C D M L V R S G G V D M V V I D S V F2
C W Y R N P T Q A N K H W K F A I C W C A Q V V W I W S * L I R L F3
301 ATTGTTGGTATCGCAACCCGACACAGGCGAACAAGCATTGGAAATTTGCGATATGTTGGTGCGCTCAGGTGGTGTGGATATGGTCGTGATTGATTCGGTT 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R A C S Q S G N * R R H G * * P R W F A R S F D E P S L A * T G R F1
A A L V P K A E I E G D M G D S H V G L H A R L M S Q A L R K L A G F2
P R L F P K R K L K A T W V I A T L V C T L V * * A K P C V N W Q F3
401 GCCGCGCTTGTTCCCAAAGCGGAAATTGAAGGCGACATGGGTGATAGCCACGTTGGTTTGCACGCTCGTTTGATGAGCCAAGCCTTGCGTAAACTGGCAG 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
T H Q K N Q H A G G V H Q P N A H X F1
H I K K T N T L A V F I N Q T R M X F2
D T S K K P T R W R C S S T K R A * F3
501 GACACATCAAAAAAACCAACACGCTGGCGGTGTTCATCAACCAAACGCGCATGA 554
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----