gdh (gdh) allele sequence: id-158

Contig position

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2840
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3134
end
3709
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576
orientation
forward
complete
yes
Options

Sequence

ATCGGTGCAA ATCACGGTGG CAGAACAACT GGGCGTGGAA GAGCGCGGCG AGTTTTATGA CATCACAGGC GCACTGCGCG ACATGATGCA AAACCACATC ATGCAAATGC TGTGTTTTGT GGCAATGGAA CAACCCAAAT CGTTGAGCGC AGACGATGTA CGCGATGAAA AATTGAAAGT GGTGGCTGCA CTCAAACCGA TGACTTTGGC AGATGTGGAT AAAAACGTGA TTCGCGCACA ATATGTGGCA AACGGCGAGC AAAACGGCTA TTTGCAAGAA CACAATGTGC CAGCCGACAG CCGTACCGAA ACCTATGTTG CCATTCGCGC CGAAATTGAT ACGCCACGTT GGGCAGGCGT GCCGTTTTAT TTGCGTACAG GCAAACGCTT GGCAACGCGC ACAGCAGAAA TTGTTTTGAA TTTCAAAGAC CAAGCCAATG GTTTGTTTGG CACAAATCCT AATCGTTTGG TGATTTCGTT GCAGCCCGAT GAAACCGTAT CGCTCAAATT GTATGTGAAA CAAGTGGGCA GCGGCTTGGA CGTGCAGCCA ACCGAAATGG TGTTGGACAT GGGCACAGTG TCAGACGAAC GCCGCGCCGA AGCGTATGAA TTGCTGTTGC GCGAAGTGAT TGACGGACGT TTGAGCTTGT TCAATCGCCG CGACGAGCTG GAAAAAGCGT GGGAATGGGT CATGCCAATT TTGGATAACT GGGAGACTTC ACCTGTTGCA CCAGCCACTT ACGCTGCATC TAGCTGGGGG CCAAAAGAAG CGCAAG

Translation


          I  G  A  N  H  G  G  R  T  T  G  R  G  R  A  R  R  V  L  *  H  H  R  R  T  A  R  H  D  A  K  P  H  H   F1
           S  V  Q  I  T  V  A  E  Q  L  G  V  E  E  R  G  E  F  Y  D  I  T  G  A  L  R  D  M  M  Q  N  H  I     F2
            R  C  K  S  R  W  Q  N  N  W  A  W  K  S  A  A  S  F  M  T  S  Q  A  H  C  A  T  *  C  K  T  T  S    F3
        1 ATCGGTGCAAATCACGGTGGCAGAACAACTGGGCGTGGAAGAGCGCGGCGAGTTTTATGACATCACAGGCGCACTGCGCGACATGATGCAAAACCACATC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            A  N  A  V  F  C  G  N  G  T  T  Q  I  V  E  R  R  R  C  T  R  *  K  I  E  S  G  G  C  T  Q  T  D    F1
          M  Q  M  L  C  F  V  A  M  E  Q  P  K  S  L  S  A  D  D  V  R  D  E  K  L  K  V  V  A  A  L  K  P  M   F2
           C  K  C  C  V  L  W  Q  W  N  N  P  N  R  *  A  Q  T  M  Y  A  M  K  N  *  K  W  W  L  H  S  N  R     F3
      101 ATGCAAATGCTGTGTTTTGTGGCAATGGAACAACCCAAATCGTTGAGCGCAGACGATGTACGCGATGAAAAATTGAAAGTGGTGGCTGCACTCAAACCGA 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           D  F  G  R  C  G  *  K  R  D  S  R  T  I  C  G  K  R  R  A  K  R  L  F  A  R  T  Q  C  A  S  R  Q     F1
            T  L  A  D  V  D  K  N  V  I  R  A  Q  Y  V  A  N  G  E  Q  N  G  Y  L  Q  E  H  N  V  P  A  D  S    F2
          *  L  W  Q  M  W  I  K  T  *  F  A  H  N  M  W  Q  T  A  S  K  T  A  I  C  K  N  T  M  C  Q  P  T  A   F3
      201 TGACTTTGGCAGATGTGGATAAAAACGTGATTCGCGCACAATATGTGGCAAACGGCGAGCAAAACGGCTATTTGCAAGAACACAATGTGCCAGCCGACAG 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  Y  R  N  L  C  C  H  S  R  R  N  *  Y  A  T  L  G  R  R  A  V  L  F  A  Y  R  Q  T  L  G  N  A  H   F1
           R  T  E  T  Y  V  A  I  R  A  E  I  D  T  P  R  W  A  G  V  P  F  Y  L  R  T  G  K  R  L  A  T  R     F2
            V  P  K  P  M  L  P  F  A  P  K  L  I  R  H  V  G  Q  A  C  R  F  I  C  V  Q  A  N  A  W  Q  R  A    F3
      301 CCGTACCGAAACCTATGTTGCCATTCGCGCCGAAATTGATACGCCACGTTGGGCAGGCGTGCCGTTTTATTTGCGTACAGGCAAACGCTTGGCAACGCGC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            S  R  N  C  F  E  F  Q  R  P  S  Q  W  F  V  W  H  K  S  *  S  F  G  D  F  V  A  A  R  *  N  R  I    F1
          T  A  E  I  V  L  N  F  K  D  Q  A  N  G  L  F  G  T  N  P  N  R  L  V  I  S  L  Q  P  D  E  T  V  S   F2
           Q  Q  K  L  F  *  I  S  K  T  K  P  M  V  C  L  A  Q  I  L  I  V  W  *  F  R  C  S  P  M  K  P  Y     F3
      401 ACAGCAGAAATTGTTTTGAATTTCAAAGACCAAGCCAATGGTTTGTTTGGCACAAATCCTAATCGTTTGGTGATTTCGTTGCAGCCCGATGAAACCGTAT 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           A  Q  I  V  C  E  T  S  G  Q  R  L  G  R  A  A  N  R  N  G  V  G  H  G  H  S  V  R  R  T  P  R  R     F1
            L  K  L  Y  V  K  Q  V  G  S  G  L  D  V  Q  P  T  E  M  V  L  D  M  G  T  V  S  D  E  R  R  A  E    F2
          R  S  N  C  M  *  N  K  W  A  A  A  W  T  C  S  Q  P  K  W  C  W  T  W  A  Q  C  Q  T  N  A  A  P  K   F3
      501 CGCTCAAATTGTATGTGAAACAAGTGGGCAGCGGCTTGGACGTGCAGCCAACCGAAATGGTGTTGGACATGGGCACAGTGTCAGACGAACGCCGCGCCGA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          S  V  *  I  A  V  A  R  S  D  *  R  T  F  E  L  V  Q  S  P  R  R  A  G  K  S  V  G  M  G  H  A  N  F   F1
           A  Y  E  L  L  L  R  E  V  I  D  G  R  L  S  L  F  N  R  R  D  E  L  E  K  A  W  E  W  V  M  P  I     F2
            R  M  N  C  C  C  A  K  *  L  T  D  V  *  A  C  S  I  A  A  T  S  W  K  K  R  G  N  G  S  C  Q  F    F3
      601 AGCGTATGAATTGCTGTTGCGCGAAGTGATTGACGGACGTTTGAGCTTGTTCAATCGCCGCGACGAGCTGGAAAAAGCGTGGGAATGGGTCATGCCAATT 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  *  L  G  D  F  T  C  C  T  S  H  L  R  C  I  *  L  G  A  K  R  S  A  X                            F1
          L  D  N  W  E  T  S  P  V  A  P  A  T  Y  A  A  S  S  W  G  P  K  E  A  Q  X                           F2
           W  I  T  G  R  L  H  L  L  H  Q  P  L  T  L  H  L  A  G  G  Q  K  K  R  K                             F3
      701 TTGGATAACTGGGAGACTTCACCTGTTGCACCAGCCACTTACGCTGCATCTAGCTGGGGGCCAAAAGAAGCGCAAG 776
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