abcZ (abcZ) allele sequence: id-155

Contig position

sequence bin id
2353
contig length
167202
start
107112
end
107564
length
453
orientation
reverse
complete
yes
Options

Sequence

CGGTCAAATC ATCGTGCAAA ACGGCATGAA AATTGTCTAT GTGCCGCAAG AAAGCGTGTT TGACGACCAA GCGAGCGTGT TTGATGTCGT GTCGCAGGGT TTGGGCGATT TGCGCGATGT GTTGCGCCGT TATCATCAGG TTAGCCACGC ACTAGAAACT CAGCATTCTG ATGATTTAAT TCGCCAACTC AATGAGTTAC AAAATGAAAT TGAATCGCAA GACGGCTGGC AGTTTGACGC GGCAATCCGC CAAACGATTA GTGAATTAGG GCTGCCTGAA AATGAATTGA TTAGCAATCT GTCGGGCGGT CAGAAAAAAC GCGTAGCGTT GGCGCAAGCG TGGGTGCAAA AACCCGATAT TTTGCTATTG GACGAACCGA CTAACCACTT GGATATTAAC GCGATTATTT GGCTGGAAAA TTTGTTGCAA GCGTTTTCAG GCAGCATGGT GGTGATTACG CACGACCGCC GTTTTTTGGA CAATATCGCC AATCGGATTG TGGAATTGGA TAGGGGCGTG TTGCGTTCGT ACGAGGGCAG TTTTAGCAAA TACAGCGAGA AAAAGGCGCA GGAATTGGCG GTTGAGGCGG AACACAATCG CCTGTTTGAC AAATTTCACG CACAGGAAGA AGTGTGGATT CGCAAAGGCA TTG

Translation


          R  S  N  H  R  A  K  R  H  E  N  C  L  C  A  A  R  K  R  V  *  R  P  S  E  R  V  *  C  R  V  A  G  F   F1
           G  Q  I  I  V  Q  N  G  M  K  I  V  Y  V  P  Q  E  S  V  F  D  D  Q  A  S  V  F  D  V  V  S  Q  G     F2
            V  K  S  S  C  K  T  A  *  K  L  S  M  C  R  K  K  A  C  L  T  T  K  R  A  C  L  M  S  C  R  R  V    F3
        1 CGGTCAAATCATCGTGCAAAACGGCATGAAAATTGTCTATGTGCCGCAAGAAAGCGTGTTTGACGACCAAGCGAGCGTGTTTGATGTCGTGTCGCAGGGT 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  R  F  A  R  C  V  A  P  L  S  S  G  *  P  R  T  R  N  S  A  F  *  *  F  N  S  P  T  Q  *  V  T    F1
          L  G  D  L  R  D  V  L  R  R  Y  H  Q  V  S  H  A  L  E  T  Q  H  S  D  D  L  I  R  Q  L  N  E  L  Q   F2
           W  A  I  C  A  M  C  C  A  V  I  I  R  L  A  T  H  *  K  L  S  I  L  M  I  *  F  A  N  S  M  S  Y     F3
      101 TTGGGCGATTTGCGCGATGTGTTGCGCCGTTATCATCAGGTTAGCCACGCACTAGAAACTCAGCATTCTGATGATTTAATTCGCCAACTCAATGAGTTAC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           K  *  N  *  I  A  R  R  L  A  V  *  R  G  N  P  P  N  D  *  *  I  R  A  A  *  K  *  I  D  *  Q  S     F1
            N  E  I  E  S  Q  D  G  W  Q  F  D  A  A  I  R  Q  T  I  S  E  L  G  L  P  E  N  E  L  I  S  N  L    F2
          K  M  K  L  N  R  K  T  A  G  S  L  T  R  Q  S  A  K  R  L  V  N  *  G  C  L  K  M  N  *  L  A  I  C   F3
      201 AAAATGAAATTGAATCGCAAGACGGCTGGCAGTTTGACGCGGCAATCCGCCAAACGATTAGTGAATTAGGGCTGCCTGAAAATGAATTGATTAGCAATCT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          V  G  R  S  E  K  T  R  S  V  G  A  S  V  G  A  K  T  R  Y  F  A  I  G  R  T  D  *  P  L  G  Y  *  R   F1
           S  G  G  Q  K  K  R  V  A  L  A  Q  A  W  V  Q  K  P  D  I  L  L  L  D  E  P  T  N  H  L  D  I  N     F2
            R  A  V  R  K  N  A  *  R  W  R  K  R  G  C  K  N  P  I  F  C  Y  W  T  N  R  L  T  T  W  I  L  T    F3
      301 GTCGGGCGGTCAGAAAAAACGCGTAGCGTTGGCGCAAGCGTGGGTGCAAAAACCCGATATTTTGCTATTGGACGAACCGACTAACCACTTGGATATTAAC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            D  Y  L  A  G  K  F  V  A  S  V  F  R  Q  H  G  G  D  Y  A  R  P  P  F  F  G  Q  Y  R  Q  S  D  C    F1
          A  I  I  W  L  E  N  L  L  Q  A  F  S  G  S  M  V  V  I  T  H  D  R  R  F  L  D  N  I  A  N  R  I  V   F2
           R  L  F  G  W  K  I  C  C  K  R  F  Q  A  A  W  W  *  L  R  T  T  A  V  F  W  T  I  S  P  I  G  L     F3
      401 GCGATTATTTGGCTGGAAAATTTGTTGCAAGCGTTTTCAGGCAGCATGGTGGTGATTACGCACGACCGCCGTTTTTTGGACAATATCGCCAATCGGATTG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  I  G  *  G  R  V  A  F  V  R  G  Q  F  *  Q  I  Q  R  E  K  G  A  G  I  G  G  *  G  G  T  Q  S     F1
            E  L  D  R  G  V  L  R  S  Y  E  G  S  F  S  K  Y  S  E  K  K  A  Q  E  L  A  V  E  A  E  H  N  R    F2
          W  N  W  I  G  A  C  C  V  R  T  R  A  V  L  A  N  T  A  R  K  R  R  R  N  W  R  L  R  R  N  T  I  A   F3
      501 TGGAATTGGATAGGGGCGTGTTGCGTTCGTACGAGGGCAGTTTTAGCAAATACAGCGAGAAAAAGGCGCAGGAATTGGCGGTTGAGGCGGAACACAATCG 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  V  *  Q  I  S  R  T  G  R  S  V  D  S  Q  R  H  X                                                   F1
           L  F  D  K  F  H  A  Q  E  E  V  W  I  R  K  G  I  X                                                  F2
            C  L  T  N  F  T  H  R  K  K  C  G  F  A  K  A  L                                                    F3
      601 CCTGTTTGACAAATTTCACGCACAGGAAGAAGTGTGGATTCGCAAAGGCATTG 653
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