cpn60 (cpn60) allele sequence: id-158
Contig position
- sequence bin id
- 2918
- contig length
- 132577
- start
- 3898
- end
- 4200
- length
- 303
- orientation
- forward
- complete
- yes
Sequence
GGTTAAAGAA GTTGCTTCTA AAACCAATGA TGTGGCTGGC GACGGCACAA CCACCGCAAC CGTGTTGGCG CAAGCGATTG TTGCTGAAGG CATGAAATAC GTTACCGCAG GCATGAACCC TACCGATTTG AAACGCGGTA TTGACAAAGC AGTGGCGGCT TTGGTTGGCG AATTGGCAAA CATCGCGAAA CCTTGCGAAA CATACGAGCA AATCGCTCAA GTGGGCGCGA TTTCTGCGAA CTCTGACGAG CAAGTTGGCA AAATCATTGC AGACGCGATG CAAGAAGTCG GCAAAGAGGG CGTGATTACC GTTGAAGACG GCAAATCATT GGAAAACGAG TTGGAAGTGG TTAAAGGTAT GCAATTTGAC CGCGGCTACT TGTCACCTTA TTTTGTGAAT GATTTGGAAA AACAAATCGC TGGTTTGGAC AGCCCATTTG TGTTGTTGTT TGACAAAAAA ATCAGCAATA TCCGTGATTT GCTGCCCGTT TTGGAACAAG TGG
Translation
G * R S C F * N Q * C G W R R H N H R N R V G A S D C C * R H E I R F1
V K E V A S K T N D V A G D G T T T A T V L A Q A I V A E G M K Y F2
L K K L L L K P M M W L A T A Q P P Q P C W R K R L L L K A * N T F3
1 GGTTAAAGAAGTTGCTTCTAAAACCAATGATGTGGCTGGCGACGGCACAACCACCGCAACCGTGTTGGCGCAAGCGATTGTTGCTGAAGGCATGAAATAC 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
Y R R H E P Y R F E T R Y * Q S S G G F G W R I G K H R E T L R N F1
V T A G M N P T D L K R G I D K A V A A L V G E L A N I A K P C E T F2
L P Q A * T L P I * N A V L T K Q W R L W L A N W Q T S R N L A K F3
101 GTTACCGCAGGCATGAACCCTACCGATTTGAAACGCGGTATTGACAAAGCAGTGGCGGCTTTGGTTGGCGAATTGGCAAACATCGCGAAACCTTGCGAAA 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
I R A N R S S G R D F C E L * R A S W Q N H C R R D A R S R Q R G F1
Y E Q I A Q V G A I S A N S D E Q V G K I I A D A M Q E V G K E G F2
H T S K S L K W A R F L R T L T S K L A K S L Q T R C K K S A K R A F3
201 CATACGAGCAAATCGCTCAAGTGGGCGCGATTTCTGCGAACTCTGACGAGCAAGTTGGCAAAATCATTGCAGACGCGATGCAAGAAGTCGGCAAAGAGGG 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R D Y R * R R Q I I G K R V G S G * R Y A I * P R L L V T L F C E * F1
V I T V E D G K S L E N E L E V V K G M Q F D R G Y L S P Y F V N F2
* L P L K T A N H W K T S W K W L K V C N L T A A T C H L I L * M F3
301 CGTGATTACCGTTGAAGACGGCAAATCATTGGAAAACGAGTTGGAAGTGGTTAAAGGTATGCAATTTGACCGCGGCTACTTGTCACCTTATTTTGTGAAT 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
F G K T N R W F G Q P I C V V V * Q K N Q Q Y P * F A A R F G T S F1
D L E K Q I A G L D S P F V L L F D K K I S N I R D L L P V L E Q V F2
I W K N K S L V W T A H L C C C L T K K S A I S V I C C P F W N K F3
401 GATTTGGAAAAACAAATCGCTGGTTTGGACAGCCCATTTGTGTTGTTGTTTGACAAAAAAATCAGCAATATCCGTGATTTGCTGCCCGTTTTGGAACAAG 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G F1
X F2
W F3
501 TGG 503
---